Effective results for Frankia alni ACN14a (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 344
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 48 eukaryotic-like domains, contained in 344 proteins (34 high, 310 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
326424.FRAAL5139(PF13271) (PF00400)(mitochondrial)
326424.FRAAL0348(PF14765) (PF00698)mitochondrial; (mitochondrial)
326424.FRAAL1676(PF14765) (PF00698)(ER)
326424.FRAAL5631(PF13458)mitochondrial
326424.FRAAL4902(PF06965)(mitochondrial)
326424.FRAAL4224(PF02224)mitochondrial
326424.FRAAL6670(PF02569)mitochondrial
326424.FRAAL6192(PF00406)(mitochondrial)
326424.FRAAL3467(PF13458)ER
326424.FRAAL3442(PF00296)ER
326424.FRAAL1332(PF01636)(mitochondrial)
326424.FRAAL1102(PF00406)(mitochondrial)
326424.FRAAL6171(PF00296)mitochondrial; (mitochondrial)
326424.FRAAL3234(PF03988)(mitochondrial)
326424.FRAAL4618(PF13458)mitochondrial
326424.FRAAL4616(PF13458)ER
326424.FRAAL0761(PF00296)(ER); ER
326424.FRAAL3391(PF13458)ER
326424.FRAAL3964(PF00296)mitochondrial
326424.FRAAL4885(PF00296)(mitochondrial)
326424.FRAAL1244(PF00400)mitochondrial
326424.FRAAL4378(PF13087)(mitochondrial)
326424.FRAAL5563(PF00400)(mitochondrial)
326424.FRAAL6033(PF00899)mitochondrial
326424.FRAAL3800(PF13458)ER
326424.FRAAL3058(PF00296)(ER)
326424.FRAAL1593PF07250(mitochondrial)
326424.FRAAL2841(PF13458)mitochondrial
326424.FRAAL5668(PF00698)(mitochondrial)
326424.FRAAL3527(PF13458)(mitochondrial)
326424.FRAAL5271(PF01636)mitochondrial
326424.FRAAL0388(PF00296)ER; (ER)
326424.FRAAL3097(PF13458)ER
326424.FRAAL5625(PF10503)(mitochondrial)
326424.FRAAL3759(PF03015)(mitochondrial)
326424.FRAAL5359(PF00400)mitochondrial; (mitochondrial)
326424.FRAAL5377(PF00296)(mitochondrial)
326424.FRAAL4957PF07250mitochondrial
326424.FRAAL2051(PF05050)(mitochondrial)
326424.FRAAL4421(PF00296)(mitochondrial)
326424.FRAAL2454(PF07519)(mitochondrial)
326424.FRAAL4991(PF00899)ER
326424.FRAAL1482(PF13458)ER
326424.FRAAL1948(PF06965)mitochondrial
326424.FRAAL1942(PF11999)mitochondrial
326424.FRAAL2624(PF13458)ER
326424.FRAAL3174(PF02156)(mitochondrial); plastid
326424.FRAAL6411(PF00400)mitochondrial
326424.FRAAL5775(PF10503)(mitochondrial); (plastid)
326424.FRAAL4112(PF01636)ER; (ER)
326424.FRAAL1792(PF02156)ER
326424.FRAAL6048(PF13361)ER; (ER)
326424.FRAAL2561(PF14765) (PF00698)(mitochondrial)
326424.FRAAL5552(PF13458)ER
326424.FRAAL3306(PF00400)(mitochondrial)
326424.FRAAL6580(PF02223)mitochondrial
326424.FRAAL0639(PF10503)(ER)
326424.FRAAL3532(PF13458)mitochondrial
326424.FRAAL6287(PF13458)ER; (ER)
326424.FRAAL2045(PF05050)mitochondrial; (mitochondrial)
