Effective results for Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 1360
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 188 eukaryotic-like domains, contained in 1360 proteins (454 high, 906 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): Type VI

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
378806.STAUR_5217(PF00698) (PF02801) (PF00550) (PF16197) (PF08659) (PF00109)(mitochondrial)
378806.STAUR_4836(PF02801) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF14765) (PF08659) (PF00109)(mitochondrial)
378806.STAUR_4829(PF02801) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF14765) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_1142(PF02801) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF14765) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_5218(PF02801) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF14765) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_5216(PF02801) (PF14765) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_5215(PF02801) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF14765) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_4838(PF02801) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF14765) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_4837(PF02801) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF14765) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_1458(PF00512) (PF13191) (PF02518) PF00069 (PF01590)ER
378806.STAUR_1685(PF02801) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF14765) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_5282(PF02801) (PF14765) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_4016(PF02801) (PF14765) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_4014(PF02801) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF14765) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_5221(PF02801) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF14765) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_3985(PF02801) (PF14765) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_3984(PF02801) (PF14765) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_3983(PF02801) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF14765) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_3982(PF02801) (PF14765) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_4801(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF13185)mitochondrial; (mitochondrial)
378806.STAUR_7809(PF00512) (PF02518) (PF13185) (PF08448)ER
378806.STAUR_4158(PF00698) (PF02801) (PF00550) (PF16197) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_7639(PF02518) (PF01590) PF00069 (PF13191)(mitochondrial)
378806.STAUR_1578(PF14765) (PF16197) (PF00109) (PF02801)(ER)
378806.STAUR_5219(PF02801) (PF14765) (PF00698) (PF00550) (PF16197) (PF00109)
378806.STAUR_6990(PF02128) (PF07504) PF02010 (PF02225)ER
378806.STAUR_5069(PF02128) (PF07504) PF02010 (PF02225)ER
378806.STAUR_7606(PF00512) (PF13492) (PF08448) (PF13185) (PF02518)(plastid)
378806.STAUR_4839(PF00698) (PF02801) (PF00550) (PF16197) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_4443(PF00512) (PF02518) (PF13185) (PF08448)ER
378806.STAUR_4205(PF00698) (PF02801) (PF00550) (PF16197) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_4018(PF00698) (PF00550) (PF00109) (PF16197) (PF02801)(mitochondrial)
378806.STAUR_4017(PF00698) (PF02801) (PF00550) (PF16197) (PF08659) (PF00109)
378806.STAUR_7112(PF01739) (PF02518) (PF00512) (PF00072) (PF08448)
378806.STAUR_4828(PF00698) (PF16197) (PF00109) (PF02801)(ER)
378806.STAUR_4840(PF02801) (PF00109) (PF16197) (PF00550)(ER)
378806.STAUR_0869(PF00512) (PF02518) (PF08448) (PF01590)(ER)
378806.STAUR_0388(PF00512) (PF02518) (PF08448) (PF00072) (PF13185)
378806.STAUR_4862(PF00512) (PF02518) (PF08448)ER
378806.STAUR_4293(PF00512) (PF02518) (PF01590)mitochondrial; (mitochondrial)
378806.STAUR_0633(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF13185) (PF01590)
378806.STAUR_4416(PF00158) (PF02954) (PF01590)(ER)
378806.STAUR_0221(PF00512) (PF02518) (PF08448)ER
378806.STAUR_4644(PF13540) (PF11617) (PF00415)ER
378806.STAUR_0566(PF00498) (PF00158) (PF01590)mitochondrial
378806.STAUR_3866(PF14200) (PF02055) (PF17189)(ER)
