Effective results for Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 866
- Predicted by EffectiveT3: 190 (high confidence), 263 (low confidence)
- Predicted by EffectiveCCBD: 9 within, 7 before, 22 behind expected region 25..70aa
- Predicted by T4SEpre: 53
- Predicted by EffectiveELD: 34 eukaryotic-like domains, contained in 351 proteins (297 high, 54 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): Type III, (Type IV), Type VI

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
383407.Xoryp_010100018580(PF14686) (PF09284) (PF14683)ER
383407.Xoryp_010100021005+PF13276 PF00665(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100010665PF13683 PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100002605(PF13551) (PF13592)(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100021785(+)PF13936 PF00665(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100008415(PF13551) (PF13592)mitochondrial
383407.Xoryp_010100006555PF13683 PF13276mitochondrial
383407.Xoryp_010100020210PF01609 PF05598mitochondrial
383407.Xoryp_010100003645PF13276 PF00665mitochondrial
383407.Xoryp_010100020355PF01609 PF05598mitochondrial
383407.Xoryp_010100021635(+)PF13936 PF00665(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100005510PF13683 PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100002460+mitochondrial
383407.Xoryp_010100000035(PF09295)ER
383407.Xoryp_010100022360PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100003080(PF00930)ER
383407.Xoryp_010100022560PF00665(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100013595PF01745(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100002595PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100016615PF13683 PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100014775+ER
383407.Xoryp_010100000140+ER
383407.Xoryp_010100011520+(>)plastid
383407.Xoryp_010100009735+ER
383407.Xoryp_010100009020PF13683mitochondrial; (mitochondrial)
383407.Xoryp_010100009110+(mitochondrial); plastid
383407.Xoryp_010100005755(>)ER
383407.Xoryp_010100009840(>)ER
383407.Xoryp_010100007055(>)ER
383407.Xoryp_010100002620+(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100012280PF13276mitochondrial
383407.Xoryp_010100011540(>)ER
383407.Xoryp_010100003320(PF08212)ER
383407.Xoryp_010100007265+mitochondrial
383407.Xoryp_010100016715PF13683 PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100008315PF13683 PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100016010(>)(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100002000+(PF01419)(plastid)
383407.Xoryp_010100021220+ER
383407.Xoryp_010100006495PF01609mitochondrial
383407.Xoryp_010100000335PF05598mitochondrial
383407.Xoryp_010100013915+ER
383407.Xoryp_010100007020+ER
383407.Xoryp_010100002125(PF00930)ER
383407.Xoryp_010100002300PF05598ER
383407.Xoryp_010100002270PF13683 PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100014255PF13683 PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100017500PF13683 PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100005520+mitochondrial
383407.Xoryp_010100019640+(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100020340(PF00930)ER
383407.Xoryp_010100010195(>)ER
383407.Xoryp_010100020295+mitochondrial
383407.Xoryp_010100012045PF05598ER
383407.Xoryp_010100019830+(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100000590+ER
383407.Xoryp_010100009360(PF00930)(mitochondrial); (plastid)
383407.Xoryp_010100023065PF05598ER
383407.Xoryp_010100022000+(mitochondrial); plastid
383407.Xoryp_010100003055(<)ER; (ER)
383407.Xoryp_010100018430+ER
383407.Xoryp_010100008540+ER
383407.Xoryp_010100007570+ER
383407.Xoryp_010100007600PF13683 PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100020090PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100010680PF13683 PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100009175(PF08212)ER
383407.Xoryp_010100005190PF12762(mitochondrial); (plastid)
383407.Xoryp_010100020870(>)ER
383407.Xoryp_010100016335(PF02685)ER
383407.Xoryp_010100011865(PF06884)ER
383407.Xoryp_010100020065(PF13332)mitochondrial
383407.Xoryp_010100021640PF12762(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100000170PF13936 PF00665(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100009140(PF01963)ER
383407.Xoryp_010100008635+(mitochondrial); (plastid)