326424.FRAAL2047(PF05050)(mitochondrial)
326424.FRAAL5386(PF00296)(mitochondrial)
326424.FRAAL5034(PF13458)(mitochondrial)
326424.FRAAL3447(PF00698)(mitochondrial)
326424.FRAAL3987(PF13374) PF13676
326424.FRAAL1144(PF13458)(mitochondrial)
326424.FRAAL3617(PF13271) (PF00400)
326424.FRAAL3954PF13676 (PF00400)
326424.FRAAL2989(PF00698) (PF14765)
326424.FRAAL3967(PF05050)(mitochondrial)
326424.FRAAL6687PF02026(mitochondrial)
326424.FRAAL3334(PF13374) PF13676
326424.FRAAL4144(PF13374) PF13676
326424.FRAAL0349(PF00698) (PF14765)
326424.FRAAL0346(PF00698) (PF14765)
326424.FRAAL0347(PF14765) (PF00698)
326424.FRAAL5062(PF09348)(mitochondrial)
326424.FRAAL0566(PF00296)(ER)
326424.FRAAL3715(PF00296)plastid
326424.FRAAL2728(PF06965)(ER); not used
326424.FRAAL5499PF13676 (PF00400)
326424.FRAAL3899(PF13374) PF13676
326424.FRAAL0601(PF01928)(ER)
326424.FRAAL1550(PF14765) (PF00698)
326424.FRAAL1289(PF00698) (PF14765)
326424.FRAAL3568(PF00296)(plastid)
326424.FRAAL6185(PF00296)(mitochondrial)
326424.FRAAL4024(PF00296)(ER)
326424.FRAAL3249(PF13271)(mitochondrial)
326424.FRAAL0468(PF13374) PF13676
326424.FRAAL0246(PF13087)plastid
326424.FRAAL1753PF13676 (PF00400)
326424.FRAAL1754PF13676 (PF00400)
326424.FRAAL2479(PF00296)plastid
326424.FRAAL2913(PF00698) (PF14765)
326424.FRAAL2319PF13676(mitochondrial)
326424.FRAAL3193(PF00698) (PF14765)
326424.FRAAL4996(PF13374) PF13676
326424.FRAAL1962(PF10503)(ER)
326424.FRAAL4833(PF00296)(ER)
326424.FRAAL0107PF13676(mitochondrial)
326424.FRAAL4258(PF00296)(ER)
326424.FRAAL0919(PF01761)(plastid)
326424.FRAAL5891(PF02156)(mitochondrial)
326424.FRAAL0630PF13676 (PF00400)
326424.FRAAL2042(PF05050)plastid
326424.FRAAL4072(PF00698) (PF14765)
326424.FRAAL4071(PF00698) (PF14765)
326424.FRAAL2562(PF14765) (PF00698)
326424.FRAAL5636(PF13374)
326424.FRAAL3740(PF06441)
326424.FRAAL2447(PF01928)
326424.FRAAL3106(PF00296)
326424.FRAAL3824(PF13458)
326424.FRAAL3825(PF13459)
326424.FRAAL5342(PF13361)
326424.FRAAL5340(PF04909)
326424.FRAAL5613(PF13458)
326424.FRAAL2347(PF13374)
326424.FRAAL2345PF13676
326424.FRAAL4963(PF00406)
326424.FRAAL2522(PF00296)
326424.FRAAL2524(PF04909)
326424.FRAAL3123(PF00296)
326424.FRAAL6442(PF00899)
326424.FRAAL5970(PF00296)
326424.FRAAL5976(PF13361)
326424.FRAAL5977(PF13087)
326424.FRAAL0472(PF13374)
326424.FRAAL5403(PF00296)
326424.FRAAL4943(PF00400)
326424.FRAAL2320PF13676
326424.FRAAL5090(PF04455)
326424.FRAAL5959(PF04909)
326424.FRAAL4774(PF00296)
326424.FRAAL4770(PF01636)
326424.FRAAL1339(PF00400)
326424.FRAAL1337(PF01436)
326424.FRAAL3868(PF00296)
326424.FRAAL4432(PF00296)
326424.FRAAL6371(PF02569)
326424.FRAAL3427(PF00296)
326424.FRAAL2464(PF13458)