378806.STAUR_7016(PF00512) (PF02518) (PF01590) (PF00072) (PF08448)
378806.STAUR_0028(PF00512) (PF13191) (PF02518) PF00069 (PF01590)
378806.STAUR_8060(PF14200) PF05922 (PF00082)ER
378806.STAUR_3807(PF00512) (PF02518) (PF13185)ER
378806.STAUR_5932(PF07719) PF13432 PF13428ER
378806.STAUR_7568(PF00512) (PF02518) (PF08448) (PF13185) (PF00072)
378806.STAUR_7740PF13418 (PF13964) PF01344 (PF13415)(plastid)
378806.STAUR_0999(PF00512) (PF02518) (PF00072)ER
378806.STAUR_0990(PF00512) (PF13185) (PF08448)(ER)
378806.STAUR_4204(PF00698) (PF16197) (PF00550) (PF00109) (PF02801)
378806.STAUR_3019(PF00512) (PF02518) (PF13185) (PF00072)(ER)
378806.STAUR_7668(PF00512) (PF02518) (PF08448)mitochondrial
378806.STAUR_0820(PF00698) (PF00550) (PF00109) (PF16197) (PF02801)
378806.STAUR_4462(PF00512) (PF13191) (PF13185) PF00069 (PF02518)
378806.STAUR_7988(PF00512) (PF02518) (PF13185) PF00069 (PF13191)
378806.STAUR_1364(PF00512) (PF02518) (PF01590) PF00069 (PF13191)
378806.STAUR_4893(PF09118) PF13418 PF01344(ER)
378806.STAUR_4656PF13174 PF13432 PF13428ER
378806.STAUR_4227(PF00512) (PF02518) (PF00072)ER
378806.STAUR_0301(PF00512) (PF02518) (PF08448)(mitochondrial)
378806.STAUR_4560(PF00512) (PF13191) (PF02518) PF00069 (PF01590)
378806.STAUR_7060(PF00512) (PF02518) (PF00498) (PF00072) (PF08448)
378806.STAUR_8013(PF00512) (PF02518) (PF00072)(ER); ER
378806.STAUR_4485(PF00158) (PF13185) (PF02954)(mitochondrial)
378806.STAUR_4011(PF09118) PF01344 (PF07250)ER
378806.STAUR_6076(PF00512) (PF02518) (PF00072)ER
378806.STAUR_1273(PF00512) (PF02518) (PF01590) PF00069 (PF13191)
378806.STAUR_0024(PF00698) (PF00550) (PF00109) (PF16197) (PF02801)
378806.STAUR_7553(PF00512) (PF13492) (PF02518)ER
378806.STAUR_7083(PF00512) (PF02518) (PF00072)ER; (ER)
378806.STAUR_3517(PF00158) (PF02954) (PF01590)(ER)
378806.STAUR_8136(PF00512) (PF02518) (PF08448)ER
378806.STAUR_1413PF14008 (PF00754) (PF00149)ER
378806.STAUR_7795(PF00512) (PF02518) (PF08448)ER
378806.STAUR_4800(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_1951PF13432 (PF14559)ER
378806.STAUR_6455(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_4585(PF01739) (PF14559)(mitochondrial)
378806.STAUR_3950PF13174 (PF13176) PF13432 (PF14559)
378806.STAUR_1163PF05922 (PF00082)ER
378806.STAUR_1167(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_0106(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF01590)
378806.STAUR_7451(PF00512) (PF02518) (PF13185) (PF01590)
378806.STAUR_7636(PF00754) (PF07971)ER
378806.STAUR_7439(PF02518) (PF01590) PF00069 (PF13191)
378806.STAUR_7389(PF13768) (PF08487)ER
378806.STAUR_4470(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF08448)
378806.STAUR_6339PF13174 PF13432ER
378806.STAUR_3677PF13418 PF01344ER
378806.STAUR_5829(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_2103(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_1574(PF00698) (PF16197) (PF00109) (PF02801)
378806.STAUR_5453(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_0959(PF00686) PF03423ER
378806.STAUR_0751(PF00512) (PF13492) (PF02518) (PF08448)
378806.STAUR_1837(PF00512) (PF02518)mitochondrial; (mitochondrial)
378806.STAUR_1169(PF00512) (PF02518) (PF13185) (PF00072)
378806.STAUR_2801(PF07719) PF13432ER
378806.STAUR_5413(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF01590)
378806.STAUR_5412PF13432 (PF14559)ER
378806.STAUR_4908(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_2302(PF01553) (PF07993) (PF00550) (PF03015)
378806.STAUR_5626(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_7070PF05922 (PF00082)ER; (ER)
378806.STAUR_6528(PF04734) (PF17048)ER
378806.STAUR_4212(PF00675) (PF05193)(mitochondrial)
378806.STAUR_6958(PF00512) (PF02518) (PF13185) (PF00072)
378806.STAUR_4003(PF14200) (PF00182)ER
378806.STAUR_1186(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_8390(PF00675) (PF05193)(mitochondrial)
378806.STAUR_4760PF13174 PF13432ER
378806.STAUR_1040PF14099 (PF00754)ER
378806.STAUR_6243PF05922 (PF00082)ER
378806.STAUR_7261PF10287 PF10290ER; (ER)
378806.STAUR_3349PF13432 (PF14559)ER
378806.STAUR_4536(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_1707(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_5913PF13174 PF13432ER
