Effective results for Oligotropha carboxidovorans OM5 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 1007
- Predicted by T4SEpre: 206
- Predicted by EffectiveELD: 259 eukaryotic-like domains, contained in 843 proteins (60 high, 783 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): Type IV

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
504832.OCAR_5663(PF04561) (PF10385) (PF04565) (PF00562) (PF04563) (PF04560)
504832.OCA5_c23420(PF04561) (PF10385) (PF04565) (PF00562) (PF04563) (PF04560)
504832.OCA5_c23410(PF04998) (PF04983) (PF04997) (PF05000) (PF00623)
504832.OCA5_c05170(PF07731) (PF14342) (PF07732)ER
504832.OCAR_6181(PF07731) (PF07732) (PF00394)mitochondrial
504832.OCA5_c18490(PF07731) (PF07732) (PF00394)mitochondrial
504832.OCAR_5665(PF04998) (PF04983) (PF04997) (PF05000) (PF00623)
504832.OCAR_7625(PF07731) (PF14342) (PF07732)ER
504832.OCA5_c25170(PF07731) (PF07732)ER; (ER)
504832.OCAR_7388(PF13241) (PF14824)ER; (ER)
504832.OCA5_c00320(PF02777) (PF00081)mitochondrial
504832.OCA5_c32530+(PF00430)ER
504832.OCAR_4508(PF11987) (PF00009)(mitochondrial)
504832.OCAR_4502(PF02777) (PF00081)mitochondrial
504832.OCA5_c30670(PF00702) (PF00122)mitochondrial
504832.OCA5_c28810(PF00224) (PF02887)mitochondrial
504832.OCA5_c13360(PF13607) (PF02629)(mitochondrial); mitochondrial
504832.OCA5_c21140(PF07731) (PF00394)mitochondrial
504832.OCAR_6736(PF13607) (PF02629)(mitochondrial); mitochondrial
504832.OCA5_c23460(PF00298) (PF03946)(mitochondrial)
504832.OCA5_c29260(PF00702) (PF00122)ER
504832.OCA5_c07330(PF13241) (PF14824)ER; (ER)
504832.OCAR_5033(PF00702) (PF00122)ER
504832.OCA5_c05100(PF07731) (PF07732)mitochondrial; (mitochondrial)
504832.OCAR_4697+(PF00430)ER
504832.OCA5_c17340(PF06418) (PF00117)(mitochondrial)
504832.OCAR_5083(PF00224) (PF02887)mitochondrial
504832.OCAR_6300(PF06418) (PF00117)(mitochondrial)
504832.OCAR_5659(PF00298) (PF03946)(mitochondrial)
504832.OCAR_5903(PF07731) (PF00394)mitochondrial
504832.OCAR_4390(PF04280)ER
504832.OCA5_c01410(PF04280)ER
504832.OCAR_4024(PF00873)ER
504832.OCAR_4028(PF01758)ER
504832.OCA5_c05250(PF00873)ER
504832.OCA5_c16710(PF09991)ER
504832.OCA5_c13530(PF03453) (PF00994)(ER)
504832.OCAR_4562+ER
504832.OCAR_4566(PF08534)ER
504832.OCA5_c17270(PF03453) (PF00994) (PF03454)
504832.OCAR_5809+mitochondrial
504832.OCAR_4543(PF10531)ER
504832.OCAR_7563(PF13975)ER
504832.OCA5_c23350(PF00164)(mitochondrial)
504832.OCA5_c01450(PF02545)mitochondrial
504832.OCA5_c00910(PF00453)(mitochondrial)
504832.OCAR_4998(PF01970)(ER)
504832.OCA5_c13570(PF03453) (PF00994) (PF03454)
504832.OCAR_4527(PF03023)ER; (ER)
504832.OCAR_4521(PF00919)(mitochondrial)
504832.OCA5_c07110+(ER); (mitochondrial)
504832.OCA5_c17230(PF05071)(mitochondrial); mitochondrial
504832.OCAR_7777(PF00873)ER
504832.OCAR_7778(PF07731) (PF07732) (PF00394)
504832.OCAR_4080+ER
504832.OCAR_4501+mitochondrial; (mitochondrial)
504832.OCAR_4503(PF01138) (PF03726) (PF03725)
504832.OCAR_5270(PF13502)(ER); ER
504832.OCAR_7520(PF00403) (PF00702) (PF00122)
