Effective results for Mycobacterium sp. JLS (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 675
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 46 eukaryotic-like domains, contained in 675 proteins (2 high, 673 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
164757.Mjls_5486(PF02771) (PF02770) (PF00441)(mitochondrial)
164757.Mjls_0100(PF00441) (PF02770) (PF02771)(ER)
164757.Mjls_0192(PF06974) (PF03007)(ER)
164757.Mjls_4097(PF02771) (PF02770) (PF00441)(mitochondrial)
164757.Mjls_2153(PF00665) (PF13276)(mitochondrial)
164757.Mjls_0788(PF03007) (PF06974)(mitochondrial); (plastid)
164757.Mjls_5361(PF01083)ER
164757.Mjls_3206(PF00106)(mitochondrial)
164757.Mjls_3756(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_5569(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_4779(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_3696(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_0270(PF02470)ER
164757.Mjls_0271(PF02470)ER
164757.Mjls_0318(PF00296)(mitochondrial)
164757.Mjls_4169(PF02470)ER
164757.Mjls_4166(PF02470)ER
164757.Mjls_4167(PF02470)ER
164757.Mjls_4165(PF02470)ER
164757.Mjls_0860(PF00106)mitochondrial
164757.Mjls_2647(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_1737(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_3752(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_0109(PF02470)ER
164757.Mjls_1503(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_0840(PF02470)ER
164757.Mjls_4926(PF02470)ER
164757.Mjls_4153(PF00106)mitochondrial; (mitochondrial)
164757.Mjls_5060(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_4154(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_5655(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_1771(PF00743)(ER)
164757.Mjls_0089(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_0088(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_0882(PF00296)(ER)
164757.Mjls_1759(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_3211(PF00665) (PF13276)(ER)
164757.Mjls_2908(PF13577)ER; (ER)
164757.Mjls_1003(PF02770) (PF00441)(plastid)
164757.Mjls_5580(PF00890)(ER)
164757.Mjls_1016(PF01083)ER
164757.Mjls_4064(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_5005(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_4748(PF13772)mitochondrial; (mitochondrial)
164757.Mjls_4308(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_4022(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_1873(PF01083)(ER)
164757.Mjls_3342(PF06974) (PF03007)(ER)
164757.Mjls_4613(PF01790)ER
164757.Mjls_5255(PF13810)ER
164757.Mjls_2574(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_5080(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_1146(PF01083)mitochondrial
164757.Mjls_1740(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_0607(PF00067)(mitochondrial)
164757.Mjls_2557(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_1628(PF02470)ER
164757.Mjls_1629(PF02470)ER; (ER)
164757.Mjls_1598(PF00106)(mitochondrial)
164757.Mjls_1626(PF02405)mitochondrial; (mitochondrial)
164757.Mjls_1627(PF02470)ER
164757.Mjls_1625(PF02405)mitochondrial; (mitochondrial)
164757.Mjls_3197(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_3190(PF00665)mitochondrial
164757.Mjls_3193(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_0190(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_0196(PF01469)ER