378806.STAUR_0031(PF00675) (PF05193)ER
378806.STAUR_6706(PF02518) (PF00072)ER; (ER)
378806.STAUR_1283(PF00512) (PF02518) (PF13185) (PF08448)
378806.STAUR_2889PF05922 (PF00082)ER
378806.STAUR_6568(PF00512) (PF02518) (PF13185) (PF01590)
378806.STAUR_2886(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF08448)
378806.STAUR_5936(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_7897(PF00512) (PF02518) (PF00072)(plastid)
378806.STAUR_7541(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_7090PF02412 PF13948ER
378806.STAUR_2069(PF16864) (PF00891)ER
378806.STAUR_7959(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF08448)
378806.STAUR_0032(PF00675) (PF05193)ER
378806.STAUR_7741PF13418 PF01344ER
378806.STAUR_0991(PF00512) (PF02518) (PF08448)(ER)
378806.STAUR_8145(PF00512) (PF02518) (PF13185) (PF00072)
378806.STAUR_1766PF13418 PF01344ER
378806.STAUR_7506PF05922 (PF00082)ER
378806.STAUR_8087(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_1021(PF02518) (PF13185) PF00069 (PF13191)
378806.STAUR_0176(PF04389) (PF02225)(mitochondrial)
378806.STAUR_5099(PF02518) (PF13185) PF00069 (PF13191)
378806.STAUR_0316(PF00072) (PF00211)(ER)
378806.STAUR_1782(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_4757(PF00754) (PF07971)(mitochondrial)
378806.STAUR_7785(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF01590)
378806.STAUR_8070(PF00512) (PF13492) (PF02518) (PF01590)
378806.STAUR_6447(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_3955(PF04389) (PF02225)ER
378806.STAUR_2687PF13174 PF13432ER
378806.STAUR_5194(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_0472PF13432 (PF14559)ER
378806.STAUR_0479(PF02225) (PF00082)ER
378806.STAUR_7462(PF00675) (PF05193)ER
378806.STAUR_7461(PF00675) (PF05193)ER
378806.STAUR_0493(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF08448)
378806.STAUR_1534(PF02055) (PF17189)mitochondrial
378806.STAUR_8287PF13432 (PF14559)(ER)
378806.STAUR_1875(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_6173PF05922 (PF00082)ER
378806.STAUR_6172(PF00675) (PF05193)ER
378806.STAUR_6171(PF00675) (PF05193)ER
378806.STAUR_3428(PF14200) (PF16483)(mitochondrial); (ER)
378806.STAUR_4617(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_0381PF05270 (PF03663)ER
378806.STAUR_7421(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_0510PF13418 PF01344ER
378806.STAUR_5801(PF14200) (PF00314)ER
378806.STAUR_0728(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_6630(PF00158) PF16697 (PF02954)plastid
378806.STAUR_6631PF14099 (PF00754)ER
378806.STAUR_5111PF13174 PF13432ER
378806.STAUR_4790(PF00158) PF16697 (PF13185)(ER)
378806.STAUR_7219(PF00512) (PF02518)mitochondrial
378806.STAUR_7211(PF00498) (PF00211) (PF01590)(ER)
378806.STAUR_2338PF16403 PF02494ER
378806.STAUR_1171(PF00512) (PF02518) (PF00072)(plastid)
378806.STAUR_0559(PF02225) (PF00082)ER
378806.STAUR_3168(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF08448)
378806.STAUR_3313PF14008 (PF00149)ER
378806.STAUR_0269(PF00512) (PF02518) (PF01590)(plastid)
378806.STAUR_0267(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF01590)
378806.STAUR_3768PF13432 (PF14559)mitochondrial; ER
378806.STAUR_6881PF00069 PF13432(mitochondrial)
378806.STAUR_4951PF05922 (PF00082)ER
378806.STAUR_7591PF16403 PF02494ER
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378806.STAUR_7046(PF00512) (PF02518) (PF01590)(plastid)
378806.STAUR_7043(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_5925(PF00512) (PF02518)ER
378806.STAUR_5926PF05922 (PF00082)ER; (ER)
378806.STAUR_0500(PF00512) (PF02518) (PF13185) (PF08448)
378806.STAUR_7948(PF13191) PF00069(mitochondrial); (plastid)
378806.STAUR_1486(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF08448)
378806.STAUR_5909(PF13768) (PF08487)ER
378806.STAUR_7556(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF08448)
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378806.STAUR_5537(PF00512) (PF02518)(mitochondrial)
378806.STAUR_5300(PF02128) (PF02225)ER
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378806.STAUR_3023PF05922 (PF00082)ER; (ER)
378806.STAUR_7822(PF00512) (PF02518) (PF00072) (PF08448)
378806.STAUR_0856(PF00512) (PF02518) (PF00072)(plastid)
378806.STAUR_4803PF13432ER
