Effective results for Verminephrobacter eiseniae EF01-2 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 369
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 24 eukaryotic-like domains, contained in 369 proteins (21 high, 348 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
391735.Veis_2874(PF12399) (PF02653)ER
391735.Veis_0610(PF12399) (PF02653)ER
391735.Veis_2026(PF13407)ER
391735.Veis_0539(PF02653)(mitochondrial)
391735.Veis_0289(PF12399) (PF02653)(mitochondrial)
391735.Veis_0063(PF13407)ER
391735.Veis_0060(PF13407)mitochondrial
391735.Veis_0064(PF13407)ER
391735.Veis_0857(PF13458)ER
391735.Veis_0859(PF02653)(ER)
391735.Veis_1581(PF02515)ER
391735.Veis_0291(PF13458)mitochondrial
391735.Veis_4608(PF02653)ER
391735.Veis_4609(PF02653)ER
391735.Veis_3210(PF02653)ER
391735.Veis_5005(PF02653)ER
391735.Veis_5004(PF02653)(mitochondrial)
391735.Veis_3992(PF14330)(mitochondrial)
391735.Veis_2133(PF13407)ER
391735.Veis_3775(PF02653)(ER)
391735.Veis_4610(PF13458)ER
391735.Veis_3209(PF02653)ER
391735.Veis_1906(PF02653)ER
391735.Veis_1904(PF13458)ER
391735.Veis_1905(PF02653)(ER)
391735.Veis_3836(PF13458)ER
391735.Veis_3838(PF02653)ER
391735.Veis_2121(PF02653)(mitochondrial)
391735.Veis_2122(PF02653)ER
391735.Veis_0897(PF02653)ER
391735.Veis_0896(PF02653)ER
391735.Veis_0895(PF13458)(ER)
391735.Veis_1685(PF13458)ER
391735.Veis_2799(PF13020)(mitochondrial)
391735.Veis_1045(PF13458)ER
391735.Veis_2660(PF13458)ER
391735.Veis_2668(PF13458)ER; (mitochondrial)
391735.Veis_0317(PF13458)ER
391735.Veis_3537(PF02653)ER
391735.Veis_2079(PF13407)ER; (mitochondrial)
391735.Veis_1675(PF13407)ER
391735.Veis_1677(PF02653)ER
391735.Veis_4096(PF02653)mitochondrial; (mitochondrial)
391735.Veis_4095(PF02653)ER; (ER)
391735.Veis_2672(PF13458)ER
391735.Veis_1521(PF02317)ER; (ER)
391735.Veis_1258(PF02515)(ER)
391735.Veis_4428(PF02653)ER
391735.Veis_4429(PF02653)(ER)
391735.Veis_1798(PF13458)ER
391735.Veis_1797(PF13458)ER
391735.Veis_1796(PF02653)ER
391735.Veis_1795(PF02653)ER
391735.Veis_1086(PF13407)ER
391735.Veis_2682(PF13407)ER
391735.Veis_1536(PF13407)ER
391735.Veis_1534(PF02653)(mitochondrial)
391735.Veis_0332(PF13458)ER
391735.Veis_0331(PF13458)ER
391735.Veis_2274(PF02515)ER; (ER)
391735.Veis_0290(PF02653)(ER)
391735.Veis_0328(PF02653)ER
391735.Veis_2875(PF02653)ER
391735.Veis_3000(PF02653)ER
391735.Veis_0916(PF13407)ER; (ER)
391735.Veis_0915(PF02653)ER
391735.Veis_4112(PF13458)ER
391735.Veis_0350(PF02653)ER
391735.Veis_4327(PF13407)(ER)
391735.Veis_1987(PF13458)ER
391735.Veis_2723(PF02653)ER
391735.Veis_2721(PF13458)ER
391735.Veis_4101(PF13458)ER
391735.Veis_4100(PF13458)ER
391735.Veis_4109(PF02653)ER
391735.Veis_4108(PF02653)ER
391735.Veis_0160(PF02653)(ER)
391735.Veis_1364(PF02653)ER
391735.Veis_1365(PF13458)ER