383407.Xoryp_010100007755+(mitochondrial); (plastid)
383407.Xoryp_010100000160PF00665(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100021675PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100004000(>)ER
383407.Xoryp_010100005660+(ER)
383407.Xoryp_010100018900(PF14307)(ER); (mitochondrial)
383407.Xoryp_010100012315+ER
383407.Xoryp_010100002400(PF07653)mitochondrial
383407.Xoryp_010100019870PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100001715+(>)(plastid)
383407.Xoryp_010100016315(PF10142)ER
383407.Xoryp_010100022575(PF08212)ER
383407.Xoryp_010100017865+(ER)
383407.Xoryp_010100002380PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100000850PF13683(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100001140PF13683(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100002560+(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100019995PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100005260PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100005000+(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100001035+plastid
383407.Xoryp_010100019430+plastid
383407.Xoryp_010100012625PF13683(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100011530+mitochondrial
383407.Xoryp_010100022565PF12762(ER)
383407.Xoryp_010100018675(PF13551) (PF13592)
383407.Xoryp_010100017095+(plastid)
383407.Xoryp_010100000995PF01609(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100016470+plastid
383407.Xoryp_010100002600PF13683(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100001485PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100001480PF12762(ER)
383407.Xoryp_010100020020PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100009580+plastid
383407.Xoryp_010100002485++
383407.Xoryp_010100020155PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100010295+(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100000195PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100013815(+)ER
383407.Xoryp_010100000985PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100005240PF13276 PF00665
383407.Xoryp_010100019880PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100008645+(plastid)
383407.Xoryp_010100017835PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100014635PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100013820+(plastid)
383407.Xoryp_010100022235PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100015230PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100012510PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100004400+(plastid)
383407.Xoryp_010100004325+plastid
383407.Xoryp_010100012860PF12762(ER)
383407.Xoryp_010100018610PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100007690PF13276 PF00665
383407.Xoryp_010100005235+(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100020000PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100020005PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100005765++
383407.Xoryp_010100011435PF12762(ER)
383407.Xoryp_010100000080PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100013940(+)(ER)
383407.Xoryp_010100012165PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100022205PF01609(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100018605PF12762(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100007505++
383407.Xoryp_010100019950PF01527 PF13683
383407.Xoryp_010100021780PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100017395PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100008405PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100020165PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100020160PF13683(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100004225(PF11539)(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100011970PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100011415(+)ER
383407.Xoryp_010100021225(+)ER; (ER)
383407.Xoryp_010100017490(>)(ER)
383407.Xoryp_010100001445+(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100002310PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100002315PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100017380PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100021315PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100021485PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100001205PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100004945(+)(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100009325+plastid
