Effective results for Burkholderia ambifaria AMMD (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 1187
- Predicted by EffectiveT3: 294 (high confidence), 440 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 24 within, 11 before, 47 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 103
- Predicted by EffectiveELD: 23 eukaryotic-like domains, contained in 326 proteins (3 high, 323 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): Type III, Type IV, Type VI

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
339670.Bamb_5219+(PF13609)ER
339670.Bamb_4999+(PF13609)ER
339670.Bamb_4482+(PF13609)ER
339670.Bamb_6314+(PF13609)(ER)
339670.Bamb_2629(PF08546) (PF02558)(ER)
339670.Bamb_2544+(ER)
339670.Bamb_5729(PF08546) (PF02558)ER
339670.Bamb_4106+(PF13609)ER; (ER)
339670.Bamb_5063(PF10282) (PF04185)ER
339670.Bamb_4203(PF08546) (PF02558)(ER)
339670.Bamb_5495(PF00126)(ER)
339670.Bamb_6042(PF00126)mitochondrial; (mitochondrial)
339670.Bamb_1067(>)(ER); (mitochondrial)
339670.Bamb_4041(PF00126)ER; (ER)
339670.Bamb_3236+ER
339670.Bamb_0021(PF13609)(ER)
339670.Bamb_0797(PF01165)(mitochondrial); (plastid)
339670.Bamb_6098(PF10282)(mitochondrial)
339670.Bamb_6321(PF13609)ER
339670.Bamb_4028(PF00126)mitochondrial
339670.Bamb_6157(PF13609)(ER)
339670.Bamb_6153(PF00126)mitochondrial
339670.Bamb_1514(PF10282)ER
339670.Bamb_3003(PF04185)(mitochondrial)
339670.Bamb_6521(PF12158)ER
339670.Bamb_6523(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_2181+ER
339670.Bamb_6449(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_1088+ER
339670.Bamb_2610+mitochondrial; (mitochondrial)
339670.Bamb_3564(PF13609)ER
339670.Bamb_0541(PF00375)ER
339670.Bamb_5082(PF00126)ER
339670.Bamb_6264+ER
339670.Bamb_2527(PF00126)(ER)
339670.Bamb_3045+mitochondrial; plastid
339670.Bamb_3601+(mitochondrial); (plastid)
339670.Bamb_3836(>)ER
339670.Bamb_2008+ER
339670.Bamb_4654+(ER)
339670.Bamb_1294+ER
339670.Bamb_3663(PF13609)(mitochondrial)
339670.Bamb_0500+(mitochondrial)
339670.Bamb_1102(>)ER
339670.Bamb_3852+(mitochondrial); plastid
339670.Bamb_3850+(ER)
339670.Bamb_2455(PF13609)ER
339670.Bamb_1045(PF04185)(mitochondrial)
339670.Bamb_6037(PF00126)(ER); ER
339670.Bamb_2275(<)ER
339670.Bamb_1464(>)(ER)
339670.Bamb_0751(<)ER
339670.Bamb_5393(PF00375)(ER); mitochondrial
339670.Bamb_1259+mitochondrial
339670.Bamb_1783+ER
339670.Bamb_6418(PF00126)ER
339670.Bamb_6419(PF00126)(mitochondrial); (plastid)
339670.Bamb_1137+ER
339670.Bamb_3332(PF00126)ER
339670.Bamb_3331(>)ER
339670.Bamb_4764(+)(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_4768(PF13609)ER
339670.Bamb_1271(PF00126)ER
339670.Bamb_3687(PF13609)ER
339670.Bamb_1138(PF00126)ER
339670.Bamb_6430+ER
339670.Bamb_5359(PF13609)ER
339670.Bamb_3742(PF13609)ER
339670.Bamb_3746+(ER)
339670.Bamb_1428(PF02010)(mitochondrial)
339670.Bamb_1424+(mitochondrial)
339670.Bamb_1840+(mitochondrial)
339670.Bamb_2744(>)ER
339670.Bamb_6456(+)(PF00126)mitochondrial; (mitochondrial)
339670.Bamb_5407+(>)(PF15984)
339670.Bamb_4701(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_3374(PF13609)ER
339670.Bamb_3375+(mitochondrial)
339670.Bamb_3975(PF13609)ER
339670.Bamb_2762+ER
339670.Bamb_3492(PF00126)mitochondrial; (mitochondrial)
