Effective results for Achromobacter insuavis AXX-A (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 341
- Predicted by T4SEpre: 63
- Predicted by EffectiveELD: 22 eukaryotic-like domains, contained in 284 proteins (5 high, 279 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): (Type IV), Type VI

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
1003200.AXXA_28560(PF00126) (PF03466)mitochondrial
1003200.AXXA_27310(PF00126) (PF03466)mitochondrial; (mitochondrial)
1003200.AXXA_26955(PF00126) (PF03466)ER
1003200.AXXA_05923(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_28830(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_03889(PF00126) (PF03466)ER
1003200.AXXA_14014(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_07405(PF00126) (PF03466)ER
1003200.AXXA_08214(PF00126) (PF03466)mitochondrial; (mitochondrial)
1003200.AXXA_02365(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_20626(PF00126) (PF03466)mitochondrial; (plastid)
1003200.AXXA_21363(PF00126) (PF03466)(ER); ER
1003200.AXXA_11600(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_24065(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_05798(PF00126) (PF03466)mitochondrial
1003200.AXXA_07590(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_13254(PF00126) (PF03466)mitochondrial
1003200.AXXA_04898(PF00126) (PF03466)ER
1003200.AXXA_26090(PF00126) (PF03466)ER; (ER)
1003200.AXXA_06003(PF00126) (PF03466)mitochondrial
1003200.AXXA_05128(PF00126) (PF03466)(ER); ER
1003200.AXXA_02477(PF00126) (PF03466)(mitochondrial); (plastid)
1003200.AXXA_27695(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_29380(PF00126) (PF03466)(mitochondrial); (plastid)
1003200.AXXA_22005(PF00126) (PF03466)mitochondrial
1003200.AXXA_16901(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_13994(PF00126) (PF03466)mitochondrial; (mitochondrial)
1003200.AXXA_20778(PF00126) (PF03466)mitochondrial
1003200.AXXA_07325(PF00126) (PF03466)ER; (ER)
1003200.AXXA_25120(PF00126) (PF03466)(mitochondrial); (ER)
1003200.AXXA_15412(PF00126) (PF03466)ER
1003200.AXXA_26410(PF00126) (PF03466)(mitochondrial); (ER)
1003200.AXXA_18532(PF00126) (PF03466)mitochondrial; (mitochondrial)
1003200.AXXA_30822(PF00126) (PF03466)mitochondrial
1003200.AXXA_00295(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_05918(PF00126) (PF03466)mitochondrial
1003200.AXXA_28305(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_24745(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_06118(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_27705(PF00126) (PF03466)ER
1003200.AXXA_07063(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_21613(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_30922(PF00126) (PF03466)(mitochondrial); plastid
1003200.AXXA_06993(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_30347(PF00126) (PF03466)mitochondrial; (mitochondrial)
1003200.AXXA_25545(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_05843(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_25895(PF00126) (PF03466)mitochondrial; (mitochondrial)
1003200.AXXA_26935(PF00126) (PF03466)(mitochondrial); (plastid)
1003200.AXXA_02188(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_01793(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_23655+ER
1003200.AXXA_22070(PF00126) (PF03466)plastid
1003200.AXXA_17491(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_07780(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_24140(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_30087(PF07678)ER
1003200.AXXA_28875(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_24730(PF00126) (PF03466)(plastid)
1003200.AXXA_27735(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_02340+ER
1003200.AXXA_24505+ER
1003200.AXXA_15297(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_27770(PF09825)ER
1003200.AXXA_09333+ER
1003200.AXXA_08888(PF12399)ER
1003200.AXXA_30167+mitochondrial; (mitochondrial)
1003200.AXXA_25370(PF00126) (PF03466)(plastid)
1003200.AXXA_18411(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_09163(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_03189+ER
1003200.AXXA_22650+ER
1003200.AXXA_03239(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_15517(PF12399)ER
1003200.AXXA_26520+(mitochondrial)
1003200.AXXA_05483+ER
1003200.AXXA_16132(PF00701)ER; (ER)
1003200.AXXA_24935(PF00126) (PF03466)(plastid)
1003200.AXXA_12942(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_17166(PF12399)ER
1003200.AXXA_04833+ER
1003200.AXXA_12732(PF00126) (PF03466)plastid
1003200.AXXA_29250PF10712(mitochondrial)
1003200.AXXA_11386(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_30037(PF12399)(mitochondrial)
1003200.AXXA_01743(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_02907(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_20581(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_29982(PF00126) (PF03466)(plastid)
1003200.AXXA_24115(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_00935(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_13544(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_27725(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_08873(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_21588(PF00126) (PF03466)(plastid)
1003200.AXXA_05998(PF04199)ER
1003200.AXXA_06268PF06597(ER)
1003200.AXXA_26160+mitochondrial
1003200.AXXA_16047PF10712ER
1003200.AXXA_25010+ER