383407.Xoryp_010100009525PF13683 PF13276
383407.Xoryp_010100003835PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100020990+(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100012145PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100007845PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100019975PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100019970PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100016135+plastid
383407.Xoryp_010100021760PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100017285PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100021765PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100006550PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100010955+plastid
383407.Xoryp_010100010335PF13276 PF00665
383407.Xoryp_010100016735PF13683(mitochondrial); not used
383407.Xoryp_010100006170PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100010175(PF01963)(ER)
383407.Xoryp_010100012930PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100008330PF13276 PF00665
383407.Xoryp_010100014095PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100013990PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100012155PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100019030PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100007160PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100021370(+)(mitochondrial); (plastid)
383407.Xoryp_010100017610(>)(ER)
383407.Xoryp_010100012900PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100012905PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100014710PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100021680PF13683(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100015045+(plastid)
383407.Xoryp_010100012125PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100016935PF13276(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100021745PF13276 PF00665
383407.Xoryp_010100018510++
383407.Xoryp_010100002695(+)mitochondrial
383407.Xoryp_010100002825+(plastid)
383407.Xoryp_010100011625PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100001175PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100002195PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100010130+plastid
383407.Xoryp_010100006745PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100000800PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100001330+(plastid)
383407.Xoryp_010100020085PF13683(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100001755(+)ER; (ER)
383407.Xoryp_010100009295(PF00930)(ER)
383407.Xoryp_010100020240(+)(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100014045PF13683(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100020860(PF13551) (PF13592)
383407.Xoryp_010100015935+(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100003050PF13683 PF13276
383407.Xoryp_010100011810(PF13551) (PF13592)
383407.Xoryp_010100007110PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100006510PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100017315PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100017310PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100009990(+)mitochondrial
383407.Xoryp_010100012840PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100000215PF13276mitochondrial; not used
383407.Xoryp_010100008370PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100004805(+)ER
383407.Xoryp_010100000365PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100021935+(plastid)
383407.Xoryp_010100014855(+)ER; (ER)
383407.Xoryp_010100023010PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100003595PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100015140PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100012200PF12762(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100012205PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100018755(+)mitochondrial; (mitochondrial)
383407.Xoryp_010100011860PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100022120+(>)
383407.Xoryp_010100006500PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100017305PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100010830(+)(ER); plastid