164757.Mjls_2992(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_4190(PF02405)(ER)
164757.Mjls_0836(PF02470)ER
164757.Mjls_0837(PF02470)ER
164757.Mjls_0838(PF02470)(ER)
164757.Mjls_0839(PF02470)ER; (ER)
164757.Mjls_3407(PF13810)ER
164757.Mjls_5498(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_5571(PF12471)(mitochondrial)
164757.Mjls_2336(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_3684(PF02470)ER
164757.Mjls_3685(PF02405)mitochondrial
164757.Mjls_3682(PF02470)ER
164757.Mjls_3683(PF02470)ER
164757.Mjls_3680(PF02470)(ER)
164757.Mjls_3681(PF02470)ER
164757.Mjls_0302(PF00106)mitochondrial
164757.Mjls_3214(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_3747(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_5519(PF02470)mitochondrial; (ER)
164757.Mjls_0267(PF02470)ER
164757.Mjls_0266(PF02470)ER; (ER)
164757.Mjls_0269(PF02470)ER
164757.Mjls_0268(PF02470)ER
164757.Mjls_4170(PF02470)ER
164757.Mjls_4172(PF02405)mitochondrial
164757.Mjls_1723(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_1724(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_3763(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_3766(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_4184(PF02470)ER
164757.Mjls_4185(PF02470)ER
164757.Mjls_4187(PF02470)(ER)
164757.Mjls_4183(PF02470)ER
164757.Mjls_0113(PF02470)ER
164757.Mjls_0112(PF02470)ER
164757.Mjls_0111(PF02470)mitochondrial
164757.Mjls_0110(PF02470)ER
164757.Mjls_3398(PF01113)ER
164757.Mjls_1882(PF00106)(mitochondrial)
164757.Mjls_1880(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_1701(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_5393(PF01083)ER
164757.Mjls_1556(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_5078(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_4137(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_1769(PF00355)ER
164757.Mjls_4090(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_4096(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_1574(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_4872(PF00296)ER
164757.Mjls_5603(PF01083)(mitochondrial); mitochondrial
164757.Mjls_0171(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_4077(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_4685(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_4688(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_4997(PF02470)ER
164757.Mjls_4996(PF02470)(mitochondrial)
164757.Mjls_4995(PF02470)ER
164757.Mjls_4999(PF02470)ER
164757.Mjls_4998(PF02470)ER
164757.Mjls_0756(PF00106)(mitochondrial)
164757.Mjls_0030(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_4783(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_4715(PF00106)mitochondrial; (mitochondrial)
164757.Mjls_4378(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_4016(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_4014(PF00106)(mitochondrial)
164757.Mjls_4015(PF00106)(mitochondrial)
164757.Mjls_5402(PF01744)ER
164757.Mjls_3802(PF00106)mitochondrial; (mitochondrial)
164757.Mjls_3805(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_1090(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_2955(PF00067)mitochondrial; (mitochondrial)
164757.Mjls_3634(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_3192(PF00665)(mitochondrial)
164757.Mjls_5097(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_1179(PF13577)(ER)
164757.Mjls_2701(PF13810)ER
164757.Mjls_0399(PF13810)(ER)