339670.Bamb_4115+ER
339670.Bamb_1396+ER
339670.Bamb_5073(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_2708(PF13609)ER
339670.Bamb_0967+(mitochondrial); (plastid)
339670.Bamb_4136(PF00375)ER
339670.Bamb_1174+ER
339670.Bamb_3728(PF00126)mitochondrial; ER
339670.Bamb_1376(PF00126)mitochondrial; (mitochondrial)
339670.Bamb_4898(PF00126)ER; (ER)
339670.Bamb_4132(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_6122+(mitochondrial)
339670.Bamb_6126(PF10282)ER
339670.Bamb_1582(PF13609)ER
339670.Bamb_3456(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_2536+mitochondrial
339670.Bamb_5937(PF13609)ER
339670.Bamb_4245(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_3242(>)mitochondrial
339670.Bamb_2306+ER
339670.Bamb_5625(PF00375)ER
339670.Bamb_5488(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_1330+ER
339670.Bamb_1487(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_4237+mitochondrial; plastid
339670.Bamb_2326(>)ER
339670.Bamb_5755(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_1076(PF13609)(mitochondrial)
339670.Bamb_6318+(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_4036(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_4037(PF13609)ER
339670.Bamb_4038(>)(ER)
339670.Bamb_4781(PF13924)ER
339670.Bamb_6145+(mitochondrial); plastid
339670.Bamb_2341(PF15984)ER; (ER)
339670.Bamb_5998(PF00126)mitochondrial
339670.Bamb_0863(PF13609)ER
339670.Bamb_6338(>)(mitochondrial)
339670.Bamb_4011+ER
339670.Bamb_0488+(ER)
339670.Bamb_0482+ER
339670.Bamb_3015(PF13609)mitochondrial
339670.Bamb_4595(PF13609)ER
339670.Bamb_2191(PF10282)ER
339670.Bamb_4299(PF00126)mitochondrial
339670.Bamb_5526(PF00126)ER
339670.Bamb_4608(PF13609)ER
339670.Bamb_1895(>)ER
339670.Bamb_3035+ER
339670.Bamb_4926(PF00126)mitochondrial
339670.Bamb_0550+ER
339670.Bamb_5895(PF00126)mitochondrial; (mitochondrial)
339670.Bamb_5897(PF13609)mitochondrial
339670.Bamb_5092(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_4415(PF00126)(ER)
339670.Bamb_6256(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_6250(PF00375)ER
339670.Bamb_4436+mitochondrial; (mitochondrial)
339670.Bamb_4625(PF13609)ER
339670.Bamb_4629+(ER)
339670.Bamb_2830(>)(mitochondrial)
339670.Bamb_2928(PF00375)ER
339670.Bamb_6063(PF13609)ER
339670.Bamb_5704+mitochondrial
339670.Bamb_4472+ER
339670.Bamb_3848(PF13609)mitochondrial
339670.Bamb_0766(PF09286)ER
339670.Bamb_5111(PF03659)(mitochondrial)
339670.Bamb_4858(PF04185)(mitochondrial)
339670.Bamb_5850+mitochondrial
339670.Bamb_4328(PF13609)ER
339670.Bamb_6216(PF00375)ER
339670.Bamb_6215(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_1898(>)ER
339670.Bamb_1278(PF04185)ER
339670.Bamb_1240(PF13609)ER
339670.Bamb_4425(>)mitochondrial
339670.Bamb_2549+(mitochondrial); (plastid)
339670.Bamb_2890+ER
339670.Bamb_2935(PF00126)(ER)
339670.Bamb_4145(PF00126)mitochondrial
339670.Bamb_4146(PF00126)ER
339670.Bamb_4361(PF00126)mitochondrial
339670.Bamb_3755(PF04185)ER
339670.Bamb_1878+(mitochondrial)
339670.Bamb_3922(PF00126)ER
339670.Bamb_6427(PF00375)ER
339670.Bamb_0046(>)(mitochondrial)
339670.Bamb_1990(PF00126)mitochondrial; (mitochondrial)
339670.Bamb_0452(PF13609)ER
339670.Bamb_1857+(ER); (plastid)