383407.Xoryp_010100007630PF13276 PF00665
383407.Xoryp_010100006430+(PF09994)
383407.Xoryp_010100006340PF01609 PF01527
383407.Xoryp_010100000825PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100007120(PF13551) (PF13592)
383407.Xoryp_010100021730PF13276 PF00665
383407.Xoryp_010100012875PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100001190PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100017785PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100009145(PF01963)(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100020115PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100009385PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100022025+(plastid)
383407.Xoryp_010100022355PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100003145PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100011875PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100003765+(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100017840PF13683(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100006080PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100001160PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100001165PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100006715PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100016190PF12762(plastid)
383407.Xoryp_010100009550PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100000380PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100020105PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100014070(PF13551) (PF13592)
383407.Xoryp_010100012885PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100019305(<)+
383407.Xoryp_010100022345PF13936 PF00665
383407.Xoryp_010100016940PF13683(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100011515+plastid
383407.Xoryp_010100011845PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100019690PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100011560+(plastid)
383407.Xoryp_010100000155PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100009015PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100000710(PF08975)(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100001380(+)ER
383407.Xoryp_010100021415+(plastid)
383407.Xoryp_010100001005PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100005385PF12762(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100018865(+)(mitochondrial); (plastid)
383407.Xoryp_010100014000PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100012745(+)mitochondrial; (mitochondrial)
383407.Xoryp_010100018480PF01609 PF05598
383407.Xoryp_010100002385(+)+
383407.Xoryp_010100007495+
383407.Xoryp_010100021870+
383407.Xoryp_010100018260+
383407.Xoryp_010100016620(+)PF01527
383407.Xoryp_010100009710+
383407.Xoryp_010100010660PF01527
383407.Xoryp_010100015380+
383407.Xoryp_010100000630PF01609
383407.Xoryp_010100005460+
383407.Xoryp_010100021690PF13936
383407.Xoryp_010100020055+(PF13332)
383407.Xoryp_010100020905(+)(ER)
383407.Xoryp_010100020125PF00665
383407.Xoryp_010100015895+
383407.Xoryp_010100005485+
383407.Xoryp_010100019185+
383407.Xoryp_010100003390+
383407.Xoryp_010100015560+
383407.Xoryp_010100019210PF05598
383407.Xoryp_010100022365PF01527
383407.Xoryp_010100019435+not used
383407.Xoryp_010100015745PF01527
383407.Xoryp_010100014610PF01527not used
383407.Xoryp_010100001490(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100012400PF00665
383407.Xoryp_010100003170PF01609
383407.Xoryp_010100019725(+)plastid
383407.Xoryp_010100007735+
383407.Xoryp_010100018670+
383407.Xoryp_010100012750+
383407.Xoryp_010100009820+
383407.Xoryp_010100017870+
383407.Xoryp_010100021260(+)(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100000865PF01527not used
383407.Xoryp_010100021040PF05598
383407.Xoryp_010100002590PF01527
383407.Xoryp_010100021045PF01609
383407.Xoryp_010100001150PF01527
383407.Xoryp_010100001470+
383407.Xoryp_010100002480+
383407.Xoryp_010100009725(PF07819)
383407.Xoryp_010100010615+
383407.Xoryp_010100001735(+)(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100000730+
383407.Xoryp_010100002915+
383407.Xoryp_010100009585PF01609
383407.Xoryp_010100020150PF13276
383407.Xoryp_010100011420+
383407.Xoryp_010100008270+
383407.Xoryp_010100018270+
383407.Xoryp_010100019225(>)
383407.Xoryp_010100022885PF12762