326424.FRAAL3211(PF08491)
326424.FRAAL4639(PF01761)
326424.FRAAL4452(PF00296)
326424.FRAAL0296(PF04909)
326424.FRAL5465(PF00296)
326424.FRAAL3988(PF06101)
326424.FRAAL6358(PF03988)
326424.FRAAL1374(PF14311)
326424.FRAAL5469(PF00296)
326424.FRAAL5463(PF02569)
326424.FRAAL5461(PF06441)
326424.FRAAL5465(PF13458)
326424.FRAAL4846(PF00296)
326424.FRAAL2449(PF00296)
326424.FRAAL6246(PF02156)
326424.FRAAL3132(PF13458)
326424.FRAAL3237(PF04909)
326424.FRAAL3233(PF03988)
326424.FRAAL3131(PF04909)
326424.FRAAL3135(PF13458)
326424.FRAAL2617(PF04909)
326424.FRAAL3396(PF13459)
326424.FRAAL4860(PF13458)
326424.FRAAL4866(PF13458)
326424.FRAAL2429(PF04909)
326424.FRAAL2422(PF00296)
326424.FRAAL4671(PF01436)
326424.FRAAL2634(PF04909)
326424.FRAAL3373(PF01636)
326424.FRAAL3374(PF00296)
326424.FRAAL4802(PF00296)
326424.FRAAL0725(PF13458)
326424.FRAAL3582(PF13458)
326424.FRAAL1180PF13676
326424.FRAAL3969(PF00296)
326424.FRAAL4883(PF01636)
326424.FRAAL3354(PF07519)
326424.FRAAL4354(PF13458)
326424.FRAAL5507PF13676
326424.FRAAL3482(PF04909)
326424.FRAAL3483(PF02569)
326424.FRAAL4598(PF00400)
326424.FRAAL6050(PF00899)
326424.FRAAL6239(PF02156)
326424.FRAAL1418(PF00296)
326424.FRAAL5562PF13676
326424.FRAAL0098(PF10503)
326424.FRAAL0327(PF04909)
326424.FRAAL0325(PF07519)
326424.FRAAL3947(PF01636)
326424.FRAAL0329(PF13458)
326424.FRAAL2253(PF02224)
326424.FRAAL3070(PF04909)
326424.FRAAL2800(PF00296)
326424.FRAAL0668(PF02223)
326424.FRAAL0662(PF04505)
326424.FRAAL5044(PF11999)
326424.FRAAL6038(PF13361)
326424.FRAAL6715(PF01636)
326424.FRAAL4141(PF01636)
326424.FRAAL5541(PF00400)
326424.FRAAL3055(PF01636)
326424.FRAAL2868(PF13459)
326424.FRAAL5061(PF09348)
326424.FRAAL2482(PF00296)
326424.FRAAL3501(PF04909)
326424.FRAAL3500(PF00296)
326424.FRAAL2070(PF00296)
326424.FRAAL0565PF13676
326424.FRAAL2840(PF00296)
326424.FRAAL6433(PF05050)
326424.FRAAL1805(PF00755)
326424.FRAAL3525(PF04909)
326424.FRAAL0385(PF00296)
326424.FRAAL5493(PF01636)
326424.FRAAL3094(PF01636)
326424.FRAAL3096(PF04909)
326424.FRAAL3777(PF01636)
326424.FRAAL1826(PF01436)
326424.FRAAL3541(PF00296)
326424.FRAAL2706(PF02223)
326424.FRAAL2704(PF01928)
326424.FRAAL6623(PF00296)
326424.FRAAL4065(PF01636)
326424.FRAAL1611(PF00296)
326424.FRAAL3753(PF01636)
326424.FRAAL4930(PF00296)
326424.FRAAL4720PF13676
326424.FRAAL0854PF00179
326424.FRAAL0856(PF00899)
326424.FRAAL0853PF01398
326424.FRAAL2518(PF00296)
326424.FRAAL6184(PF00296)
326424.FRAAL6329(PF13361)
326424.FRAAL1866PF02026
326424.FRAAL4742(PF00296)
326424.FRAAL4219(PF03803)
326424.FRAAL2749PF12851
326424.FRAAL3830(PF13458)
326424.FRAAL0873(PF00296)
326424.FRAAL0871(PF01636)
326424.FRAAL3793(PF00296)