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378806.STAUR_1954PF13432ER
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378806.STAUR_4820(PF00512) (PF02518) (PF00072)
378806.STAUR_6430(PF01553)ER
378806.STAUR_0966PF02412ER
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378806.STAUR_1850PF14921ER
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378806.STAUR_0132(PF12158)ER
378806.STAUR_2244(PF01553)ER
378806.STAUR_1449PF05270mitochondrial
378806.STAUR_4367(PF13646)ER
378806.STAUR_7155(PF00512) (PF02518) (PF00072)
378806.STAUR_5805(PF00158)(ER)
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378806.STAUR_0524(PF03663)ER
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378806.STAUR_4473PF02494ER
378806.STAUR_6651(PF00754)ER
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378806.STAUR_5655PF13432ER
378806.STAUR_6629PF00069mitochondrial
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378806.STAUR_4271(PF13191) PF00069 (PF00211)
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378806.STAUR_4439(PF01553)ER
378806.STAUR_0972(PF07719)ER
378806.STAUR_0222(PF00158) (PF00072) (PF02954)
378806.STAUR_3475(PF00211)(mitochondrial); mitochondrial
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378806.STAUR_1514(PF14200)ER
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378806.STAUR_5788(PF13646)ER
378806.STAUR_4430(PF00498) (PF00211) (PF01590)
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378806.STAUR_3841PF13432mitochondrial
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378806.STAUR_4236(PF14559)ER
378806.STAUR_4230PF05270ER
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378806.STAUR_7228(PF02446)ER
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378806.STAUR_7073(PF01553)mitochondrial
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378806.STAUR_0663(PF07971)ER
378806.STAUR_3363(PF04389)ER
378806.STAUR_2365PF07821ER
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378806.STAUR_0584(PF00163)mitochondrial
378806.STAUR_7056PF14099ER
378806.STAUR_3808PF13174(ER)
378806.STAUR_4763(PF00512) (PF02518) (PF08448)
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378806.STAUR_7266(PF08757)(ER); ER
378806.STAUR_3342(PF15780)ER
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378806.STAUR_5950(PF13646)ER
378806.STAUR_1706(PF00158) (PF00072) (PF02954)
378806.STAUR_3750(PF00253)mitochondrial; (mitochondrial)
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378806.STAUR_5031(PF13646)ER
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378806.STAUR_6855(PF00072)(ER)
378806.STAUR_6507(PF09118)ER
378806.STAUR_1723(PF00722)ER
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378806.STAUR_5055(PF00226)ER
378806.STAUR_4189PF13813ER
378806.STAUR_3070(PF14559)ER
378806.STAUR_3072(PF13205)ER
378806.STAUR_7563(PF00512) (PF02518) (PF00072)
378806.STAUR_6755(PF03571)ER
378806.STAUR_1243(PF11617)ER
378806.STAUR_8088(PF00158) (PF00072) (PF02954)
378806.STAUR_2452(PF00092)(ER)
378806.STAUR_6488(PF02374)(mitochondrial)
378806.STAUR_2901PF03283ER
378806.STAUR_8144(PF00512) (PF02518) (PF00072)
378806.STAUR_5256(PF00512) (PF02518) (PF00072)
378806.STAUR_5255PF01744(mitochondrial)
378806.STAUR_7504(PF02518)ER
378806.STAUR_3269(PF00082)(mitochondrial)
378806.STAUR_5890(PF00158) (PF00072) (PF02954)
378806.STAUR_7334(PF00722)ER
378806.STAUR_6467(PF13646)ER
378806.STAUR_3524(PF00149)ER
378806.STAUR_5331(PF07971)mitochondrial; ER
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378806.STAUR_1784(PF11617)ER
378806.STAUR_0433(PF04389)ER; (ER)
378806.STAUR_7786(PF02518) (PF01590)(ER)
378806.STAUR_3203(PF00512) (PF02518) (PF13185)
378806.STAUR_6072(PF00512) (PF02518) (PF00072)
378806.STAUR_6071(PF00158) (PF00072) (PF02954)
378806.STAUR_1848(PF00415)ER
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378806.STAUR_8103PF13432ER
378806.STAUR_2582(PF13646)(ER)
378806.STAUR_6002(PF02518)ER
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378806.STAUR_1880(PF00512) (PF02518) (PF00072)
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378806.STAUR_0864(PF01739)ER
378806.STAUR_0685PF16403ER
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378806.STAUR_0983PF16403(ER); ER