504832.OCAR_4871(PF00873)ER
504832.OCA5_c22040+ER
504832.OCA5_c23930(PF05257)ER
504832.OCA5_c19630(PF00873)(ER)
504832.OCAR_7756(PF01545)ER
504832.OCA5_c24600(PF14216)mitochondrial; (mitochondrial)
504832.OCA5_c26350(PF03023)(mitochondrial)
504832.OCAR_6786(PF01925)ER
504832.OCA5_c06370+ER
504832.OCAR_5417+(mitochondrial)
504832.OCAR_6448(PF10502)ER
504832.OCAR_4339(PF01019)ER
504832.OCA5_c27020(PF13502)ER
504832.OCAR_4680PF14295mitochondrial
504832.OCA5_c14060(PF00839)ER
504832.OCAR_4741(PF00873)ER; (ER)
504832.OCA5_c00760+mitochondrial; (ER)
504832.OCA5_c23270(PF03947) (PF00181)(mitochondrial)
504832.OCA5_c23090+(mitochondrial)
504832.OCA5_c17180(PF00873)ER
504832.OCAR_5746(PF01019)(mitochondrial)
504832.OCA5_c13810(PF01970)ER
504832.OCAR_7580(PF03144) (PF06421) (PF00009)
504832.OCAR_6187(PF01545)ER
504832.OCAR_6185(PF00873)ER
504832.OCAR_7449(PF00873)ER
504832.OCA5_c05090+(mitochondrial)
504832.OCA5_c00040(PF02463)(mitochondrial)
504832.OCA5_c08770+(ER)
504832.OCA5_c17660+ER
504832.OCA5_c33820+ER
504832.OCA5_c12900(PF01925)ER
504832.OCA5_c31750(PF05257)ER
504832.OCA5_c03150(PF10502)ER
504832.OCA5_c22360+ER; (ER)
504832.OCAR_6610(PF01541)mitochondrial
504832.OCAR_7632(PF07731) (PF07732)(plastid)
504832.OCAR_7633+(mitochondrial)
504832.OCA5_c01880(PF01019)ER
504832.OCA5_c23190(PF17136)(mitochondrial)
504832.OCAR_7094+ER
504832.OCA5_c07480+mitochondrial
504832.OCAR_5496(PF00060)ER
504832.OCAR_4722+ER
504832.OCAR_6373(PF09991)ER
504832.OCAR_6375+ER
504832.OCA5_c14340+ER
504832.OCAR_7408+ER
504832.OCAR_4268(PF00886)(mitochondrial)
504832.OCAR_4269(PF01782)(mitochondrial)
504832.OCAR_6631+ER
504832.OCAR_4457+ER
504832.OCAR_6962(PF01925)ER
504832.OCA5_c08660(PF07732)(ER); (mitochondrial)
504832.OCAR_6031+mitochondrial
504832.OCA5_c11260(PF01925)ER
504832.OCAR_5114(PF13502)ER
504832.OCA5_c31930(PF08534)(ER)
504832.OCA5_c08580+(mitochondrial)
504832.OCA5_c17330(PF03840)ER
504832.OCA5_c33990(PF10531)ER
504832.OCAR_7237+mitochondrial
504832.OCAR_6485(PF00873)ER
504832.OCA5_c32170(PF02545)mitochondrial
504832.OCAR_5681(PF00203)mitochondrial; (mitochondrial)
504832.OCAR_5680(PF03947) (PF00181)(mitochondrial)
504832.OCAR_5683PF00189 (PF07650)(mitochondrial)
504832.OCAR_5688(PF17136)(mitochondrial)
504832.OCA5_c25420(PF01925)ER
504832.OCA5_c20340+(ER)
504832.OCA5_c05010(PF10502)ER
504832.OCAR_6319(PF00873)ER
504832.OCAR_6312(PF05071)ER
504832.OCA5_c04840(PF00873)ER
504832.OCAR_5660PF00687(mitochondrial)
504832.OCA5_c05850(PF01970)(ER)
504832.OCA5_c12840(PF01970)ER
504832.OCAR_5341(PF03023)(mitochondrial)
504832.OCA5_c20860(PF01059)ER
504832.OCA5_c03980+ER
504832.OCA5_c32280+ER
504832.OCA5_c17140(PF00873)ER
504832.OCA5_c06830(PF00873)ER
504832.OCA5_c12280+ER
504832.OCAR_4064(PF01970)(ER)
504832.OCAR_4019(PF00403) (PF00702) (PF00122)
504832.OCAR_6716(PF03453) (PF00994) (PF03454)
504832.OCAR_6717(PF03453) (PF00994)(ER)
504832.OCAR_6713(PF03453) (PF00994) (PF03454)
504832.OCA5_c11660(PF01925)ER
504832.OCAR_6521+ER