164757.Mjls_1631(PF02470)ER
164757.Mjls_1630(PF02470)ER
164757.Mjls_1632(PF02470)ER
164757.Mjls_3679(PF02470)ER
164757.Mjls_4188(PF02470)ER
164757.Mjls_4189(PF02405)(mitochondrial)
164757.Mjls_4439(PF09995)(mitochondrial)
164757.Mjls_4228(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_1658(PF00106)ER; mitochondrial
164757.Mjls_0232(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_0355(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_1336(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_5302(PF00106)(mitochondrial)
164757.Mjls_0781(PF00067)mitochondrial; (mitochondrial)
164757.Mjls_4145(PF00441) (PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_4147(PF02771) (PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_3759(PF00848) (PF00355)
164757.Mjls_3697(PF02771) (PF00441)
164757.Mjls_0315(PF00106)(plastid)
164757.Mjls_0864(PF03007) (PF06974)
164757.Mjls_2648(PF00106)(plastid)
164757.Mjls_1508(PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_3715(PF00848) (PF00355)
164757.Mjls_4299(PF00378)(ER)
164757.Mjls_5061(PF02771) (PF00441)
164757.Mjls_4125(PF06974) (PF03007)
164757.Mjls_3730(PF00848) (PF00355)
164757.Mjls_4778(PF02771) (PF00441)
164757.Mjls_3947(PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_2013(PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_1758(PF00441) (PF02771)
164757.Mjls_2222(PF00665) (PF13276)
164757.Mjls_2228(PF00665) (PF13276)
164757.Mjls_2853(PF00665) (PF13276)
164757.Mjls_3512(PF00296)(plastid)
164757.Mjls_3204(PF00743)(ER)
164757.Mjls_1019(PF00106)(mitochondrial)
164757.Mjls_4063(PF00441) (PF02771)
164757.Mjls_2245(PF00665)(mitochondrial)
164757.Mjls_5215(PF00067)(plastid)
164757.Mjls_4588(PF00296)(plastid)
164757.Mjls_1068(PF00665) (PF13276)
164757.Mjls_1791(PF00106)(mitochondrial)
164757.Mjls_2573(PF02771) (PF00441)
164757.Mjls_3625(PF03007) (PF06974)
164757.Mjls_5082(PF02771) (PF00441)
164757.Mjls_5081(PF00441) (PF02771)
164757.Mjls_4637(PF03007) (PF06974)
164757.Mjls_1389(PF06974) (PF03007)
164757.Mjls_1407(PF00848) (PF00355)
164757.Mjls_3446(PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_1595(PF00848) (PF00355)
164757.Mjls_1621(PF00848) (PF00355)
164757.Mjls_4887(PF03007) (PF06974)
164757.Mjls_1647(PF00848) (PF00355)
164757.Mjls_3643(PF00106)(mitochondrial)
164757.Mjls_0203(PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_5006(PF02771) (PF00441)
164757.Mjls_4195(PF00848) (PF00355)
164757.Mjls_5553(PF00106)(plastid)
164757.Mjls_1660(PF00848) (PF00355)
164757.Mjls_5499(PF00441) (PF02771)
164757.Mjls_5570(PF02771) (PF00441)
164757.Mjls_3420(PF03007) (PF06974)
164757.Mjls_2337(PF00441) (PF02771)
164757.Mjls_2246(PF00665) (PF13276)
164757.Mjls_2243(PF00665) (PF13276)
164757.Mjls_0265(PF02405)(mitochondrial)
164757.Mjls_0262(PF00106)(mitochondrial)
164757.Mjls_4171(PF02405)(mitochondrial)
164757.Mjls_3769(PF06974) (PF03007)
164757.Mjls_2371(PF00665) (PF13276)
164757.Mjls_0739(PF09995)(mitochondrial)
164757.Mjls_4134(PF02771) (PF00441)
164757.Mjls_0894(PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_0895(PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_2498(PF00848) (PF00355)
164757.Mjls_3546(PF06974) (PF03007)
164757.Mjls_2233(PF00848) (PF00355)
164757.Mjls_2237(PF00848) (PF00355)
164757.Mjls_3723(PF00848) (PF00355)
164757.Mjls_1573(PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_5654(PF02771) (PF00441)
