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Effective results for Lachnospiraceae bacterium 3_1_57FAA_CT1 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 1670
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 123 eukaryotic-like domains, contained in 1670 proteins (384 high, 1286 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
658086.HMPREF0994_00723(PF16334) (PF16335) (PF17168) (PF08760)(ER)
658086.HMPREF0994_03740(PF02836) (PF00703) (PF02837)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_01025PF01074 PF09261 PF07748(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_04648(PF16355) (PF02836) (PF00703) (PF02837)
658086.HMPREF0994_04312(PF16355) (PF02836) (PF00703) (PF02837)
658086.HMPREF0994_05568(PF16355) (PF02836) (PF00703) (PF02837)
658086.HMPREF0994_05376(PF16355) (PF02836) (PF00703) (PF02837)
658086.HMPREF0994_00032(PF01751) (PF01131)ER; (ER)
658086.HMPREF0994_04589(PF16355) (PF02836) (PF00703) (PF02837)
658086.HMPREF0994_03511(PF02836) (PF00703)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_01247PF01074 PF09261 PF07748(ER)
658086.HMPREF0994_03804(PF16355) (PF02836) (PF00703) (PF02837)
658086.HMPREF0994_05570(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_05579PF01547ER
658086.HMPREF0994_00436(PF00664)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_00437(PF00664)(mitochondrial); mitochondrial
658086.HMPREF0994_00434(PF02743)ER
658086.HMPREF0994_06045(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_06492PF13416ER
658086.HMPREF0994_06493(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_01866(PF00072)ER
658086.HMPREF0994_01867PF13416ER
658086.HMPREF0994_06140(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_06141PF13416ER
658086.HMPREF0994_04234(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_04541PF01547mitochondrial
658086.HMPREF0994_04233(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_06740(PF12833) (PF00072)(ER)
658086.HMPREF0994_03015PF01554ER
658086.HMPREF0994_03016PF01554(ER)
658086.HMPREF0994_06799PF13416ER
658086.HMPREF0994_06794(PF02743)ER
658086.HMPREF0994_01776PF01547ER
658086.HMPREF0994_01774(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_01775(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_02501(PF02275)(ER); ER
658086.HMPREF0994_02503(PF14310) (PF00933) (PF01915)
658086.HMPREF0994_00231(PF06541)ER
658086.HMPREF0994_05552(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_05553(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_05551PF01547ER
658086.HMPREF0994_04938(PF01055) (PF16338) (PF17137)
658086.HMPREF0994_00909(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_00905PF13416ER
658086.HMPREF0994_06302(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_06303PF13416ER
658086.HMPREF0994_06301(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_05302PF01547ER
658086.HMPREF0994_04876(PF02743)ER
658086.HMPREF0994_00391(PF00664)ER
658086.HMPREF0994_01234(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_02584PF01547ER
658086.HMPREF0994_02585(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_02586(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_00216(PF02687)mitochondrial
658086.HMPREF0994_05006PF01547ER
658086.HMPREF0994_04912(PF02687)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_04661PF01554ER
658086.HMPREF0994_01905PF13416ER
658086.HMPREF0994_01904(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_01903(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_05488(PF02361)ER
658086.HMPREF0994_05044(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_00056(PF00239)(ER)
658086.HMPREF0994_06189(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_03905(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_01600(PF00664)(mitochondrial); mitochondrial
658086.HMPREF0994_02665(PF02687)mitochondrial
658086.HMPREF0994_02667(PF13353)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_04058(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_04278(PF02743)ER
658086.HMPREF0994_04271PF01547ER
658086.HMPREF0994_00980(PF00528)(ER); ER
658086.HMPREF0994_03550(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_03551(PF12833)mitochondrial
658086.HMPREF0994_03720PF01547ER
658086.HMPREF0994_01643(PF00381)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_02544PF13416ER
658086.HMPREF0994_02546(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_06640(PF14310) (PF00933) (PF01915)
658086.HMPREF0994_01010PF01547ER
658086.HMPREF0994_04640(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_00945PF13416ER
658086.HMPREF0994_06343PF13416ER
658086.HMPREF0994_06344(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_02979PF01554ER
658086.HMPREF0994_04942PF01547ER
658086.HMPREF0994_04940(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_04941(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_04252(PF07944)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_03702PF13416ER
658086.HMPREF0994_04235PF01547ER
658086.HMPREF0994_06085PF13416ER
658086.HMPREF0994_02701(PF02687)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_05432PF01554ER
658086.HMPREF0994_05286PF01554ER
658086.HMPREF0994_00707PF13416ER
658086.HMPREF0994_00708(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_01031(PF00528)ER; (ER)
658086.HMPREF0994_04628PF01547ER
658086.HMPREF0994_04627(PF02743)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_02910PF03432ER
658086.HMPREF0994_05495(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_05494(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_05491(PF00664)mitochondrial
658086.HMPREF0994_06294PF13416ER
658086.HMPREF0994_00049(PF00664)mitochondrial
658086.HMPREF0994_00048(PF00664)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_01938(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_04803(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_00385PF13416ER