391735.Veis_4075(PF13458)ER
391735.Veis_4077(PF02653)ER
391735.Veis_4076(PF02653)ER
391735.Veis_3291(PF13407)ER; (ER)
391735.Veis_4469(PF02653)ER
391735.Veis_4919(PF13458)ER
391735.Veis_4914(PF13458)ER
391735.Veis_3847(PF08352)(ER)
391735.Veis_1991(PF02653)ER
391735.Veis_1990(PF02653)ER
391735.Veis_2711(PF13407)(ER)
391735.Veis_3597(PF02653)(mitochondrial)
391735.Veis_3598(PF13407)(mitochondrial)
391735.Veis_0159(PF13458)ER
391735.Veis_4471(PF13458)ER
391735.Veis_4909(PF02653)(ER)
391735.Veis_4908(PF02653)(ER); ER
391735.Veis_4876(PF13458)(ER); ER
391735.Veis_4496(PF08352)(mitochondrial)
391735.Veis_4013(PF13458)ER
391735.Veis_4012(PF02653)ER
391735.Veis_4820(PF02653)ER
391735.Veis_4701(PF02653)ER
391735.Veis_4700(PF02653)ER
391735.Veis_3430(PF13407)ER
391735.Veis_4648(PF02653)ER
391735.Veis_4646(PF13458)ER
391735.Veis_4802(PF03972)(mitochondrial)
391735.Veis_3952(PF02653)ER; (ER)
391735.Veis_3951(PF13458)ER
391735.Veis_0550(PF13458)ER
391735.Veis_3734(PF08843)(ER)
391735.Veis_0737(PF13407)ER
391735.Veis_0045(PF13407)ER
391735.Veis_0046(PF02653)ER
391735.Veis_4210(PF02653)(ER); ER
391735.Veis_4819(PF12399)(mitochondrial)
391735.Veis_0837(PF02653)ER
391735.Veis_0838(PF02653)ER
391735.Veis_0540(PF13407)ER
391735.Veis_0542(PF13407)ER
391735.Veis_0721(PF04324)(mitochondrial)
391735.Veis_3417(PF02653)ER
391735.Veis_3419(PF13407)(ER)
391735.Veis_0054(PF13407)ER
391735.Veis_0612(PF13458)ER
391735.Veis_4822(PF13458)mitochondrial; (mitochondrial)
391735.Veis_1954(PF02653)ER
391735.Veis_1957(PF13458)(mitochondrial)
391735.Veis_1959(PF13458)(mitochondrial)
391735.Veis_3885(PF08352)(mitochondrial)
391735.Veis_1480(PF13407)ER
391735.Veis_2118(PF13407)mitochondrial
391735.Veis_2119(PF13407)mitochondrial
391735.Veis_2023(PF02653)(plastid)
391735.Veis_3360PF13565 (PF13358)
391735.Veis_2633PF13565 (PF13358)
391735.Veis_1735(PF02515)plastid
391735.Veis_1478(PF02653)(mitochondrial)
391735.Veis_3236(PF02515)(ER)
391735.Veis_4886PF13565 (PF13358)
391735.Veis_1873(PF12399)(mitochondrial)
391735.Veis_1870(PF13458)(mitochondrial)
391735.Veis_2481PF13565 (PF13358)
391735.Veis_3535PF03088 (PF02653)
391735.Veis_0138(PF08352)(plastid)
391735.Veis_2326PF13565 (PF13358)
391735.Veis_2045(PF02653)(plastid)
391735.Veis_1402PF13565 (PF13358)
391735.Veis_0935(PF08352)(ER)
391735.Veis_0114(PF08352)(mitochondrial)
391735.Veis_0326(PF02653)(ER)
391735.Veis_3273(PF02653)(ER)
391735.Veis_3318(PF03972)(ER)
391735.Veis_4330(PF02653)(ER)
391735.Veis_4209(PF02653)(mitochondrial)
391735.Veis_3269(PF13407)(mitochondrial)
391735.Veis_3858PF13565 (PF13358)
391735.Veis_0161(PF02653)(ER)
391735.Veis_1363(PF02653)(mitochondrial)
391735.Veis_3292PF03088 (PF02653)
391735.Veis_3846PF13565 (PF13358)
391735.Veis_3595(PF02653)plastid