504832.OCA5_c16130(PF00403) (PF00702) (PF00122)
504832.OCAR_4387(PF01121)(mitochondrial)
504832.OCAR_4386(PF02545)mitochondrial
504832.OCA5_c00310(PF01138) (PF03726) (PF03725)
504832.OCA5_c05790(PF13975)ER
504832.OCAR_6898+ER
504832.OCAR_6092+(mitochondrial)
504832.OCA5_c18430(PF01545)ER
504832.OCAR_5605(PF05257)ER
504832.OCAR_7555(PF01970)(ER)
504832.OCAR_4828(PF01343)(mitochondrial)
504832.OCAR_6544(PF13975)ER
504832.OCA5_c25760(PF04280)ER
504832.OCA5_c00330+mitochondrial; (mitochondrial)
504832.OCAR_4056(PF00565)mitochondrial
504832.OCAR_5830+(mitochondrial)
504832.OCA5_c06190(PF00403) (PF00702) (PF00122)
504832.OCAR_4534(PF02463)(mitochondrial)
504832.OCAR_4286(PF01925)ER
504832.OCA5_c00450(PF04127)mitochondrial; (mitochondrial)
504832.OCAR_6116(PF10531)ER
504832.OCA5_c26240+ER
504832.OCA5_c19820(PF04800)(mitochondrial)
504832.OCA5_c04900(PF11918)ER; (ER)
504832.OCA5_c10050+ER
504832.OCAR_7767(PF00403)ER
504832.OCAR_7762(PF00403) (PF00702) (PF00122)
504832.OCA5_c01440(PF01121)(mitochondrial)
504832.OCA5_c19120(PF10531)ER
504832.OCA5_c07440+ER
504832.OCAR_7377+ER
504832.OCAR_5203(PF01970)(ER)
504832.OCA5_c25230+(mitochondrial); plastid
504832.OCA5_c12570(PF00873)ER; (ER)
504832.OCAR_5444(PF01925)ER
504832.OCA5_c04290+ER
504832.OCAR_7748(PF01758)ER
504832.OCA5_c09600(PF00403) (PF00702) (PF00122)
504832.OCA5_c18450(PF00873)ER
504832.OCAR_5873(PF03981)(mitochondrial)
504832.OCAR_4981+mitochondrial; (mitochondrial)
504832.OCA5_c13540(PF03453) (PF00994) (PF03454)
504832.OCAR_6792(PF01970)ER
504832.OCAR_7688(PF00565)ER
504832.OCA5_c13840(PF00873)ER
504832.OCA5_c11190(PF01019)mitochondrial; (mitochondrial)
504832.OCAR_5468(PF07732)(ER)
504832.OCAR_5464+(mitochondrial); plastid
504832.OCAR_6818(PF00873)ER; (ER)
504832.OCAR_6266+ER
504832.OCAR_4113+ER
504832.OCAR_4118+ER
504832.OCA5_c13860+(mitochondrial)
504832.OCAR_5402(PF04280)ER
504832.OCAR_4751(PF04588)ER
504832.OCAR_4759(PF08534)ER
504832.OCAR_6873(PF01970)ER
504832.OCA5_c07200+ER
504832.OCA5_c19360+(mitochondrial)
504832.OCAR_6203(PF08755)(mitochondrial)
504832.OCAR_4778(PF05257)ER
504832.OCAR_6436(PF00403) (PF00702) (PF00122)
504832.OCAR_6850+ER
504832.OCA5_c23260(PF00203)mitochondrial; (mitochondrial)
504832.OCA5_c15170(PF13975)ER
504832.OCA5_c23080PF00416(mitochondrial)
504832.OCAR_7499+ER
504832.OCA5_c02490(PF01746)ER; (ER)
504832.OCA5_c16010(PF10502)ER
504832.OCA5_c04790(PF01758)ER
504832.OCAR_4489(PF04127)mitochondrial; (mitochondrial)
504832.OCAR_7420+(ER); (mitochondrial)
504832.OCAR_5994(PF13502)(ER); ER
504832.OCAR_5990+(ER)
504832.OCA5_c18280(PF08755)(mitochondrial)
504832.OCA5_c32090(PF00873)ER; (ER)
504832.OCA5_c27790+ER
504832.OCA5_c12060(PF01970)ER
504832.OCA5_c04420(PF01970)(ER)
504832.OCA5_c23240PF00189 (PF07650)(mitochondrial)
504832.OCA5_c30800(PF00873)ER
504832.OCAR_5773+ER; (ER)
504832.OCA5_c30110(PF01925)ER
504832.OCA5_c25000(PF04343)(mitochondrial)
504832.OCAR_4733(PF02545)mitochondrial
504832.OCA5_c02510(PF00886)(mitochondrial)
504832.OCAR_5127(PF01925)ER