339670.Bamb_3907(+)(PF00126)mitochondrial; (plastid)
339670.Bamb_1226+ER
339670.Bamb_2998(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_5060(PF00375)ER
339670.Bamb_4126(PF13609)ER; (ER)
339670.Bamb_4380+(ER)
339670.Bamb_3733(PF00126)mitochondrial; (mitochondrial)
339670.Bamb_1997+mitochondrial; (mitochondrial)
339670.Bamb_3948(PF00126)ER; (mitochondrial)
339670.Bamb_2715+mitochondrial
339670.Bamb_6481+(mitochondrial)
339670.Bamb_1620(PF00126)mitochondrial
339670.Bamb_5671(PF00126)mitochondrial; (mitochondrial)
339670.Bamb_5908(PF13609)mitochondrial
339670.Bamb_5423+ER
339670.Bamb_6344(>)ER
339670.Bamb_5712+(ER)
339670.Bamb_1647+ER
339670.Bamb_1917(PF13609)mitochondrial
339670.Bamb_4062(PF00126)(ER)
339670.Bamb_2913+ER
339670.Bamb_5949(PF00126)mitochondrial
339670.Bamb_4956+plastid
339670.Bamb_5573+(plastid)
339670.Bamb_1680+(mitochondrial)
339670.Bamb_0798(+)(ER)
339670.Bamb_4977(PF00126)(ER)
339670.Bamb_5981++
339670.Bamb_2638(PF00126)(plastid)
339670.Bamb_6528(PF08546) (PF02558)
339670.Bamb_0858+plastid
339670.Bamb_3589+(plastid)
339670.Bamb_4912(PF13609)(ER)
339670.Bamb_0065+(ER)
339670.Bamb_6059+(PF00126)
339670.Bamb_3625(+)(mitochondrial)
339670.Bamb_4933(+)(mitochondrial); (plastid)
339670.Bamb_5086+(mitochondrial)
339670.Bamb_4427(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_1551(+)(mitochondrial); plastid
339670.Bamb_2393(PF00126)(ER)
339670.Bamb_4643(PF00126)(ER)
339670.Bamb_0710(+)(ER)
339670.Bamb_3996(PF00126)(plastid)
339670.Bamb_2587(PF08546) (PF02558)
339670.Bamb_2215(PF00126)(ER)
339670.Bamb_3856++
339670.Bamb_0196(>)(mitochondrial)
339670.Bamb_0433+(mitochondrial)
339670.Bamb_6033(+)mitochondrial; plastid
339670.Bamb_0526+(plastid)
339670.Bamb_5821(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_4837+(plastid)
339670.Bamb_5802(PF01165)(plastid)
339670.Bamb_4294(+)ER
339670.Bamb_3339(PF00126)plastid
339670.Bamb_4812+(>)
339670.Bamb_3681+(plastid)
339670.Bamb_4971+(plastid)
339670.Bamb_4485(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_0670(+)(mitochondrial); (plastid)
339670.Bamb_4170(PF00126)(ER)
339670.Bamb_0615(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_4708+(plastid)
339670.Bamb_1614(PF00126)(ER)
339670.Bamb_0096(<)+
339670.Bamb_4397(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_0156+(plastid)
339670.Bamb_3186(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_5624+(ER)
339670.Bamb_6168++
339670.Bamb_3783(+)(ER)
339670.Bamb_2465+(ER)
339670.Bamb_4032+(PF00126)
339670.Bamb_5783(+)(mitochondrial)
339670.Bamb_0157(PF01165)(plastid)
339670.Bamb_0273(+)mitochondrial; (mitochondrial)
339670.Bamb_0487(>)(mitochondrial)
339670.Bamb_0072(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_2361(PF10282)(mitochondrial)
339670.Bamb_5740(+)mitochondrial; plastid
339670.Bamb_4295+(mitochondrial)
339670.Bamb_1887+plastid
339670.Bamb_2411+plastid
339670.Bamb_3631(+)(mitochondrial)
339670.Bamb_3052(PF13609)(ER)
339670.Bamb_5281(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_6067(+)mitochondrial; (plastid)
339670.Bamb_0398(+)(mitochondrial); (plastid)
339670.Bamb_1115+(plastid)
339670.Bamb_0769(+)(mitochondrial)
339670.Bamb_4647(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_6003++