164757.Mjls_2000(PF00665) (PF13276)
164757.Mjls_4078(PF00296)(mitochondrial)
164757.Mjls_4071(PF00848) (PF00355)
164757.Mjls_3501(PF02770) (PF02771)
164757.Mjls_2863(PF00665) (PF13276)
164757.Mjls_4315(PF00106)(mitochondrial)
164757.Mjls_4787(PF00848) (PF00355)
164757.Mjls_2017(PF06974) (PF03007)
164757.Mjls_5679(PF01083)(mitochondrial)
164757.Mjls_2297(PF00355)(ER)
164757.Mjls_5461(PF03007) (PF06974)
164757.Mjls_4258(PF02770) (PF00441)
164757.Mjls_1617(PF00848) (PF00355)
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164757.Mjls_3787(PF00296)
164757.Mjls_3786(PF00106)
164757.Mjls_3780(PF13459)
164757.Mjls_3788(PF00890)
164757.Mjls_2519(PF00106)
164757.Mjls_0358(PF04072)
164757.Mjls_4314(PF06974)
164757.Mjls_4034(PF13459)
164757.Mjls_4033(PF00067)
164757.Mjls_4039(PF13452)
164757.Mjls_4782(PF00441)
164757.Mjls_4780(PF00378)
164757.Mjls_4785(PF00106)
164757.Mjls_3337(PF00296)
164757.Mjls_4812(PF00378)
164757.Mjls_3661(PF08354)
164757.Mjls_2887(PF00890)
164757.Mjls_1275(PF13772)
164757.Mjls_5046(PF13452)
164757.Mjls_0900(PF10604)
164757.Mjls_2016(PF04248)
164757.Mjls_5223(PF00296)
164757.Mjls_3106(PF10604)
164757.Mjls_5763(PF00106)
164757.Mjls_0469(PF00106)
164757.Mjls_0078(PF04072)
164757.Mjls_0079(PF04072)
164757.Mjls_4590(PF00067)
164757.Mjls_0678(PF09995)
164757.Mjls_1667(PF01527)
164757.Mjls_2568(PF01113)
164757.Mjls_2565(PF13622)
164757.Mjls_0587(PF00106)
164757.Mjls_3164(PF00106)
164757.Mjls_1988(PF13577)
164757.Mjls_5407(PF00355)
164757.Mjls_1155(PF06013)
164757.Mjls_1156(PF06013)
164757.Mjls_3801(PF00106)
164757.Mjls_3804(PF00378)
164757.Mjls_3806(PF00441)
164757.Mjls_1095(PF00296)
164757.Mjls_1094(PF00296)
164757.Mjls_1098(PF10604)
164757.Mjls_0948(PF13452)
164757.Mjls_0946(PF13452)
164757.Mjls_2768(PF00106)
164757.Mjls_2769(PF10604)
164757.Mjls_2765(PF02353)
164757.Mjls_0614(PF00665)
164757.Mjls_0615(PF00665)
164757.Mjls_0617(PF00743)
164757.Mjls_0610(PF00067)
164757.Mjls_5671(PF13459)
164757.Mjls_2569(PF00067)
164757.Mjls_2567(PF00296)
164757.Mjls_5467(PF04072)
164757.Mjls_5460(PF00355)
164757.Mjls_5462(PF04248)
164757.Mjls_5463(PF10604)
164757.Mjls_5094(PF02771)
164757.Mjls_1399(PF00106)
164757.Mjls_2154(PF01527)
164757.Mjls_3820(PF00067)
164757.Mjls_0420(PF00067)
164757.Mjls_1752(PF00378)
164757.Mjls_1754(PF00378)
164757.Mjls_1615(PF01527)
164757.Mjls_5282(PF01113)
164757.Mjls_1943(PF13577)
164757.Mjls_5703(PF13452)
164757.Mjls_1378(PF06013)
164757.Mjls_1379(PF06013)
164757.Mjls_4475(PF01790)
164757.Mjls_4476(PF08123)
164757.Mjls_4892(PF09995)
164757.Mjls_0984(PF00106)
164757.Mjls_2584(PF01527)
164757.Mjls_2582(PF00067)
164757.Mjls_3989(PF00106)
164757.Mjls_3676(PF00067)
164757.Mjls_3671(PF00378)
164757.Mjls_4452(PF13276)
164757.Mjls_4955(PF00067)
164757.Mjls_0357(PF09995)
164757.Mjls_5487(PF04248)
164757.Mjls_1562(PF10604)
164757.Mjls_0821(PF13020)
164757.Mjls_0826(PF13020)
164757.Mjls_1483(PF00067)
164757.Mjls_5301(PF13577)
164757.Mjls_3229(PF00067)
164757.Mjls_3224(PF00296)
164757.Mjls_3221(PF13452)
164757.Mjls_3223(PF13452)
164757.Mjls_4948(PF00067)
164757.Mjls_1746(PF00378)
164757.Mjls_1037(PF00067)
164757.Mjls_1036(PF00067)
164757.Mjls_5158(PF00296)
164757.Mjls_2090(PF01113)
164757.Mjls_2094(PF10604)
164757.Mjls_0782(PF02353)
164757.Mjls_0783(PF02353)
164757.Mjls_0334(PF00378)
164757.Mjls_4146(PF00441)
164757.Mjls_0804(PF06013)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================