504832.OCAR_7144(PF00403) (PF00702) (PF00122)
504832.OCAR_7414+(mitochondrial)
504832.OCA5_c29600(PF01970)(ER)
504832.OCAR_4945(PF01925)ER; (ER)
504832.OCA5_c32680PF14295mitochondrial
504832.OCA5_c05630(PF03144) (PF06421) (PF00009)
504832.OCAR_4449+(mitochondrial); (plastid)
504832.OCAR_4440(PF00453)(mitochondrial)
504832.OCAR_6970(PF01019)mitochondrial; (mitochondrial)
504832.OCA5_c28390(PF01925)ER
504832.OCAR_4199(PF10502)ER
504832.OCAR_4195+ER
504832.OCA5_c11830+ER
504832.OCAR_4270(PF01746)ER
504832.OCA5_c25630+(mitochondrial)
504832.OCA5_c22620(PF01019)(mitochondrial)
504832.OCA5_c32000(PF04588)ER
504832.OCA5_c21450(PF03981)(mitochondrial)
504832.OCA5_c15690(PF00873)ER
504832.OCA5_c23140PF00861mitochondrial
504832.OCAR_6917(PF01925)ER
504832.OCAR_6919+mitochondrial
504832.OCAR_5935(PF01059)ER
504832.OCA5_c03930+ER
504832.OCA5_c33780(PF08534)ER
504832.OCAR_5693PF00861mitochondrial
504832.OCAR_5698+(mitochondrial)
504832.OCAR_5699PF00416mitochondrial
504832.OCA5_c23510+(ER)
504832.OCA5_c27650(PF01970)(ER)
504832.OCAR_6662(PF00839)ER
504832.OCA5_c02860(PF01758)ER
504832.OCAR_6064(PF00873)(ER)
504832.OCAR_6323(PF00873)ER
504832.OCAR_5672(PF00164)(mitochondrial)
504832.OCAR_4230(PF01758)ER
504832.OCA5_c02500(PF01782)(mitochondrial)
504832.OCAR_6682+(mitochondrial)
504832.OCAR_6684(PF00873)ER
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504832.OCA5_c20520(PF00749)(plastid)
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504832.OCA5_c12540(PF13607) (PF13380)
504832.OCAR_5471(PF07731) (PF07732)
504832.OCAR_6467(PF00958) (PF00117)
504832.OCA5_c18330+(PF00919)
504832.OCAR_5866(PF02769) (PF00586)
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504832.OCA5_c23210PF00366(mitochondrial)
504832.OCA5_c23070+PF00411
504832.OCA5_c15080(PF13607) (PF13380)
504832.OCA5_c16610(PF14714)(plastid)
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504832.OCA5_c13650(PF10589) (PF10531)
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504832.OCA5_c02560(PF00919)(plastid)
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504832.OCA5_c06770(PF03352)(mitochondrial)
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504832.OCA5_c02190(PF03144) (PF00009)
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504832.OCA5_c03010(PF13872) (PF13871)
504832.OCAR_6379(PF13541) (PF13481)
504832.OCAR_6374(PF03948) (PF01281)
504832.OCAR_4262(PF00919)(plastid)
504832.OCAR_4267(PF02881) (PF02978)
504832.OCAR_7213(PF08459) (PF01541)
504832.OCAR_5928(PF10589) (PF10531)
504832.OCA5_c02520(PF02881) (PF02978)
504832.OCA5_c10310+(mitochondrial)
504832.OCA5_c20360(PF03462) (PF00472)
504832.OCA5_c00270(PF11987) (PF00009)
504832.OCAR_4884(PF00702) (PF00122)
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504832.OCA5_c23150PF00347(mitochondrial)
504832.OCA5_c12430(PF13241) (PF14824)
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504832.OCAR_4413(PF01138) (PF03725)
504832.OCA5_c28000(PF02769) (PF00586)
504832.OCA5_c23130PF03719 PF00333