1003200.AXXA_26165(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_27560+ER
1003200.AXXA_20803(PF00126) (PF03466)plastid
1003200.AXXA_04413(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_11460+mitochondrial
1003200.AXXA_18462(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_05138+ER
1003200.AXXA_13229+mitochondrial
1003200.AXXA_12340(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_30192(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_21523+ER
1003200.AXXA_27390(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_25890+(ER); (mitochondrial)
1003200.AXXA_03619(PF00126) (PF03466)(plastid)
1003200.AXXA_11171+ER
1003200.AXXA_00855(PF12399)ER
1003200.AXXA_27350(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_24450+ER; (plastid)
1003200.AXXA_30007(PF00126) (PF03466)(ER)
1003200.AXXA_10645(PF00126) (PF03466)(mitochondrial)
1003200.AXXA_08084(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_04688(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_14398(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_02098(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_21793(PF07364) (PF07171)
1003200.AXXA_00465(PF00342)(plastid)
1003200.AXXA_24305(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_15197(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_27415(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_11890(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_23115(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_06763(PF07364) (PF07171)
1003200.AXXA_08613(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_18106+(mitochondrial)
1003200.AXXA_23775(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_28480(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_23150(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_16417(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_22140(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_28295(PF04775) (PF08840)
1003200.AXXA_07894(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_00905(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_17506(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_21623(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_08279(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_25455(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_11590(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_06183(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_14893(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_28185(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_12642(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_26115(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_27575(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_01683(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_05163(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_14543(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_23795(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_07914(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_30972(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_28210(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_20793(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_28680(PF04775) (PF08840)
1003200.AXXA_07735(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_24910(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_18457(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_02457(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_27870(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_02847(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_04873(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_28425(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_04658(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_28730(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_08923+(PF12399)
1003200.AXXA_26385(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_21573(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_07108(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_27835(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_12450(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_01410(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_23850(PF12399)(mitochondrial)
1003200.AXXA_15128(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_21123(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_06328(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_03087(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_21803(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_00415+(ER)
1003200.AXXA_14628(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_16442(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_21448(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_06793(PF07364) (PF07171)
1003200.AXXA_28650(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_06583(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_14348(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_02917(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_03709(PF12399)(plastid)