383407.Xoryp_010100014590(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100014595PF01609
383407.Xoryp_010100018840+
383407.Xoryp_010100022225PF01609
383407.Xoryp_010100012185PF00665
383407.Xoryp_010100012615PF12762
383407.Xoryp_010100019400+
383407.Xoryp_010100001905+
383407.Xoryp_010100016040+not used
383407.Xoryp_010100020345+
383407.Xoryp_010100018825(>)
383407.Xoryp_010100021035PF00665
383407.Xoryp_010100002295PF00665
383407.Xoryp_010100005245PF01527
383407.Xoryp_010100005935+
383407.Xoryp_010100020030(PF13332)
383407.Xoryp_010100002900+not used
383407.Xoryp_010100009025PF01527
383407.Xoryp_010100020145PF01527
383407.Xoryp_010100020810(<)
383407.Xoryp_010100004750+
383407.Xoryp_010100000185+
383407.Xoryp_010100003725PF00665
383407.Xoryp_010100017830PF01527
383407.Xoryp_010100005390+
383407.Xoryp_010100011550+
383407.Xoryp_010100022230PF05598
383407.Xoryp_010100012770(PF02685)
383407.Xoryp_010100012515PF01527
383407.Xoryp_010100015330(>)
383407.Xoryp_010100007870PF17067
383407.Xoryp_010100002025PF12762
383407.Xoryp_010100006580+
383407.Xoryp_010100017810+
383407.Xoryp_010100007475+
383407.Xoryp_010100002110+
383407.Xoryp_010100002335PF00665
383407.Xoryp_010100001200(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100021840+
383407.Xoryp_010100017255+
383407.Xoryp_010100021845(+)plastid
383407.Xoryp_010100021440+
383407.Xoryp_010100005835+
383407.Xoryp_010100008870(PF06189)
383407.Xoryp_010100021155+
383407.Xoryp_010100019890+
383407.Xoryp_010100000660PF05598
383407.Xoryp_010100000405+
383407.Xoryp_010100017555+
383407.Xoryp_010100020175PF13683
383407.Xoryp_010100010145+
383407.Xoryp_010100008090+not used
383407.Xoryp_010100005280+
383407.Xoryp_010100022200PF05598
383407.Xoryp_010100008065+not used
383407.Xoryp_010100001065+
383407.Xoryp_010100015710+
383407.Xoryp_010100013555+
383407.Xoryp_010100002755(PF13551)
383407.Xoryp_010100007510(PF09994)
383407.Xoryp_010100002320PF01527
383407.Xoryp_010100007680PF01527not used
383407.Xoryp_010100002115(PF06189)
383407.Xoryp_010100005820(PF16387)
383407.Xoryp_010100002255(PF06189)
383407.Xoryp_010100021010PF01527
383407.Xoryp_010100017625+
383407.Xoryp_010100020780+
383407.Xoryp_010100008400+
383407.Xoryp_010100008310PF01527
383407.Xoryp_010100014430+
383407.Xoryp_010100008135+
383407.Xoryp_010100014380(<)
383407.Xoryp_010100000095PF12762
383407.Xoryp_010100021385+not used
383407.Xoryp_010100007605PF01527
383407.Xoryp_010100019165+
383407.Xoryp_010100012575(+)(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100017390+
383407.Xoryp_010100016985+
383407.Xoryp_010100002005+
383407.Xoryp_010100007030(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100006490+
383407.Xoryp_010100006035(<)
383407.Xoryp_010100021480+
383407.Xoryp_010100021000PF05598
383407.Xoryp_010100016720PF01527
383407.Xoryp_010100020205(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100009095+
383407.Xoryp_010100000640PF05598
383407.Xoryp_010100008410(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100009520PF01527
383407.Xoryp_010100004895+
383407.Xoryp_010100003525(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100018080+
383407.Xoryp_010100020995+
383407.Xoryp_010100018225PF05598
383407.Xoryp_010100011705+
383407.Xoryp_010100014645+
383407.Xoryp_010100003650PF01527
383407.Xoryp_010100015605+
383407.Xoryp_010100019025PF05598
383407.Xoryp_010100000060(+)(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100011965+
383407.Xoryp_010100003015+
383407.Xoryp_010100016005+
383407.Xoryp_010100016000+
383407.Xoryp_010100013910(+)+
383407.Xoryp_010100013450(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100002305PF01609
383407.Xoryp_010100007150PF01609
383407.Xoryp_010100002275PF01527
383407.Xoryp_010100017350PF12762
383407.Xoryp_010100009790(+)+
383407.Xoryp_010100001275+
383407.Xoryp_010100006770PF01609
383407.Xoryp_010100010950+
383407.Xoryp_010100020965PF00665
383407.Xoryp_010100000250PF12762
383407.Xoryp_010100000655PF00665
383407.Xoryp_010100009405+
383407.Xoryp_010100000650PF01609
383407.Xoryp_010100004150+
383407.Xoryp_010100004935+
383407.Xoryp_010100016110+
383407.Xoryp_010100008110+
383407.Xoryp_010100014250PF01527
383407.Xoryp_010100008205+
383407.Xoryp_010100006470+
383407.Xoryp_010100014890PF01609
383407.Xoryp_010100023055+not used
383407.Xoryp_010100014075PF00665