391735.Veis_2523PF13565 (PF13358)
391735.Veis_2522PF13565 (PF13358)
391735.Veis_4275PF13565 (PF13358)
391735.Veis_3615(PF02515)(mitochondrial)
391735.Veis_1142(PF13358)(ER)
391735.Veis_3953(PF12399) (PF02653)
391735.Veis_0549(PF13458)(ER)
391735.Veis_1135(PF02515)
391735.Veis_2024(PF02653)
391735.Veis_0281(PF05598)
391735.Veis_0284(PF02371)
391735.Veis_4634PF13565
391735.Veis_3185(PF02371)
391735.Veis_0858(PF02371)
391735.Veis_2742(PF04324)
391735.Veis_1585(PF03972)
391735.Veis_0529(PF08352)
391735.Veis_0294(PF02515)
391735.Veis_4293(PF08352)
391735.Veis_4294(PF08352)
391735.Veis_0292(PF02371)
391735.Veis_4601(PF02371)
391735.Veis_4607(PF12399)
391735.Veis_3504(PF02515)
391735.Veis_0860(PF12399)
391735.Veis_1852(PF13407)
391735.Veis_3993(PF07287)
391735.Veis_2131(PF02653)
391735.Veis_4636(PF02515)
391735.Veis_4191(PF02515)
391735.Veis_2005(PF08352)
391735.Veis_0880(PF02515)
391735.Veis_0885(PF13407)
391735.Veis_0886(PF02653)
391735.Veis_0888(PF02653)
391735.Veis_4179(PF02371)
391735.Veis_4617(PF02515)
391735.Veis_4503PF13565
391735.Veis_3208(PF12399)
391735.Veis_1907(PF12399)
391735.Veis_3834(PF12399)
391735.Veis_3837(PF02653)
391735.Veis_4188(PF07287)
391735.Veis_1056(PF02371)
391735.Veis_0508(PF05598)
391735.Veis_3748PF13565
391735.Veis_0898(PF12399)
391735.Veis_0651(PF03972)
391735.Veis_3691(PF08843)
391735.Veis_4407(PF02371)
391735.Veis_1872(PF02653)
391735.Veis_1871(PF02653)
391735.Veis_2489(PF13358)
391735.Veis_2484(PF13358)
391735.Veis_2061(PF08352)
391735.Veis_2062(PF08352)
391735.Veis_0407(PF03972)
391735.Veis_0221(PF02515)
391735.Veis_0315(PF12399)
391735.Veis_3534PF03088
391735.Veis_3536(PF13407)
391735.Veis_0137(PF08352)
391735.Veis_3327(PF08352)
391735.Veis_3328(PF08352)
391735.Veis_4969(PF04412)
391735.Veis_4968(PF01989)
391735.Veis_4963(PF08352)
391735.Veis_4962(PF08352)
391735.Veis_1864(PF08352)
391735.Veis_1863(PF08352)
391735.Veis_2329(PF13358)
391735.Veis_3811(PF08352)
391735.Veis_2252(PF03972)
391735.Veis_2499(PF02515)
391735.Veis_1786(PF05598)
391735.Veis_1678(PF04324)
391735.Veis_2077(PF02653)
391735.Veis_1676(PF02653)
391735.Veis_4097(PF12399)
391735.Veis_1419(PF08843)
391735.Veis_1417(PF13358)
391735.Veis_0412(PF08352)
391735.Veis_0419(PF08352)
391735.Veis_0418(PF08352)
391735.Veis_0238(PF02515)
391735.Veis_0237(PF02515)
391735.Veis_0125(PF13358)
391735.Veis_3339(PF06414)
391735.Veis_3800(PF02371)
391735.Veis_1794(PF12399)
391735.Veis_2044(PF13407)
391735.Veis_1087(PF02653)
391735.Veis_2687(PF02653)
391735.Veis_0428(PF02515)
391735.Veis_0936(PF08352)
391735.Veis_1533(PF02653)
391735.Veis_0330(PF12399)
391735.Veis_0113(PF08352)
391735.Veis_0751(PF08352)
391735.Veis_0754(PF04324)
391735.Veis_4435PF13565
391735.Veis_2057(PF02515)
391735.Veis_2693(PF13358)
391735.Veis_2690(PF08843)