326424.FRAAL0792(PF13458)
326424.FRAAL0267(PF13361)
326424.FRAAL4056(PF07519)
326424.FRAAL0072(PF00296)
326424.FRAAL3478(PF04909)
326424.FRAAL5311PF13676
326424.FRAAL0241(PF13374)
326424.FRAAL6496(PF01928)
326424.FRAAL3875(PF01636)
326424.FRAAL6801(PF00899)
326424.FRAAL6773(PF00648)
326424.FRAAL1691(PF06441)
326424.FRAAL1690(PF01636)
326424.FRAAL2914(PF00698)
326424.FRAAL4422(PF00296)
326424.FRAAL0427(PF01436)
326424.FRAAL0426(PF01436)
326424.FRAAL0428(PF01436)
326424.FRAAL3435(PF00296)
326424.FRAAL2455(PF13087)
326424.FRAAL2938(PF00400)
326424.FRAAL2594(PF06441)
326424.FRAAL1152(PF13361)
326424.FRAAL5476(PF00296)
326424.FRAAL4875(PF00296)
326424.FRAAL4879(PF04909)
326424.FRAAL1965(PF00400)
326424.FRAAL3952(PF13459)
326424.FRAAL0975PF08213not used
326424.FRAAL5285(PF04909)
326424.FRAAL3365(PF13458)
326424.FRAAL3364(PF13459)
326424.FRAAL4832(PF00296)
326424.FRAAL4830(PF00296)
326424.FRAAL4834(PF00296)
326424.FRAAL0555(PF06441)
326424.FRAAL0739(PF00296)
326424.FRAAL2998PF05671
326424.FRAAL2996(PF13459)
326424.FRAAL2995(PF13458)
326424.FRAAL3343(PF00296)
326424.FRAAL3344(PF00296)
326424.FRAAL2834(PF00296)
326424.FRAAL2837(PF04909)
326424.FRAAL0695(PF13361)
326424.FRAAL0698(PF00400)
326424.FRAAL1549(PF00698)
326424.FRAAL3661(PF06441)
326424.FRAAL3938PF13676
326424.FRAAL6340(PF00400)
326424.FRAAL0918(PF00899)
326424.FRAAL3063(PF13458)
326424.FRAAL1797(PF00296)
326424.FRAAL3499(PF04909)
326424.FRAAL0676(PF04909)
326424.FRAAL4309(PF06965)
326424.FRAAL6047(PF13361)
326424.FRAAL5559(PF01636)
326424.FRAAL4793(PF00296)
326424.FRAAL4791(PF00296)
326424.FRAAL4799(PF00296)
326424.FRAAL3305(PF00296)
326424.FRAAL4095(PF00296)
326424.FRAAL0658(PF04505)
326424.FRAAL0659(PF04505)
326424.FRAAL0656(PF02156)
326424.FRAAL4899(PF13087)
326424.FRAAL4884(PF00296)
326424.FRAAL5329(PF01636)
326424.FRAAL4150(PF00400)
326424.FRAAL3511(PF00296)
326424.FRAAL4451(PF00296)
326424.FRAAL0358(PF00296)
326424.FRAAL3722(PF00400)
326424.FRAAL3725(PF01636)
326424.FRAAL4068(PF13458)
326424.FRAAL0372(PF01234)
326424.FRAAL3884(PF01636)
326424.FRAAL1620(PF00102)
326424.FRAAL3709(PF00296)
326424.FRAAL5018PF13676
326424.FRAAL3147(PF00296)
326424.FRAAL3554(PF13458)
326424.FRAAL3559(PF01636)
326424.FRAAL4266(PF00296)
326424.FRAAL5245(PF01761)
326424.FRAAL0391(PF13458)
326424.FRAAL0801PF13676
326424.FRAAL4070(PF00698)
326424.FRAAL2893(PF13459)
326424.FRAAL2891(PF01636)
326424.FRAAL5384(PF00296)
326424.FRAAL0233(PF00296)
326424.FRAAL0234(PF00296)
326424.FRAAL2563(PF00698)
326424.FRAAL2560(PF00698)
326424.FRAAL3169(PF01636)
326424.FRAAL3161(PF03988)
326424.FRAAL1834PF13676

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================