383407.Xoryp_010100019360+
383407.Xoryp_010100016920PF12762
383407.Xoryp_010100002465PF01527
383407.Xoryp_010100013465(+)(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100019960PF00665
383407.Xoryp_010100002205PF05598
383407.Xoryp_010100019980PF13936
383407.Xoryp_010100021975+
383407.Xoryp_010100003910(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100016745+
383407.Xoryp_010100020515+
383407.Xoryp_010100002405+
383407.Xoryp_010100021590+
383407.Xoryp_010100017505PF01527
383407.Xoryp_010100002680+
383407.Xoryp_010100018215PF01609
383407.Xoryp_010100018375+
383407.Xoryp_010100010340PF01527
383407.Xoryp_010100006195+
383407.Xoryp_010100021685(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100007920+not used
383407.Xoryp_010100015445+
383407.Xoryp_010100003675+
383407.Xoryp_010100011580(>)
383407.Xoryp_010100012120+
383407.Xoryp_010100016930PF01527
383407.Xoryp_010100019005(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100012440+
383407.Xoryp_010100007720+
383407.Xoryp_010100013500(+)(PF04768)
383407.Xoryp_010100007170(>)
383407.Xoryp_010100021300+not used
383407.Xoryp_010100009805+
383407.Xoryp_010100010570+
383407.Xoryp_010100005030PF00665
383407.Xoryp_010100016750+
383407.Xoryp_010100002850PF12762
383407.Xoryp_010100021125+
383407.Xoryp_010100008355PF13683
383407.Xoryp_010100000345PF01609
383407.Xoryp_010100000340PF05598
383407.Xoryp_010100008175+
383407.Xoryp_010100003480+
383407.Xoryp_010100002640+
383407.Xoryp_010100016830PF01609not used
383407.Xoryp_010100019015PF01609
383407.Xoryp_010100005205+
383407.Xoryp_010100015830+
383407.Xoryp_010100007565(PF09994)
383407.Xoryp_010100006560PF01527
383407.Xoryp_010100017365PF01609
383407.Xoryp_010100016760PF00665
383407.Xoryp_010100002995PF01609
383407.Xoryp_010100021910+
383407.Xoryp_010100001400+
383407.Xoryp_010100013080+
383407.Xoryp_010100020080PF05598
383407.Xoryp_010100007840(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100001750+
383407.Xoryp_010100017410(PF07819)
383407.Xoryp_010100008340PF01527not used
383407.Xoryp_010100018310+
383407.Xoryp_010100000370(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100017775+
383407.Xoryp_010100023060PF01609
383407.Xoryp_010100001090+
383407.Xoryp_010100014190+
383407.Xoryp_010100022390PF01609
383407.Xoryp_010100011255PF01609
383407.Xoryp_010100015805(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100012070PF13683
383407.Xoryp_010100012075PF00665
383407.Xoryp_010100013420+
383407.Xoryp_010100016170(PF07819)
383407.Xoryp_010100016680(>)
383407.Xoryp_010100017950+
383407.Xoryp_010100006515+
383407.Xoryp_010100019800+
383407.Xoryp_010100016775+
383407.Xoryp_010100001505PF01609
383407.Xoryp_010100006420(PF09994)
383407.Xoryp_010100021725PF01527
383407.Xoryp_010100013090+
383407.Xoryp_010100021650(+)(mitochondrial); not used
383407.Xoryp_010100020095PF01527
383407.Xoryp_010100009750PF13683
383407.Xoryp_010100010685PF01527
383407.Xoryp_010100005420(<)
383407.Xoryp_010100009570+
383407.Xoryp_010100020255+
383407.Xoryp_010100008375PF12762
383407.Xoryp_010100005515PF01527
383407.Xoryp_010100012110(+)+
383407.Xoryp_010100022555+
383407.Xoryp_010100018815+
383407.Xoryp_010100011310+
383407.Xoryp_010100022385PF05598
383407.Xoryp_010100022380PF00665
383407.Xoryp_010100016330(PF02685)
383407.Xoryp_010100003045PF01527
383407.Xoryp_010100007125PF12762
383407.Xoryp_010100019135+
383407.Xoryp_010100012060PF01527
383407.Xoryp_010100016140PF12762
383407.Xoryp_010100017300+
383407.Xoryp_010100012870PF01609
383407.Xoryp_010100013260(PF01963)
383407.Xoryp_010100013265+
383407.Xoryp_010100001355+
383407.Xoryp_010100001350+
383407.Xoryp_010100008360PF01527
383407.Xoryp_010100002950+
383407.Xoryp_010100016420PF01609
383407.Xoryp_010100004070+
383407.Xoryp_010100023005PF01609
383407.Xoryp_010100023000PF01609
383407.Xoryp_010100007710PF01527not used
383407.Xoryp_010100003850+
383407.Xoryp_010100018420+
383407.Xoryp_010100022735+
383407.Xoryp_010100011490(+)(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100011275PF01609
383407.Xoryp_010100022905+
383407.Xoryp_010100016975(+)(PF07720)
383407.Xoryp_010100012095PF13683
383407.Xoryp_010100003140PF12762
383407.Xoryp_010100002095+
383407.Xoryp_010100007620PF01527not used
383407.Xoryp_010100019865PF05598
383407.Xoryp_010100017845PF05598
383407.Xoryp_010100019860PF01609