391735.Veis_1434(PF13358)
391735.Veis_0433(PF02515)
391735.Veis_4127(PF02371)
391735.Veis_0105(PF05598)
391735.Veis_0218(PF02515)
391735.Veis_3001(PF02653)
391735.Veis_4590(PF08352)
391735.Veis_4251(PF08352)
391735.Veis_2195PF02736
391735.Veis_3863(PF02515)
391735.Veis_2206(PF02515)
391735.Veis_2200(PF13358)
391735.Veis_4208(PF12399)
391735.Veis_4200(PF02371)
391735.Veis_4110(PF12399)
391735.Veis_4117(PF08352)
391735.Veis_4118(PF08352)
391735.Veis_0351(PF02653)
391735.Veis_0352(PF12399)
391735.Veis_2844(PF08843)
391735.Veis_4064(PF05598)
391735.Veis_2999(PF12399)
391735.Veis_4699(PF13458)
391735.Veis_3077(PF04324)
391735.Veis_3109(PF13358)
391735.Veis_2213(PF02371)
391735.Veis_4328(PF13407)
391735.Veis_4326(PF02653)
391735.Veis_1989(PF12399)
391735.Veis_2722(PF02653)
391735.Veis_2724(PF12399)
391735.Veis_3679(PF05598)
391735.Veis_1298(PF08352)
391735.Veis_1297(PF08352)
391735.Veis_1563(PF02317)
391735.Veis_2854(PF06414)
391735.Veis_0162(PF12399)
391735.Veis_1362(PF12399)
391735.Veis_4073(PF12399)
391735.Veis_3290(PF02653)
391735.Veis_3293PF03088
391735.Veis_0206(PF04324)
391735.Veis_3844(PF13358)
391735.Veis_3843(PF05598)
391735.Veis_3849(PF08352)
391735.Veis_3848(PF02371)
391735.Veis_0974(PF02371)
391735.Veis_2712(PF02653)
391735.Veis_4268(PF03972)
391735.Veis_4269(PF02515)
391735.Veis_0577(PF12399)
391735.Veis_1283(PF05598)
391735.Veis_3593(PF02515)
391735.Veis_1377(PF05598)
391735.Veis_0717(PF08843)
391735.Veis_4477(PF02371)
391735.Veis_4470(PF02653)
391735.Veis_4907(PF12399)
391735.Veis_4900(PF13910)
391735.Veis_3050(PF02515)
391735.Veis_2239(PF08352)
391735.Veis_2238(PF08352)
391735.Veis_2524(PF02371)
391735.Veis_4270(PF02515)
391735.Veis_2416(PF07287)
391735.Veis_0816(PF08352)
391735.Veis_0815(PF08352)
391735.Veis_4011(PF02653)
391735.Veis_4010(PF12399)
391735.Veis_3431(PF02653)
391735.Veis_3543(PF02371)
391735.Veis_4649(PF12399)
391735.Veis_4647(PF02653)
391735.Veis_4641(PF05598)
391735.Veis_4805(PF02515)
391735.Veis_3135(PF05598)
391735.Veis_2555(PF01989)
391735.Veis_2556(PF04412)
391735.Veis_1971(PF08352)
391735.Veis_0736(PF13407)
391735.Veis_0739(PF02653)
391735.Veis_0609(PF12399)
391735.Veis_0519(PF02371)
391735.Veis_4731(PF08352)
391735.Veis_3426(PF08352)
391735.Veis_3425(PF08352)
391735.Veis_4211(PF13458)
391735.Veis_1808(PF02515)
391735.Veis_2766(PF13020)
391735.Veis_2763(PF02371)
391735.Veis_0543(PF02371)
391735.Veis_0059(PF02653)
391735.Veis_0055(PF02653)
391735.Veis_0611(PF02653)
391735.Veis_4725(PF08352)
391735.Veis_4727PF15508
391735.Veis_4532(PF02371)
391735.Veis_4821(PF02653)
391735.Veis_1953(PF02653)
391735.Veis_3886(PF08352)
391735.Veis_2593(PF04324)
391735.Veis_2595(PF04324)
391735.Veis_2111(PF07287)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================