504832.OCA5_c01930(PF00565)(mitochondrial)
504832.OCA5_c12630+(PF11563)
504832.OCA5_c30510(PF02777) (PF00081)
504832.OCA5_c16980(PF02769) (PF00586)
504832.OCAR_7456(PF03352)(mitochondrial)
504832.OCA5_c32340(PF02566)(mitochondrial)
504832.OCAR_4439(PF01409) (PF02912)
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504832.OCA5_c17970(PF00521) (PF03989)
504832.OCAR_6737PF08442 (PF00549)
504832.OCA5_c05050(PF00702) (PF00122)
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504832.OCAR_7299(PF05496) (PF05491)
504832.OCA5_c16700(PF03948) (PF01281)
504832.OCA5_c14960(PF02629) (PF00549)
504832.OCAR_4572(PF06764)(ER)
504832.OCA5_c23320(PF03144) (PF00009)
504832.OCAR_7723(PF00702) (PF00122)
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504832.OCA5_c15030(PF00224) (PF02887)
504832.OCAR_4530PF05292(plastid)
504832.OCAR_4532(PF00204) (PF00986)
504832.OCA5_c00100(PF03023)(plastid)
504832.OCAR_6565(PF02629) (PF00549)
504832.OCA5_c32030(PF00749)(mitochondrial)
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504832.OCAR_6813+(PF11563)
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504832.OCA5_c23060(PF01000) (PF01193)
504832.OCAR_4176(PF00702) (PF00122)
504832.OCAR_6198+(PF00919)
504832.OCAR_5848(PF00521) (PF03989)
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504832.OCAR_4902(PF02777) (PF00081)
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504832.OCA5_c11110(PF01555)(mitochondrial)
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504832.OCA5_c00050(PF00204) (PF00986)
504832.OCAR_5972(PF00749)(plastid)
504832.OCA5_c13350PF08442 (PF00549)
504832.OCAR_7148(PF01479)plastid
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504832.OCA5_c00070PF05292(plastid)
504832.OCAR_5956(PF00889)(mitochondrial)
504832.OCA5_c21860+(plastid)
504832.OCAR_6007(PF00204) (PF00986)
504832.OCAR_6343(PF02769) (PF00586)
504832.OCAR_5692PF00347(mitochondrial)
504832.OCAR_5694PF03719 PF00333
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504832.OCA5_c24380(PF13481) (PF00772)
504832.OCA5_c28030(PF03144) (PF00009)
504832.OCAR_6667(PF02401)(mitochondrial)
504832.OCA5_c23120(PF00327)(mitochondrial)
504832.OCA5_c13330(PF01970)(ER)
504832.OCAR_5674(PF03144) (PF00009)
504832.OCAR_5675(PF03144) (PF00009)
504832.OCA5_c14100(PF00873)(mitochondrial)
504832.OCA5_c15850(PF00958) (PF00117)
504832.OCAR_7246(PF02844) (PF02843)
504832.OCAR_4215(PF13872) (PF13871)
504832.OCA5_c21690(PF00521) (PF03989)
504832.OCAR_4004(PF10502)(ER)
504832.OCA5_c34020(PF01649)(mitochondrial)
504832.OCA5_c11470(PF00102)plastid
504832.OCAR_6532+
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504832.OCA5_c06780(PF11160)
504832.OCAR_7280+
504832.OCAR_4397(PF00117)
504832.OCAR_6887(PF00117)
504832.OCAR_4029(PF03960)
504832.OCAR_6089(PF00133)
504832.OCAR_6080(PF11563)
504832.OCA5_c08360+
504832.OCA5_c12480+
504832.OCA5_c21220PF00380
504832.OCAR_4621(PF00908)
504832.OCAR_4626(PF01019)
504832.OCAR_4628(PF04343)
504832.OCAR_4629(PF08670)