383407.Xoryp_010100021700PF01609
383407.Xoryp_010100021705PF00665
383407.Xoryp_010100009605+
383407.Xoryp_010100021895+
383407.Xoryp_010100020075PF12762
383407.Xoryp_010100002890PF01609
383407.Xoryp_010100006665PF13936
383407.Xoryp_010100021075(PF08212)
383407.Xoryp_010100009775PF12762
383407.Xoryp_010100018300+
383407.Xoryp_010100010315+
383407.Xoryp_010100021670PF01527
383407.Xoryp_010100000765PF12762
383407.Xoryp_010100018915+
383407.Xoryp_010100020100+
383407.Xoryp_010100000495+
383407.Xoryp_010100004710+
383407.Xoryp_010100008045PF00665
383407.Xoryp_010100023035+
383407.Xoryp_010100011465(+)plastid
383407.Xoryp_010100013315+
383407.Xoryp_010100008700+
383407.Xoryp_010100022340PF12762
383407.Xoryp_010100012265PF05598
383407.Xoryp_010100012260+
383407.Xoryp_010100019050(PF14307)
383407.Xoryp_010100012310+
383407.Xoryp_010100003160+
383407.Xoryp_010100015165+
383407.Xoryp_010100012795PF00665
383407.Xoryp_010100012790PF00665
383407.Xoryp_010100003155+
383407.Xoryp_010100016090+
383407.Xoryp_010100006525+
383407.Xoryp_010100019875PF01527
383407.Xoryp_010100009945+
383407.Xoryp_010100009985(>)
383407.Xoryp_010100006410(PF09994)
383407.Xoryp_010100008940(>)
383407.Xoryp_010100012210+
383407.Xoryp_010100020045(PF13332)
383407.Xoryp_010100005275(PF16387)
383407.Xoryp_010100014440(>)
383407.Xoryp_010100000255+
383407.Xoryp_010100000020+
383407.Xoryp_010100014225(+)(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100000440(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100000445PF01609
383407.Xoryp_010100015370+
383407.Xoryp_010100003545+
383407.Xoryp_010100003895(+)plastid
383407.Xoryp_010100014005+
383407.Xoryp_010100013515+
383407.Xoryp_010100019205PF01609
383407.Xoryp_010100015200(+)(mitochondrial)
383407.Xoryp_010100019515+
383407.Xoryp_010100015685(+)(ER)
383407.Xoryp_010100003570(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100011850(+)(plastid)
383407.Xoryp_010100014545(<)
383407.Xoryp_010100015190PF05598
383407.Xoryp_010100002145PF12762
383407.Xoryp_010100015995(PF02685)
383407.Xoryp_010100009955(+)not used
383407.Xoryp_010100002705(+)
383407.Xoryp_010100010240(+)
383407.Xoryp_010100009290(+)
383407.Xoryp_010100005860(+)
383407.Xoryp_010100014835(+)
383407.Xoryp_010100009130(+)
383407.Xoryp_010100008530(+)
383407.Xoryp_010100005005(+)
383407.Xoryp_010100005640(+)
383407.Xoryp_010100004285(+)
383407.Xoryp_010100012270(+)
383407.Xoryp_010100020835(+)
383407.Xoryp_010100022185(+)
383407.Xoryp_010100022745(+)
383407.Xoryp_010100018065(+)
383407.Xoryp_010100009615(+)
383407.Xoryp_010100012330(+)
383407.Xoryp_010100001935(+)
383407.Xoryp_010100009825(+)
383407.Xoryp_010100018585(+)
383407.Xoryp_010100021510(+)
383407.Xoryp_010100017470(+)
383407.Xoryp_010100009030(+)
383407.Xoryp_010100003410(+)
383407.Xoryp_010100004720(+)
383407.Xoryp_010100020225(+)
383407.Xoryp_010100020220(+)
383407.Xoryp_010100014970(+)
383407.Xoryp_010100004290(+)
383407.Xoryp_010100015040(+)
383407.Xoryp_010100011980(+)
383407.Xoryp_010100015350(+)
383407.Xoryp_010100011525(+)
383407.Xoryp_010100012345(+)
383407.Xoryp_010100018210(+)
383407.Xoryp_010100016515(+)not used
383407.Xoryp_010100018285(+)
383407.Xoryp_010100005800(+)
383407.Xoryp_010100004755(+)
383407.Xoryp_010100007270(+)
383407.Xoryp_010100007500(+)
383407.Xoryp_010100012190(+)
383407.Xoryp_010100006125(+)
383407.Xoryp_010100001680(+)not used
383407.Xoryp_010100021530(+)
383407.Xoryp_010100009690(+)
383407.Xoryp_010100009275(+)
383407.Xoryp_010100016095(+)
383407.Xoryp_010100004960(+)
383407.Xoryp_010100005760(+)
383407.Xoryp_010100014750(+)
383407.Xoryp_010100001850(+)
383407.Xoryp_010100018950(+)not used
383407.Xoryp_010100004560(+)
383407.Xoryp_010100011945(+)
383407.Xoryp_010100010795(+)
383407.Xoryp_010100002630(+)not used
383407.Xoryp_010100015215(+)
383407.Xoryp_010100006155(+)not used
383407.Xoryp_010100021165(+)
383407.Xoryp_010100010935(+)
383407.Xoryp_010100006450(+)
383407.Xoryp_010100005350(+)
383407.Xoryp_010100020945(+)
383407.Xoryp_010100004775(+)
383407.Xoryp_010100018380(+)
383407.Xoryp_010100022320(+)not used
383407.Xoryp_010100015670(+)
383407.Xoryp_010100012370(+)
383407.Xoryp_010100016870(+)
383407.Xoryp_010100016650(+)
383407.Xoryp_010100010160(+)
383407.Xoryp_010100004305(+)
383407.Xoryp_010100014425(+)
383407.Xoryp_010100022130(+)
