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Effective results for Clostridium hylemonae DSM 15053 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 270
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 52 eukaryotic-like domains, contained in 270 proteins (78 high, 192 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
553973.CLOHYLEM_05925PF02782 PF00370(mitochondrial); (plastid)
553973.CLOHYLEM_07120PF02782 PF00370ER
553973.CLOHYLEM_07866PF00370mitochondrial
553973.CLOHYLEM_05703(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_04601PF09370mitochondrial
553973.CLOHYLEM_04607(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_05801(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_05772(PF13306)ER
553973.CLOHYLEM_04851(PF11070)ER
553973.CLOHYLEM_06293(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_05715(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_04613(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_05889(PF13306)(mitochondrial)
553973.CLOHYLEM_07027(PF01416)(mitochondrial)
553973.CLOHYLEM_06754PF06541ER
553973.CLOHYLEM_06370(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_05661(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_04594(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_06543(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_07561(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_07422(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_07767(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_05694PF05698ER
553973.CLOHYLEM_05861(PF01554)(mitochondrial)
553973.CLOHYLEM_05523PF06541ER
553973.CLOHYLEM_06092(PF13306)ER
553973.CLOHYLEM_06434(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_06437(PF04199)(mitochondrial)
553973.CLOHYLEM_05440(PF01554)(ER)
553973.CLOHYLEM_07373(PF01554)ER
553973.CLOHYLEM_06152(PF01554)ER
553973.CLOHYLEM_07792(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_05026PF04587ER
553973.CLOHYLEM_04014PF06541ER; (ER)
553973.CLOHYLEM_05941PF05698ER
553973.CLOHYLEM_07096(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_07523(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_06457(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_05798(PF13407)mitochondrial; (mitochondrial)
553973.CLOHYLEM_05488(PF13306)ER
553973.CLOHYLEM_05485(PF13306)ER
553973.CLOHYLEM_07538(PF01554)(ER)
553973.CLOHYLEM_06130(PF01992)(mitochondrial)
553973.CLOHYLEM_06132(PF00137)ER
553973.CLOHYLEM_06464(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_06468PF02782 PF00370(plastid)
553973.CLOHYLEM_05587(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_04565(PF01554)(ER); ER
553973.CLOHYLEM_06273(PF13407)mitochondrial
553973.CLOHYLEM_05977(PF00137)ER
553973.CLOHYLEM_07518PF05698ER
553973.CLOHYLEM_07458(PF01228)(ER)
553973.CLOHYLEM_05754(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_07447(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_04666(PF01554)(ER)
553973.CLOHYLEM_05430(PF13407)(ER)
553973.CLOHYLEM_04259(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_04386(PF01554)(ER)
553973.CLOHYLEM_04893(PF12646)(mitochondrial); mitochondrial
553973.CLOHYLEM_06013(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_06017(PF13407)mitochondrial; (mitochondrial)
553973.CLOHYLEM_07527(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_05380(PF13306)ER
553973.CLOHYLEM_05734(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_04679(PF01554)(ER)
553973.CLOHYLEM_04264PF02782 PF00370(plastid)
553973.CLOHYLEM_07460(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_06026(PF00137)ER
553973.CLOHYLEM_06282(PF13407)ER