1003200.AXXA_00030(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_30652(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_04493(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_08858(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_10510(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_05358(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_25915(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_28840(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_18782(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_05033(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_08074(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_06263PF06597(plastid)
1003200.AXXA_11286(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_21653(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_19372(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_00890(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_26015(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_12812(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_25015(PF07364) (PF07171)
1003200.AXXA_07003(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_30712(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_28690(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_05338(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_05848(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_21313(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_04111(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_16297(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_15362(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_15502(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_10330(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_25195(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_02877(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_25500(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_05478(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_13759(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_14803(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_13949(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_15327(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_04848(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_04698(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_28260(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_23825(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_26705(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_17436(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_19022(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_21398(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_15462(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_30427(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_11920(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_22935(PF07364) (PF07171)
1003200.AXXA_03324+(mitochondrial)
1003200.AXXA_12460(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_30212(PF02615)(ER)
1003200.AXXA_08678(PF12399)(plastid)
1003200.AXXA_24455(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_15947(PF00126) (PF03466)
1003200.AXXA_04358(PF00126)
1003200.AXXA_31183(PF00701)
1003200.AXXA_27080+
1003200.AXXA_20531+
1003200.AXXA_04548(PF12399)
1003200.AXXA_03679(PF16155)
1003200.AXXA_28315(PF02615)
1003200.AXXA_29220(PF12399)
1003200.AXXA_22280+
1003200.AXXA_20596+
1003200.AXXA_06358(PF12399)
1003200.AXXA_12787(PF12399)
1003200.AXXA_26875+
1003200.AXXA_17666+
1003200.AXXA_21593(PF14832)
1003200.AXXA_18797+
1003200.AXXA_06258PF06597
1003200.AXXA_11900+
1003200.AXXA_09648(PF00701)
1003200.AXXA_10500+
1003200.AXXA_25670(PF00701)
1003200.AXXA_02345(PF00701)
1003200.AXXA_12862(PF02615)
1003200.AXXA_18361(PF04199)
1003200.AXXA_09938(PF12399)
1003200.AXXA_14174(PF05932)
1003200.AXXA_01355+
1003200.AXXA_21323+
1003200.AXXA_03479+
1003200.AXXA_19134+
1003200.AXXA_13394(PF12399)
1003200.AXXA_18882(PF12399)
1003200.AXXA_06238(PF00701)
1003200.AXXA_17036+
1003200.AXXA_15512(PF12399)
1003200.AXXA_03439+
1003200.AXXA_24915(PF02317)
1003200.AXXA_15537(PF04199)
1003200.AXXA_01155(PF00342)
1003200.AXXA_01848(PF00701)
1003200.AXXA_16307(PF00701)
1003200.AXXA_17741+
1003200.AXXA_09268+
1003200.AXXA_25295+
1003200.AXXA_27175+
1003200.AXXA_26360+
1003200.AXXA_31193(PF00701)not used
1003200.AXXA_14383(PF12399)
1003200.AXXA_14388(PF00701)
1003200.AXXA_28320(PF02615)not used
1003200.AXXA_12532+
1003200.AXXA_14024(PF05932)
1003200.AXXA_13839(PF12399)
1003200.AXXA_07989(PF04199)
1003200.AXXA_00355+
1003200.AXXA_26185(PF00701)
1003200.AXXA_11206(PF05932)
1003200.AXXA_11201(PF05932)
1003200.AXXA_00955+
1003200.AXXA_18151(PF04199)
1003200.AXXA_16547+
1003200.AXXA_08034(PF12399)
1003200.AXXA_17536+
1003200.AXXA_02547(PF00126)
1003200.AXXA_02767(PF12399)
1003200.AXXA_07103+
1003200.AXXA_24275(PF12399)
1003200.AXXA_15922+
1003200.AXXA_14089(PF07720)
1003200.AXXA_10545(PF03466)
1003200.AXXA_28410(PF04199)
1003200.AXXA_21483(PF04199)
1003200.AXXA_05438(PF00701)
1003200.AXXA_28695(PF00701)
1003200.AXXA_17216(PF12399)
1003200.AXXA_25990+
1003200.AXXA_11855+
1003200.AXXA_21503(PF00165)
1003200.AXXA_11196(PF05932)
1003200.AXXA_08778(PF02615)
1003200.AXXA_27805+
1003200.AXXA_23080+
1003200.AXXA_11480(PF11969)
1003200.AXXA_30792(PF02317)
1003200.AXXA_07859(PF12399)
1003200.AXXA_06668(PF00342)
1003200.AXXA_07670+
1003200.AXXA_28760(PF03466)
1003200.AXXA_19617+
1003200.AXXA_15617+

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
    Estimated copy number = 0.0 (0/10 KEGG proteins)
  • Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
    Estimated copy number = 1.0 (8/8 KEGG proteins)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================