339670.Bamb_3677+(plastid)
339670.Bamb_0373+(>)
339670.Bamb_0376+(>)
339670.Bamb_0519+(ER)
339670.Bamb_2055(+)(mitochondrial)
339670.Bamb_3651(+)mitochondrial
339670.Bamb_0680+(plastid)
339670.Bamb_1819(+)(ER)
339670.Bamb_2894+(mitochondrial)
339670.Bamb_2938+(plastid)
339670.Bamb_6511++
339670.Bamb_5360+(PF00126)
339670.Bamb_5174+(plastid)
339670.Bamb_4775+plastid
339670.Bamb_6421(PF08546) (PF02558)
339670.Bamb_3178(+)(ER)
339670.Bamb_3778+(ER)
339670.Bamb_1852(>)(plastid)
339670.Bamb_5415+PF07938
339670.Bamb_1416++
339670.Bamb_2551+(ER)
339670.Bamb_4738(PF00126)(plastid)
339670.Bamb_6469+(ER)
339670.Bamb_2129(+)(mitochondrial)
339670.Bamb_1014+(plastid)
339670.Bamb_2711(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_6480(+)(mitochondrial)
339670.Bamb_3199(PF00126)(mitochondrial)
339670.Bamb_2427+(mitochondrial)
339670.Bamb_1915(PF08546) (PF02558)
339670.Bamb_4691+(ER)
339670.Bamb_4201+(plastid)
339670.Bamb_5008(+)mitochondrial; (mitochondrial)
339670.Bamb_6111(PF00126)(ER)
339670.Bamb_6114(+)mitochondrial; (mitochondrial)
339670.Bamb_5948(+)ER
339670.Bamb_5947+(PF07080)
339670.Bamb_5498(PF04444)
339670.Bamb_1493(>)
339670.Bamb_6561+
339670.Bamb_0813(PF13518)
339670.Bamb_2671+
339670.Bamb_2675(>)
339670.Bamb_1064+
339670.Bamb_3232(+)(PF02566)
339670.Bamb_5793(PF02566)
339670.Bamb_6170+
339670.Bamb_1686+
339670.Bamb_1687+
339670.Bamb_2082(PF00126)
339670.Bamb_2339+
339670.Bamb_4560(PF00126)
339670.Bamb_5966(+)+
339670.Bamb_2532(PF00126)
339670.Bamb_2531(PF00126)
339670.Bamb_5216(PF04444)
339670.Bamb_6546(PF13816)
339670.Bamb_2658+
339670.Bamb_0497+
339670.Bamb_5702+
339670.Bamb_4979(PF00126)
339670.Bamb_4975(PF07080)
339670.Bamb_5778+
339670.Bamb_5774(PF00126)
339670.Bamb_5510+
339670.Bamb_6158+
339670.Bamb_6156+
339670.Bamb_0003+
339670.Bamb_0007+
339670.Bamb_3001+
339670.Bamb_0037(+)(ER)
339670.Bamb_2510(PF00126)
339670.Bamb_5235+
339670.Bamb_2632(PF00126)
339670.Bamb_6527(PF00126)
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339670.Bamb_0051+
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339670.Bamb_6512+
339670.Bamb_1778(+)(plastid)
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339670.Bamb_4363+
339670.Bamb_3679(+)plastid
339670.Bamb_3518(PF00126)
339670.Bamb_3516(+)+
339670.Bamb_0372+
339670.Bamb_0377+
339670.Bamb_5855+
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339670.Bamb_2053(>)
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339670.Bamb_5135+
339670.Bamb_2404+
339670.Bamb_2403+
339670.Bamb_1243(PF00126)
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339670.Bamb_3139+
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339670.Bamb_4309+
339670.Bamb_5304(PF00126)
339670.Bamb_1144(PF00126)
339670.Bamb_3301(PF09286)
339670.Bamb_3306(<)
339670.Bamb_2543+
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339670.Bamb_2898+
339670.Bamb_5612+
339670.Bamb_1267(PF02566)
339670.Bamb_0301+
339670.Bamb_0306+
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339670.Bamb_2247+
339670.Bamb_2240(PF00126)
339670.Bamb_2243+
339670.Bamb_5810+
339670.Bamb_5812(PF00126)
339670.Bamb_4366(+)(plastid)
339670.Bamb_2402+
339670.Bamb_1877+
339670.Bamb_1873+
339670.Bamb_1008(>)
339670.Bamb_4779+