553973.CLOHYLEM_05643PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_05646PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_05647PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_05708PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_05415(PF01228) (PF02901)
553973.CLOHYLEM_04273(PF17042) (PF07005)
553973.CLOHYLEM_06908PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_04476PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_05677(PF17042) (PF07005)
553973.CLOHYLEM_07759PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_05062PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_04138PF02734(mitochondrial)
553973.CLOHYLEM_05685PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_05682PF02734 PF02733
553973.CLOHYLEM_06438(PF17042) (PF07005)
553973.CLOHYLEM_05140(PF02475)(ER)
553973.CLOHYLEM_05202PF06541(plastid)
553973.CLOHYLEM_05020(PF01228) (PF02901)
553973.CLOHYLEM_05785PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_06326(PF17042) (PF07005)
553973.CLOHYLEM_05167(PF12681)(ER)
553973.CLOHYLEM_05794PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_05221(PF01228) (PF02901)
553973.CLOHYLEM_06461(PF00456)(ER)
553973.CLOHYLEM_04752(PF01228) (PF02901)
553973.CLOHYLEM_05811PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_05580PF02733(mitochondrial)
553973.CLOHYLEM_05582PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_04211PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_05109(PF02906) (PF02256)
553973.CLOHYLEM_05576(PF02906) (PF02256)
553973.CLOHYLEM_05809PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_05778(PF13407)(mitochondrial)
553973.CLOHYLEM_05978(PF01496)(mitochondrial)
553973.CLOHYLEM_07196(PF01391)(ER)
553973.CLOHYLEM_06792(PF00121)(mitochondrial)
553973.CLOHYLEM_07459(PF01228) (PF02901)
553973.CLOHYLEM_05639PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_05752PF02734 PF02733
553973.CLOHYLEM_05359PF06541(mitochondrial)
553973.CLOHYLEM_06001PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_06004PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_07710PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_06537(PF02146)(mitochondrial)
553973.CLOHYLEM_05729PF02734 PF02733
553973.CLOHYLEM_05921PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_07382(PF01228) (PF02901)
553973.CLOHYLEM_07385(PF14748)(ER)
553973.CLOHYLEM_06708(PF02906) (PF02256)
553973.CLOHYLEM_05653PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_05939PF02782 PF00370
553973.CLOHYLEM_07002(PF01554)(ER)
553973.CLOHYLEM_07860PF06541not used
553973.CLOHYLEM_05642(PF00596)
553973.CLOHYLEM_05640(PF01116)
553973.CLOHYLEM_05709(PF04199)
553973.CLOHYLEM_05707(PF00456)
553973.CLOHYLEM_04600(PF06792)
553973.CLOHYLEM_04603PF09370
553973.CLOHYLEM_04602PF09370
553973.CLOHYLEM_04604(PF06792)
553973.CLOHYLEM_04606(PF00121)
553973.CLOHYLEM_05775(PF00456)
553973.CLOHYLEM_06391(PF12681)
553973.CLOHYLEM_06298(PF00456)
553973.CLOHYLEM_05213(PF14748)
553973.CLOHYLEM_07546PF04383
553973.CLOHYLEM_07815(PF04199)not used
553973.CLOHYLEM_07816(PF07005)
553973.CLOHYLEM_05712PF02734
553973.CLOHYLEM_05713PF02733
553973.CLOHYLEM_04612(PF13407)
553973.CLOHYLEM_05401PF04383
553973.CLOHYLEM_05402(PF02127)
553973.CLOHYLEM_04102(PF12681)
553973.CLOHYLEM_04821(PF13306)
553973.CLOHYLEM_05249(PF01391)
553973.CLOHYLEM_07754(PF13306)not used
553973.CLOHYLEM_07117(PF07892)
553973.CLOHYLEM_06375PF00370
553973.CLOHYLEM_05669(PF01391)
553973.CLOHYLEM_07803(PF02127)not used
553973.CLOHYLEM_07805PF04383not used
553973.CLOHYLEM_04599PF09370
553973.CLOHYLEM_04598PF09370
553973.CLOHYLEM_04597PF09370
553973.CLOHYLEM_06976(PF04199)
553973.CLOHYLEM_05271(PF04199)
553973.CLOHYLEM_06749(PF02906)not used