504832.OCAR_6705(PF03960)
504832.OCA5_c28500(PF01144)
504832.OCAR_7543(PF13662)
504832.OCAR_7545(PF13177)
504832.OCA5_c00130(PF00814)
504832.OCA5_c16480PF09585
504832.OCAR_6147(PF13481)
504832.OCAR_7738(PF00873)
504832.OCA5_c07900(PF08534)
504832.OCA5_c00300PF00312
504832.OCA5_c23430(PF16320)
504832.OCA5_c07300(PF00009)
504832.OCAR_4046+
504832.OCA5_c23290(PF00573)
504832.OCAR_5556(PF01555)
504832.OCA5_c16730(PF01250)
504832.OCA5_c03480(PF00011)
504832.OCA5_c02680(PF08534)
504832.OCAR_4607(PF01018)
504832.OCAR_4603(PF02410)
504832.OCAR_4609(PF01016)
504832.OCA5_c25360(PF13507)
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504832.OCA5_c09970(PF11563)
504832.OCA5_c16930(PF16326)
504832.OCAR_5234(PF01795)
504832.OCAR_7567(PF01612)
504832.OCAR_7562(PF06080)
504832.OCA5_c24180(PF01343)
504832.OCA5_c07460(PF01503)
504832.OCA5_c33930(PF00908)
504832.OCAR_7717(PF01545)
504832.OCA5_c01980(PF00814)
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504832.OCA5_c27510(PF00117)
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504832.OCA5_c11940(PF00117)
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504832.OCA5_c01840(PF08837)
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504832.OCAR_5451(PF13507)
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504832.OCAR_4872(PF01988)
504832.OCA5_c22510+
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504832.OCA5_c33200(PF01019)
504832.OCAR_6463(PF02195)
504832.OCA5_c10970(PF00117)
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504832.OCA5_c32520(PF00430)
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504832.OCA5_c05750(PF01612)
504832.OCA5_c27290(PF01541)
504832.OCAR_7183(PF12344)
504832.OCAR_7189(PF01195)
504832.OCA5_c07590(PF07286)
504832.OCAR_5580(PF01343)
504832.OCAR_4519(PF02130)
504832.OCAR_4512(PF02576)
504832.OCAR_4511(PF13184)
504832.OCA5_c28160(PF14248)
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504832.OCA5_c24400(PF01555)
504832.OCAR_7519(PF00403)
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504832.OCAR_7354(PF01144)
504832.OCAR_7359(PF07286)
504832.OCAR_7358(PF01019)
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504832.OCA5_c17590(PF05746)
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504832.OCA5_c00280(PF02033)
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504832.OCA5_c28570(PF04325)
504832.OCAR_5793(PF03652)
504832.OCAR_7331(PF02401)
504832.OCAR_5245(PF02873)
504832.OCAR_5240(PF01541)
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504832.OCA5_c00890(PF00707)
504832.OCAR_5757+
504832.OCAR_5754(PF11625)
504832.OCA5_c30130(PF00011)
504832.OCAR_4486(PF02367)
504832.OCA5_c17050(PF02938)
504832.OCAR_5995(PF01479)
504832.OCA5_c08740(PF00472)
504832.OCA5_c18130+
504832.OCA5_c15280+
504832.OCA5_c21530(PF01029)
504832.OCAR_4369(PF02527)
504832.OCAR_4367(PF02195)
504832.OCAR_5145(PF13430)
504832.OCAR_5143PF09585
504832.OCAR_5140(PF13662)
504832.OCA5_c08880+
504832.OCA5_c29920(PF14588)
504832.OCAR_4967(PF14588)