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339670.Bamb_0108+
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339670.Bamb_0106(PF00126)
339670.Bamb_1220+
339670.Bamb_6198+
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339670.Bamb_2284(>)
339670.Bamb_6443(PF02566)
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339670.Bamb_0597+
339670.Bamb_0594(PF00126)
339670.Bamb_3158+
339670.Bamb_2994(PF00126)
339670.Bamb_5416(PF00126)
339670.Bamb_1832+
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339670.Bamb_0121(PF00126)
339670.Bamb_4735(+)plastid
339670.Bamb_4734+
339670.Bamb_4731+
339670.Bamb_3965+
339670.Bamb_3964(PF00126)
339670.Bamb_3962(PF00126)
339670.Bamb_2900(>)
339670.Bamb_3969(+)+
339670.Bamb_0313+
339670.Bamb_6467+
339670.Bamb_1603(PF00126)
339670.Bamb_1608(+)(ER)
339670.Bamb_0608+
339670.Bamb_5955(PF02566)
339670.Bamb_4122+
339670.Bamb_5951(PF07080)
339670.Bamb_5381(PF04185)
339670.Bamb_5389(PF00126)
339670.Bamb_5003(<)
339670.Bamb_5004+
339670.Bamb_1388+
339670.Bamb_2126+
339670.Bamb_0410+
339670.Bamb_5045+
339670.Bamb_4344+
339670.Bamb_2713(PF13518)
339670.Bamb_2712(PF00126)
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339670.Bamb_0972+
339670.Bamb_3444(PF00126)
339670.Bamb_1978(PF02566)
339670.Bamb_1979+
339670.Bamb_3198(PF04185)
339670.Bamb_3190(PF12158)
339670.Bamb_0084+
339670.Bamb_5677(+)(plastid)
339670.Bamb_4503(>)
339670.Bamb_1364+
339670.Bamb_6341(PF00126)
339670.Bamb_6347(>)
339670.Bamb_0167+
339670.Bamb_5710(<)
339670.Bamb_3273(+)(plastid)
339670.Bamb_3272(PF09286)
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339670.Bamb_4263+
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339670.Bamb_5025(PF14588)
339670.Bamb_2739+not used
339670.Bamb_0997+
339670.Bamb_2939+
339670.Bamb_4690+
339670.Bamb_4696(PF00126)
339670.Bamb_4527(PF00126)
339670.Bamb_1340+
339670.Bamb_1345(+)(ER)
339670.Bamb_5733(PF02566)
339670.Bamb_6585(PF04444)
339670.Bamb_4065+
339670.Bamb_3251+
339670.Bamb_3254(PF01165)
339670.Bamb_5007(PF00126)
339670.Bamb_5556(+)(plastid)
339670.Bamb_1130(PF00126)
339670.Bamb_3409(PF00126)
339670.Bamb_1934+
339670.Bamb_1935(+)(plastid)
339670.Bamb_0229(PF00126)
339670.Bamb_5635+
339670.Bamb_5637+
339670.Bamb_5943(PF00126)
339670.Bamb_5491(+)
339670.Bamb_4547(+)
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339670.Bamb_1284(+)
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339670.Bamb_1061(+)
339670.Bamb_3162(+)
339670.Bamb_3238(+)
339670.Bamb_4953(+)
339670.Bamb_4224(+)
339670.Bamb_4959(+)
339670.Bamb_5799(+)
339670.Bamb_5572(+)
339670.Bamb_5579(+)
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339670.Bamb_0246(+)
339670.Bamb_1041(+)
339670.Bamb_5965(+)
339670.Bamb_1306(+)
339670.Bamb_1301(+)
339670.Bamb_6544(+)
339670.Bamb_0498(+)
339670.Bamb_0499(+)
339670.Bamb_3211(+)
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339670.Bamb_6154(+)
339670.Bamb_1512(+)
339670.Bamb_0001(+)
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339670.Bamb_6055(+)
339670.Bamb_1709(+)
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339670.Bamb_6262(+)
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339670.Bamb_0734(+)
339670.Bamb_2521(+)