553973.CLOHYLEM_05182(PF01554)
553973.CLOHYLEM_07761PF00370
553973.CLOHYLEM_05699(PF00456)
553973.CLOHYLEM_05697PF02782not used
553973.CLOHYLEM_06415(PF02527)
553973.CLOHYLEM_04587(PF07247)
553973.CLOHYLEM_07905PF05698not used
553973.CLOHYLEM_06987(PF01554)
553973.CLOHYLEM_07227(PF00456)
553973.CLOHYLEM_07354(PF14249)
553973.CLOHYLEM_07595(PF01554)
553973.CLOHYLEM_05268(PF02906)
553973.CLOHYLEM_07683(PF13240)
553973.CLOHYLEM_04970(PF14748)
553973.CLOHYLEM_07770(PF00456)not used
553973.CLOHYLEM_07772(PF00456)
553973.CLOHYLEM_05688(PF01116)
553973.CLOHYLEM_05680(PF00121)
553973.CLOHYLEM_07823(PF00456)
553973.CLOHYLEM_06221(PF13240)
553973.CLOHYLEM_06551(PF01391)
553973.CLOHYLEM_07912(PF00596)not used
553973.CLOHYLEM_05526(PF02146)
553973.CLOHYLEM_04923(PF01554)
553973.CLOHYLEM_04929PF05698
553973.CLOHYLEM_07909PF06541not used
553973.CLOHYLEM_07908PF00370not used
553973.CLOHYLEM_06439(PF00596)
553973.CLOHYLEM_04142(PF13240)
553973.CLOHYLEM_06940(PF13240)
553973.CLOHYLEM_07794(PF02901)not used
553973.CLOHYLEM_07793(PF13306)not used
553973.CLOHYLEM_06443PF02733
553973.CLOHYLEM_06445(PF13306)
553973.CLOHYLEM_06444PF02734
553973.CLOHYLEM_05786(PF00596)
553973.CLOHYLEM_05783(PF00596)
553973.CLOHYLEM_04302(PF01554)
553973.CLOHYLEM_05947(PF02317)
553973.CLOHYLEM_05943(PF00596)
553973.CLOHYLEM_06937(PF13306)
553973.CLOHYLEM_06936(PF01116)
553973.CLOHYLEM_07300(PF14336)
553973.CLOHYLEM_05231(PF01416)
553973.CLOHYLEM_07410(PF16011)
553973.CLOHYLEM_05301(PF04199)
553973.CLOHYLEM_05018(PF01116)
553973.CLOHYLEM_07898PF00370not used
553973.CLOHYLEM_07891(PF13306)not used
553973.CLOHYLEM_07897PF02733not used
553973.CLOHYLEM_07926(PF02317)not used
553973.CLOHYLEM_05793(PF00596)
553973.CLOHYLEM_04992(PF02906)
553973.CLOHYLEM_07314(PF01554)
553973.CLOHYLEM_07539(PF00958)
553973.CLOHYLEM_06131(PF01496)
553973.CLOHYLEM_06133(PF01990)
553973.CLOHYLEM_06135(PF16886)
553973.CLOHYLEM_06137(PF01813)
553973.CLOHYLEM_07883(PF02146)
553973.CLOHYLEM_07880PF02782not used
553973.CLOHYLEM_05817(PF00596)
553973.CLOHYLEM_05810(PF01116)
553973.CLOHYLEM_05581(PF01116)
553973.CLOHYLEM_04213(PF07892)
553973.CLOHYLEM_07438(PF13240)
553973.CLOHYLEM_06124(PF14748)
553973.CLOHYLEM_05103(PF00958)
553973.CLOHYLEM_05611(PF01116)
553973.CLOHYLEM_04743(PF01795)
553973.CLOHYLEM_05579PF02734
553973.CLOHYLEM_05803PF02734
553973.CLOHYLEM_05804PF02733
553973.CLOHYLEM_05807(PF00596)
553973.CLOHYLEM_05974(PF01990)
553973.CLOHYLEM_05975(PF01992)
553973.CLOHYLEM_05976(PF01991)
553973.CLOHYLEM_05971(PF01813)
553973.CLOHYLEM_05973(PF16886)
553973.CLOHYLEM_07193(PF01391)
553973.CLOHYLEM_06487(PF01554)
553973.CLOHYLEM_06480PF02782
553973.CLOHYLEM_05116(PF02906)
553973.CLOHYLEM_06806(PF01391)
553973.CLOHYLEM_07450(PF04199)
553973.CLOHYLEM_07850(PF13306)not used
553973.CLOHYLEM_04658(PF01554)not used
553973.CLOHYLEM_07755(PF13306)
553973.CLOHYLEM_04885PF04383
553973.CLOHYLEM_04867(PF01795)
553973.CLOHYLEM_04860(PF01554)
553973.CLOHYLEM_07441(PF13240)
553973.CLOHYLEM_07063(PF02127)
553973.CLOHYLEM_06002(PF00596)
553973.CLOHYLEM_07711(PF01116)
553973.CLOHYLEM_07844(PF02527)
553973.CLOHYLEM_04667(PF01391)
553973.CLOHYLEM_05928PF02733
553973.CLOHYLEM_05927PF02734
553973.CLOHYLEM_05923(PF00596)
553973.CLOHYLEM_04255(PF01416)
553973.CLOHYLEM_04895(PF01554)
553973.CLOHYLEM_04414PF05183
553973.CLOHYLEM_04705(PF01554)
553973.CLOHYLEM_05651(PF02901)
553973.CLOHYLEM_05422PF02734
553973.CLOHYLEM_05423PF02733
553973.CLOHYLEM_04267PF02733
553973.CLOHYLEM_04266PF02734
553973.CLOHYLEM_04061(PF01554)
553973.CLOHYLEM_04843(PF02146)
553973.CLOHYLEM_07461PF04916

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================