Effective results for Streptococcus dysgalactiae subsp. dysgalactiae ATCC 27957 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 159
- Predicted by T4SEpre: 85
- Predicted by EffectiveELD: 14 eukaryotic-like domains, contained in 88 proteins (26 high, 62 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): (Type IV)

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
663952.SDD27957_02600(PF07650)(mitochondrial); mitochondrial
663952.SDD27957_02735PF13276 (PF00665) (PF01527)
663952.SDD27957_08550+mitochondrial
663952.SDD27957_09730(PF05257)ER
663952.SDD27957_05495(PF06280)(ER)
663952.SDD27957_03895(PF00665)(mitochondrial)
663952.SDD27957_01830+ER
663952.SDD27957_03465+ER
663952.SDD27957_00390(PF00344)mitochondrial
663952.SDD27957_08020+ER; (ER)
663952.SDD27957_00020+mitochondrial; (mitochondrial)
663952.SDD27957_08875+ER
663952.SDD27957_01875+ER
663952.SDD27957_01265+ER
663952.SDD27957_04930+(ER); ER
663952.SDD27957_09405+ER
663952.SDD27957_00130(PF05257)ER
663952.SDD27957_02515+ER
663952.SDD27957_02650PF13276 (PF00665) (PF01527)
663952.SDD27957_09925+ER
663952.SDD27957_01250(PF03714)(mitochondrial); (ER)
663952.SDD27957_00890(PF00344)ER
663952.SDD27957_02790PF13276 (PF00665) (PF01527)
663952.SDD27957_06965+ER
663952.SDD27957_07305PF12855(mitochondrial)
663952.SDD27957_06940(PF01527)(mitochondrial)
663952.SDD27957_01130+ER
663952.SDD27957_07990+(mitochondrial)
663952.SDD27957_08995(PF00665)mitochondrial
663952.SDD27957_04950+(ER)
663952.SDD27957_09370+(mitochondrial)
663952.SDD27957_06595PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_06590(PF01527)(mitochondrial); not used
663952.SDD27957_06935PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_02260PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_02280+(plastid)
663952.SDD27957_05485PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_05480PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_11180(PF01527)(mitochondrial)
663952.SDD27957_11185PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_05100(PF01527)(mitochondrial)
663952.SDD27957_02630PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_09850+(mitochondrial)
663952.SDD27957_09880PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_04810(PF01527)(mitochondrial)
663952.SDD27957_04815PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_02980PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_04000+(ER)
663952.SDD27957_08470PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_11150+(ER)
663952.SDD27957_00120PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_08865PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_01080PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_05770(PF01527)(mitochondrial)
663952.SDD27957_09755PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_10745(PF02971) (PF07837)
663952.SDD27957_05095PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_05765PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_02305(PF01527)(mitochondrial)
663952.SDD27957_02300PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_06530PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_05935PF13276 (PF00665)
663952.SDD27957_02255(PF01527)(mitochondrial)
663952.SDD27957_02245(PF06280)(ER)
663952.SDD27957_05865+
663952.SDD27957_10905+
663952.SDD27957_01115+
663952.SDD27957_02295(PF00665)
663952.SDD27957_07690+
663952.SDD27957_05475(PF01527)
663952.SDD27957_02720+
663952.SDD27957_04980+
663952.SDD27957_10840+
663952.SDD27957_08145+
663952.SDD27957_00295+
663952.SDD27957_01205+
663952.SDD27957_02865(PF00665)
663952.SDD27957_01365+
663952.SDD27957_02590+
663952.SDD27957_07420+
663952.SDD27957_02605(PF07650)not used
663952.SDD27957_07645+
663952.SDD27957_03880+
663952.SDD27957_01550+
663952.SDD27957_02925(PF06280)
663952.SDD27957_06120+
663952.SDD27957_05490(PF01527)
663952.SDD27957_11200+
663952.SDD27957_03545(PF03714)
663952.SDD27957_00385+
663952.SDD27957_05620+
663952.SDD27957_02625(PF01527)
663952.SDD27957_07665+
663952.SDD27957_09995(PF00665)
663952.SDD27957_10790+
663952.SDD27957_01705(PF00665)
663952.SDD27957_05025+
663952.SDD27957_05730+
663952.SDD27957_02550+
663952.SDD27957_09460+
663952.SDD27957_10810+
663952.SDD27957_09885(PF01527)
663952.SDD27957_10145(PF01527)
663952.SDD27957_08870(PF01527)
663952.SDD27957_07105+
663952.SDD27957_00220+
663952.SDD27957_03900(PF01527)
663952.SDD27957_00125(PF01527)
663952.SDD27957_00900+
663952.SDD27957_02975(PF01527)
663952.SDD27957_08910(PF02502)
663952.SDD27957_08915(PF02502)
663952.SDD27957_06060+
663952.SDD27957_08465(PF01527)
663952.SDD27957_09220+
663952.SDD27957_07830+
663952.SDD27957_03930(PF00665)
663952.SDD27957_03910(PF00665)
663952.SDD27957_09300+
663952.SDD27957_11175PF13276
663952.SDD27957_11170(PF00665)
663952.SDD27957_08325(PF05257)
663952.SDD27957_09125(PF12949)
663952.SDD27957_00675+
663952.SDD27957_00855+
663952.SDD27957_01075(PF01527)
663952.SDD27957_05175(PF02502)
663952.SDD27957_05170(PF02502)
663952.SDD27957_06680+
663952.SDD27957_07150(PF00665)
663952.SDD27957_00685(PF01527)
663952.SDD27957_03260(PF02502)
663952.SDD27957_00205(PF05257)
663952.SDD27957_04360(PF05257)
663952.SDD27957_01420+
663952.SDD27957_05235+
663952.SDD27957_06535(PF01527)
663952.SDD27957_05890+
663952.SDD27957_05940(PF01527)
663952.SDD27957_10080+
663952.SDD27957_04795(PF00665)
663952.SDD27957_04790(PF01527)
663952.SDD27957_07555PF13276
663952.SDD27957_07550(PF01527)
663952.SDD27957_10470(PF05495)
663952.SDD27957_01430+
663952.SDD27957_00260+
663952.SDD27957_09000(PF01527)
663952.SDD27957_06235+
663952.SDD27957_02490(PF00665)
663952.SDD27957_07165(PF05257)
663952.SDD27957_07765+
663952.SDD27957_07760+
663952.SDD27957_00415+
663952.SDD27957_09760(PF01527)
663952.SDD27957_06485+
663952.SDD27957_00320(PF07650)
663952.SDD27957_05680+
663952.SDD27957_01175+

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
    Estimated copy number = 0 (0/0 KEGG proteins)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================