378806.STAUR_6427(PF00082)mitochondrial
378806.STAUR_2219PF13948ER
378806.STAUR_2211(PF03663)ER
378806.STAUR_5773PF00069(mitochondrial)
378806.STAUR_1431(PF01553)mitochondrial
378806.STAUR_5067PF02010(ER); ER
378806.STAUR_4167(PF00149)mitochondrial
378806.STAUR_4388(PF13191) PF00069 (PF00211)
378806.STAUR_4833(PF02374)mitochondrial
378806.STAUR_5710(PF00891)(mitochondrial)
378806.STAUR_0498PF00069mitochondrial; (mitochondrial)
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378806.STAUR_7622(PF13598)(mitochondrial)
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378806.STAUR_6174PF02412(ER)
378806.STAUR_6284(PF14521)(ER)
378806.STAUR_6283(PF14521)ER
378806.STAUR_5807(PF02518)(mitochondrial)
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378806.STAUR_0702(PF01553)(ER); ER
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378806.STAUR_3936(PF00149)(ER)
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378806.STAUR_1862(PF00158) (PF00072) (PF02954)
378806.STAUR_6341(PF00092)mitochondrial
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378806.STAUR_1397(PF00512) (PF02518) (PF00072)
378806.STAUR_4875(PF16864) (PF00891)(ER)
378806.STAUR_7395(PF00498)mitochondrial; plastid
378806.STAUR_3095(PF02518)ER; (mitochondrial)
378806.STAUR_3895(PF13205)ER
378806.STAUR_6800(PF00072)(ER)
378806.STAUR_4406(PF00512) (PF02518) (PF08448)
378806.STAUR_0729(PF00092)ER
378806.STAUR_7188(PF00498) (PF00158) (PF02954)
378806.STAUR_1800(PF15780)ER
378806.STAUR_3667(PF00754)ER
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378806.STAUR_2137(PF05684)ER
378806.STAUR_2131PF14099ER
378806.STAUR_4324(PF00012)(mitochondrial); (plastid)
378806.STAUR_0313PF02412(ER)
378806.STAUR_4670PF04706ER
378806.STAUR_4895PF05270ER
378806.STAUR_3875(PF00512) (PF02518) (PF00072)
378806.STAUR_6795(PF00072)(mitochondrial)
378806.STAUR_1569(PF12706)(mitochondrial)
378806.STAUR_3392(PF00413)ER
378806.STAUR_3937(PF13483)mitochondrial
378806.STAUR_7210(PF00211) PF00069 (PF00072)
378806.STAUR_1821PF16403ER
378806.STAUR_3686PF13432ER
378806.STAUR_1359PF05270ER
378806.STAUR_2158(PF00512) (PF02518) (PF08448)
378806.STAUR_1175(PF00722)(mitochondrial)
378806.STAUR_1170(PF00512) (PF02518) (PF00072)
378806.STAUR_0084PF16403(ER); plastid
378806.STAUR_3145PF16403ER
378806.STAUR_7238PF00069mitochondrial
378806.STAUR_7237(PF00092)ER
378806.STAUR_7233PF01357ER
378806.STAUR_1961(PF14200)ER
378806.STAUR_2318(PF09822)ER
378806.STAUR_6675(PF13176)ER
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378806.STAUR_0208(PF02518)(mitochondrial)
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378806.STAUR_5329(PF13374) PF00069
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378806.STAUR_1580(PF14765)
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378806.STAUR_6490PF13432
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378806.STAUR_8131(PF08443)
378806.STAUR_1779PF00069
378806.STAUR_7513(PF02518)not used
378806.STAUR_0874(PF01739)
378806.STAUR_2761(PF00550)
378806.STAUR_5247(PF13646)
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378806.STAUR_6065(PF09346)
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378806.STAUR_4687(PF00072)
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378806.STAUR_5889(PF00512)
378806.STAUR_7655(PF00415)
378806.STAUR_7654(PF13304)
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378806.STAUR_6470(PF00012)
378806.STAUR_3020(PF01739)
378806.STAUR_1976PF00069
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378806.STAUR_7533(PF00226)
378806.STAUR_0447(PF00072)
378806.STAUR_7797PF00069
378806.STAUR_3238(PF03169)
378806.STAUR_3233(PF01959)
378806.STAUR_3232(PF07993)
378806.STAUR_3493(PF01916)
378806.STAUR_3941(PF00498)
378806.STAUR_5538(PF00012)
378806.STAUR_4112(PF13640)
378806.STAUR_1097(PF06541)
378806.STAUR_1633PF00069
378806.STAUR_4373(PF00149)
378806.STAUR_0323(PF06541)
378806.STAUR_0859(PF00072)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: NO (FDR = 12.5 %)
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
    Estimated copy number = 23.125 (185/8 KEGG proteins)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
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