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339670.Bamb_0566(+)
339670.Bamb_0567(+)
339670.Bamb_0712+
339670.Bamb_3061(+)
339670.Bamb_4462(+)
339670.Bamb_3993(+)
339670.Bamb_3524(+)
339670.Bamb_1748(+)
339670.Bamb_0360(+)
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339670.Bamb_6227(+)
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339670.Bamb_0434(+)
339670.Bamb_3501(+)
339670.Bamb_0527(+)
339670.Bamb_5824(+)
339670.Bamb_3878(+)
339670.Bamb_5310(+)
339670.Bamb_2471(+)
339670.Bamb_1461(+)
339670.Bamb_1469(+)
339670.Bamb_3316(+)
339670.Bamb_6094(+)
339670.Bamb_5124(+)
339670.Bamb_6410(+)
339670.Bamb_5808(+)
339670.Bamb_3129(+)
339670.Bamb_2064(+)
339670.Bamb_2062(+)
339670.Bamb_5147(+)
339670.Bamb_5144(+)
339670.Bamb_2888(+)
339670.Bamb_4769(+)
339670.Bamb_1273(+)
339670.Bamb_0901(+)
339670.Bamb_0650(+)
339670.Bamb_1807(+)
339670.Bamb_4153(+)
339670.Bamb_3109(+)
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339670.Bamb_4481(+)
339670.Bamb_5680(+)
339670.Bamb_2443(+)
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339670.Bamb_3749(+)
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339670.Bamb_1427(+)
339670.Bamb_1421(+)
339670.Bamb_1846(+)
339670.Bamb_1059(+)
339670.Bamb_5167(+)
339670.Bamb_1216(+)
339670.Bamb_1211(+)
339670.Bamb_0923(+)
339670.Bamb_0921(+)
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339670.Bamb_0612(+)
339670.Bamb_3146(+)
339670.Bamb_3143(+)
339670.Bamb_3149(+)
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339670.Bamb_2156(+)
339670.Bamb_0132(+)
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339670.Bamb_5076(+)
339670.Bamb_5078(+)
339670.Bamb_2871(+)
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339670.Bamb_2875(+)
339670.Bamb_4135(+)
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339670.Bamb_0091(+)
339670.Bamb_5665(+)
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339670.Bamb_3729(+)
339670.Bamb_5313(+)
339670.Bamb_2130(+)
339670.Bamb_0158(+)
339670.Bamb_4890(+)
339670.Bamb_4895(+)
339670.Bamb_1943(+)
339670.Bamb_2726(+)
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339670.Bamb_6108(+)
339670.Bamb_1651(+)
339670.Bamb_2303(+)
339670.Bamb_2308(+)
339670.Bamb_5483(+)
339670.Bamb_2689(+)
339670.Bamb_4233(+)
339670.Bamb_2099(+)
339670.Bamb_0785(+)
339670.Bamb_0254(+)
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339670.Bamb_2468(+)
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339670.Bamb_2666(+)
339670.Bamb_3202(+)
339670.Bamb_4787(+)
339670.Bamb_5563(+)
339670.Bamb_5566(+)
339670.Bamb_2348(+)
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339670.Bamb_1734(+)
339670.Bamb_1738(+)
339670.Bamb_1739(+)
339670.Bamb_4013(+)
339670.Bamb_4010(+)
339670.Bamb_0481(+)
339670.Bamb_2487(+)
339670.Bamb_1504(+)
339670.Bamb_2366(+)
339670.Bamb_4506(+)
339670.Bamb_4593(+)
339670.Bamb_2627(+)
339670.Bamb_1712(+)
339670.Bamb_3578(+)
339670.Bamb_5748(+)
339670.Bamb_5528(+)
339670.Bamb_3033(+)
339670.Bamb_5263(+)
339670.Bamb_2410(+)
339670.Bamb_2607(+)
339670.Bamb_3638(+)
339670.Bamb_1775(+)
339670.Bamb_5098(+)
339670.Bamb_5093(+)
339670.Bamb_3825(+)
339670.Bamb_1546(+)
339670.Bamb_2018(+)
339670.Bamb_2011(+)
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339670.Bamb_0702(+)