383407.Xoryp_010100022860(+)
383407.Xoryp_010100015260(+)
383407.Xoryp_010100015265(+)
383407.Xoryp_010100018970(+)
383407.Xoryp_010100022465(+)
383407.Xoryp_010100015110(+)
383407.Xoryp_010100022660(+)
383407.Xoryp_010100013470(+)
383407.Xoryp_010100016165(+)not used
383407.Xoryp_010100009660(+)
383407.Xoryp_010100021560(+)
383407.Xoryp_010100010085(+)
383407.Xoryp_010100012805(+)
383407.Xoryp_010100004930(+)
383407.Xoryp_010100011565(+)
383407.Xoryp_010100018365(+)
383407.Xoryp_010100000325(+)
383407.Xoryp_010100014705(+)
383407.Xoryp_010100020980(+)
383407.Xoryp_010100023050(+)
383407.Xoryp_010100011590(+)
383407.Xoryp_010100003790(+)
383407.Xoryp_010100003795(+)
383407.Xoryp_010100006540(+)
383407.Xoryp_010100006785(+)
383407.Xoryp_010100021110(+)not used
383407.Xoryp_010100005940(+)
383407.Xoryp_010100005305(+)
383407.Xoryp_010100002795(+)
383407.Xoryp_010100004145(+)
383407.Xoryp_010100011685(+)
383407.Xoryp_010100004320(+)
383407.Xoryp_010100003495(+)
383407.Xoryp_010100019130(+)
383407.Xoryp_010100019000(+)
383407.Xoryp_010100007225(+)
383407.Xoryp_010100007795(+)
383407.Xoryp_010100018775(+)
383407.Xoryp_010100015825(+)
383407.Xoryp_010100010975(+)
383407.Xoryp_010100012820(+)
383407.Xoryp_010100021120(+)not used
383407.Xoryp_010100002690(+)not used
383407.Xoryp_010100010190(+)
383407.Xoryp_010100001745(+)
383407.Xoryp_010100018340(+)
383407.Xoryp_010100002820(+)
383407.Xoryp_010100012360(+)
383407.Xoryp_010100012365(+)
383407.Xoryp_010100014505(+)
383407.Xoryp_010100000925(+)not used
383407.Xoryp_010100019455(+)
383407.Xoryp_010100022655(+)not used
383407.Xoryp_010100007810(+)
383407.Xoryp_010100003285(+)
383407.Xoryp_010100000975(+)
383407.Xoryp_010100007585(+)
383407.Xoryp_010100021750(+)
383407.Xoryp_010100013160(+)
383407.Xoryp_010100020710(+)
383407.Xoryp_010100010325(+)
383407.Xoryp_010100011025(+)
383407.Xoryp_010100004055(+)
383407.Xoryp_010100005500(+)
383407.Xoryp_010100011455(+)
383407.Xoryp_010100003610(+)
383407.Xoryp_010100021245(+)not used
383407.Xoryp_010100015150(+)
383407.Xoryp_010100016910(+)
383407.Xoryp_010100016355(+)
383407.Xoryp_010100001960(+)
383407.Xoryp_010100019805(+)
383407.Xoryp_010100010515(+)
383407.Xoryp_010100017220(+)
383407.Xoryp_010100009330(+)
383407.Xoryp_010100020410(+)
383407.Xoryp_010100020890(+)not used
383407.Xoryp_010100019955(+)
383407.Xoryp_010100009375(+)
383407.Xoryp_010100023125(+)
383407.Xoryp_010100012115(+)
383407.Xoryp_010100014145(+)
383407.Xoryp_010100021820(+)
383407.Xoryp_010100002250(+)
383407.Xoryp_010100010785(+)
383407.Xoryp_010100020600(+)
383407.Xoryp_010100004815(+)
383407.Xoryp_010100014200(+)
383407.Xoryp_010100014335(+)
383407.Xoryp_010100018555(+)
383407.Xoryp_010100003385(+)
383407.Xoryp_010100010305(+)
383407.Xoryp_010100015170(+)
383407.Xoryp_010100018740(+)not used
383407.Xoryp_010100020270(+)
383407.Xoryp_010100008820(+)
383407.Xoryp_010100018140(+)
383407.Xoryp_010100022035(+)not used
383407.Xoryp_010100022030(+)
383407.Xoryp_010100015540(+)
383407.Xoryp_010100003930(+)
383407.Xoryp_010100004625(+)
383407.Xoryp_010100003150(+)
383407.Xoryp_010100007725(+)
383407.Xoryp_010100001880(+)
383407.Xoryp_010100008945(+)
383407.Xoryp_010100017145(+)
383407.Xoryp_010100021400(+)
383407.Xoryp_010100001710(+)
383407.Xoryp_010100008835(+)
383407.Xoryp_010100000565(+)
383407.Xoryp_010100018005(+)
383407.Xoryp_010100009230(+)not used
383407.Xoryp_010100008725(+)
383407.Xoryp_010100011475(+)
383407.Xoryp_010100019190(+)
383407.Xoryp_010100013045(+)
383407.Xoryp_010100010590(+)
383407.Xoryp_010100017415(+)not used
383407.Xoryp_010100012635(+)
383407.Xoryp_010100016085(+)
383407.Xoryp_010100022280(+)
383407.Xoryp_010100015090(+)
383407.Xoryp_010100013020(+)
383407.Xoryp_010100022570(+)
383407.Xoryp_010100011690(+)not used
383407.Xoryp_010100018645(+)
383407.Xoryp_010100020390(+)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: YES (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: YES (FDR = 12.5 %)
    Estimated copy number = 1.1 (11/10 KEGG proteins)
  • Functional Type IV secretion system: YES (FDR = 7.2 %)
    Estimated copy number = 0.0 (0/10 KEGG proteins)
  • Functional Type VI secretion system: YES (FDR = 7.7 %)
    Estimated copy number = 2.375 (19/8 KEGG proteins)

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================