504832.OCA5_c22370(PF14588)
504832.OCAR_7347+
504832.OCAR_5772(PF14588)
504832.OCA5_c07870(PF02401)
504832.OCAR_6955(PF01343)
504832.OCAR_5973(PF00749)
504832.OCAR_5970+
504832.OCA5_c16850(PF00398)
504832.OCA5_c23760+
504832.OCA5_c02770(PF08712)
504832.OCA5_c29440(PF11160)
504832.OCA5_c21800(PF01192)
504832.OCAR_6385(PF14714)
504832.OCA5_c24560+
504832.OCAR_5121(PF09361)
504832.OCAR_5122(PF09361)
504832.OCAR_7411+
504832.OCA5_c11850(PF01479)
504832.OCAR_4943(PF00011)
504832.OCA5_c11320(PF01343)
504832.OCAR_5712(PF07542)
504832.OCAR_4442(PF00707)
504832.OCAR_6979(PF01555)
504832.OCAR_6976(PF00994)
504832.OCA5_c30680(PF00403)
504832.OCA5_c00690(PF00011)
504832.OCA5_c11130(PF00994)
504832.OCA5_c23160PF00410
504832.OCAR_5955(PF00318)
504832.OCAR_5958(PF01765)
504832.OCAR_5489(PF04343)
504832.OCA5_c29760+
504832.OCA5_c19620(PF00873)
504832.OCAR_5105(PF04325)not used
504832.OCAR_5108(PF04325)
504832.OCAR_4271(PF01245)
504832.OCA5_c23570(PF01989)
504832.OCA5_c00480(PF02367)
504832.OCAR_5731(PF02566)
504832.OCAR_6640(PF05872)
504832.OCAR_4469(PF06414)
504832.OCAR_4464(PF00011)
504832.OCA5_c00010(PF00308)
504832.OCA5_c08900+
504832.OCA5_c22450(PF09361)
504832.OCA5_c21840(PF01668)
504832.OCAR_6340(PF00308)
504832.OCAR_6349(PF16326)
504832.OCAR_5691PF00410
504832.OCAR_5696PF00828
504832.OCAR_5697(PF00344)
504832.OCA5_c01260(PF13541)
504832.OCA5_c13940(PF00494)
504832.OCA5_c00240(PF02576)
504832.OCAR_4254(PF01227)
504832.OCA5_c07730+
504832.OCA5_c33370(PF01018)
504832.OCA5_c05800(PF06080)
504832.OCAR_4405(PF13541)
504832.OCAR_4400(PF01503)
504832.OCAR_6666(PF13292)
504832.OCA5_c07890(PF00075)
504832.OCAR_6933(PF03352)
504832.OCAR_6935(PF00102)
504832.OCAR_7221(PF13393)
504832.OCAR_7224+
504832.OCA5_c24840(PF00994)
504832.OCA5_c01920(PF01029)
504832.OCAR_6065(PF00873)
504832.OCAR_6499(PF07977)
504832.OCAR_4163(PF00011)
504832.OCAR_5678(PF00573)
504832.OCAR_5679PF00276
504832.OCAR_5673PF00177
504832.OCAR_5676PF00338
504832.OCAR_5677PF00297
504832.OCA5_c15990(PF01555)
504832.OCAR_4231(PF03960)
504832.OCA5_c07710+
504832.OCA5_c03870(PF02566)
504832.OCA5_c33350(PF01016)
504832.OCAR_5085(PF06844)
504832.OCA5_c00370(PF07977)
504832.OCA5_c00630(PF02224)
504832.OCAR_7243(PF01479)
504832.OCA5_c23100(PF00344)
504832.OCA5_c22270+
504832.OCA5_c21990+
504832.OCAR_5534(PF14216)
504832.OCAR_5539+
504832.OCA5_c12990(PF01144)
504832.OCAR_5651(PF00118)
504832.OCA5_c20310(PF13502)
504832.OCA5_c27160(PF02463)
504832.OCA5_c07190+
504832.OCA5_c00610(PF01343)
504832.OCAR_5355(PF01442)
504832.OCAR_7266(PF09849)
504832.OCAR_7262(PF13393)
504832.OCAR_4008+
504832.OCA5_c23780(PF01227)
504832.OCA5_c03330(PF00011)
504832.OCA5_c14950PF08442
504832.OCAR_5180(PF03404)
504832.OCAR_5184+
504832.OCA5_c23310PF00338
504832.OCA5_c26890(PF01715)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
    Estimated copy number = 4.2 (42/10 KEGG proteins)
  • Functional Type VI secretion system: NO (FDR = 7.7 %)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================