339670.Bamb_4627(+)
339670.Bamb_5282(+)
339670.Bamb_3619(+)
339670.Bamb_3615(+)
339670.Bamb_1758(+)
339670.Bamb_3287(+)
339670.Bamb_0395(+)
339670.Bamb_0392(+)
339670.Bamb_0579(+)
339670.Bamb_0570(+)
339670.Bamb_0577(+)
339670.Bamb_0576(+)
339670.Bamb_3840(+)
339670.Bamb_1561(+)
339670.Bamb_6235(+)
339670.Bamb_2486(+)
339670.Bamb_4645(+)
339670.Bamb_4644(+)
339670.Bamb_4811(+)
339670.Bamb_2589(+)
339670.Bamb_0055(+)
339670.Bamb_4987(+)
339670.Bamb_4989(+)
339670.Bamb_5859(+)
339670.Bamb_5582(+)
339670.Bamb_2448(+)
339670.Bamb_6212(+)
339670.Bamb_6211(+)
339670.Bamb_4660(+)
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339670.Bamb_2876(+)
339670.Bamb_6026(+)
339670.Bamb_1797(+)
339670.Bamb_0683(+)
339670.Bamb_0681(+)
339670.Bamb_2261(+)
339670.Bamb_0536(+)
339670.Bamb_0532(+)
339670.Bamb_4307(+)
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339670.Bamb_2079(+)
339670.Bamb_2070(+)
339670.Bamb_1472(+)
339670.Bamb_1470(+)
339670.Bamb_1477(+)
339670.Bamb_4821(+)
339670.Bamb_4820(+)not used
339670.Bamb_2896(+)
339670.Bamb_2937(+)
339670.Bamb_0303(+)
339670.Bamb_0652(+)
339670.Bamb_2791(+)
339670.Bamb_6408(+)
339670.Bamb_0339(+)
339670.Bamb_2242(+)
339670.Bamb_1456(+)
339670.Bamb_1004(+)
339670.Bamb_4802(+)
339670.Bamb_4808(+)
339670.Bamb_0910(+)
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339670.Bamb_0043(+)
339670.Bamb_1999(+)
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339670.Bamb_0833(+)
339670.Bamb_6361(+)
339670.Bamb_1228(+)
339670.Bamb_1224(+)
339670.Bamb_0935(+)
339670.Bamb_4104(+)
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339670.Bamb_4103(+)
339670.Bamb_4108(+)
339670.Bamb_3150(+)
339670.Bamb_3156(+)
339670.Bamb_3159(+)
339670.Bamb_2995(+)
339670.Bamb_2991(+)
339670.Bamb_3710(+)
339670.Bamb_6290(+)
339670.Bamb_1417(+)
339670.Bamb_3365(+)
339670.Bamb_1178(+)
339670.Bamb_4737(+)
339670.Bamb_2901(+)
339670.Bamb_4123(+)
339670.Bamb_5952(+)
339670.Bamb_4387(+)
339670.Bamb_2978(+)
339670.Bamb_2976(+)
339670.Bamb_5478(+)
339670.Bamb_3736(+)
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339670.Bamb_1386(+)
339670.Bamb_1018(+)
339670.Bamb_1012(+)
339670.Bamb_4715(+)
339670.Bamb_4714(+)
339670.Bamb_4244(+)
339670.Bamb_4718(+)
339670.Bamb_3949(+)
339670.Bamb_1593(+)
339670.Bamb_1595(+)
339670.Bamb_0624(+)
339670.Bamb_3443(+)
339670.Bamb_5673(+)
339670.Bamb_5345(+)
339670.Bamb_2422(+)
339670.Bamb_4886(+)
339670.Bamb_4086(+)
339670.Bamb_5863(+)
339670.Bamb_2736(+)
339670.Bamb_6135(+)
339670.Bamb_0994(+)
339670.Bamb_1641(+)
339670.Bamb_3467(+)
339670.Bamb_5929(+)
339670.Bamb_1341(+)
339670.Bamb_1163(+)
339670.Bamb_2695(+)
339670.Bamb_4063(+)
339670.Bamb_5674(+)
339670.Bamb_3891(+)
339670.Bamb_3894(+)
339670.Bamb_6115(+)
339670.Bamb_3407(+)
339670.Bamb_3408(+)
339670.Bamb_2318(+)
339670.Bamb_4712(+)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
    Estimated copy number = 2.3 (23/10 KEGG proteins)
  • Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
    Estimated copy number = 0.6 (6/10 KEGG proteins)
  • Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
    Estimated copy number = 2.25 (18/8 KEGG proteins)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================