658086.HMPREF0994_01932(PF01381)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_01933PF01554ER
658086.HMPREF0994_01937PF13416ER
658086.HMPREF0994_06293(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_03549(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_01591(PF02361)ER
658086.HMPREF0994_03097(PF00625)(ER)
658086.HMPREF0994_03764(PF01261)(ER)
658086.HMPREF0994_06061PF01554ER; (ER)
658086.HMPREF0994_02587(PF02743)mitochondrial
658086.HMPREF0994_05004(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_00185(PF02687)mitochondrial
658086.HMPREF0994_03954PF01547ER
658086.HMPREF0994_00067PF13787(ER)
658086.HMPREF0994_00066PF13787ER
658086.HMPREF0994_04036(PF16874) (PF16875) (PF02065)
658086.HMPREF0994_02672(PF00251)(ER)
658086.HMPREF0994_05928PF13416ER
658086.HMPREF0994_05927(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_05926(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_01416(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_01916(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_01917PF01547ER
658086.HMPREF0994_00069PF13787ER
658086.HMPREF0994_00068PF13787ER
658086.HMPREF0994_00312PF13416ER
658086.HMPREF0994_00311PF01074 PF07748 PF09261
658086.HMPREF0994_05745(PF01381)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_03568(PF03092)(ER)
658086.HMPREF0994_03561PF13416ER
658086.HMPREF0994_03560(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_04296(PF02743)(ER)
658086.HMPREF0994_03745(PF00528)ER; (ER)
658086.HMPREF0994_03743PF13416ER
658086.HMPREF0994_06174(PF02386)ER; (mitochondrial)
658086.HMPREF0994_04995(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_04994(PF00528)(ER); (mitochondrial)
658086.HMPREF0994_04996PF13416ER
658086.HMPREF0994_04195PF13416ER
658086.HMPREF0994_04194(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_04193(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_01079(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_03356PF01547ER
658086.HMPREF0994_03353(PF02743)mitochondrial
658086.HMPREF0994_03350(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_03351(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_02151PF01547ER
658086.HMPREF0994_03744(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_03500(PF00528)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_03504PF01547ER
658086.HMPREF0994_04414(PF12833)ER
658086.HMPREF0994_04415PF01547ER
658086.HMPREF0994_02018PF13416ER
658086.HMPREF0994_05786(PF12833)(ER)
658086.HMPREF0994_03528(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_03839PF13416ER
658086.HMPREF0994_03522(PF02836) (PF00703) (PF02837)
658086.HMPREF0994_03788PF13416ER
658086.HMPREF0994_02070PF01547ER
658086.HMPREF0994_02075(PF12833)ER
658086.HMPREF0994_06001PF13416(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_06000(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_01258PF13416ER
658086.HMPREF0994_00129(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_04155(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_04154PF13416ER
658086.HMPREF0994_04335PF01554ER
658086.HMPREF0994_03646PF01547ER
658086.HMPREF0994_03648(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_02448(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_02442(PF02687)ER
658086.HMPREF0994_02447(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_02446PF13416ER
658086.HMPREF0994_02995(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_01750(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_01751(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_01752PF13416ER
658086.HMPREF0994_04372PF01547ER
658086.HMPREF0994_00303(PF06445)mitochondrial
658086.HMPREF0994_04454(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_04455(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_04456PF01547ER
658086.HMPREF0994_06579(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_06578PF13416ER
658086.HMPREF0994_06573(PF14310) (PF00933) (PF01915)
658086.HMPREF0994_06683PF13416ER
658086.HMPREF0994_06682(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_06681(PF00528)mitochondrial
658086.HMPREF0994_05620PF01547ER
658086.HMPREF0994_05621(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_03482(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_03481(PF00528)ER; (ER)
658086.HMPREF0994_04864(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_04866PF13416ER
658086.HMPREF0994_00368(PF06541)ER
658086.HMPREF0994_04681(PF02743)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_03667(PF12833)ER
658086.HMPREF0994_01196(PF00528)(mitochondrial); mitochondrial
658086.HMPREF0994_01194PF01547ER
658086.HMPREF0994_01195(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_05438(PF02687)ER
658086.HMPREF0994_06240PF13416ER
658086.HMPREF0994_01548(PF03062)ER
658086.HMPREF0994_05846(PF00664)ER
658086.HMPREF0994_05840(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_04472(PF04616)ER
658086.HMPREF0994_04471(PF02836) (PF00703) (PF02837)
658086.HMPREF0994_04475(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_03299PF14526(mitochondrial); plastid
658086.HMPREF0994_06517(PF06445)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_05842PF01547ER
658086.HMPREF0994_01562(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_01560PF13416ER
658086.HMPREF0994_04113(PF00664)(ER)
658086.HMPREF0994_05608(PF00072)ER; (ER)
658086.HMPREF0994_05600(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_03465PF01554ER
658086.HMPREF0994_04802(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_00386(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_04800(PF12833)ER
658086.HMPREF0994_04805PF01547ER
658086.HMPREF0994_00383PF01074 PF07748 PF09261
658086.HMPREF0994_01726PF01547ER
658086.HMPREF0994_00465(PF02687)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_06580(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_06585PF13416ER
658086.HMPREF0994_06587(PF00528)mitochondrial; (mitochondrial)
658086.HMPREF0994_02406(PF02687)mitochondrial
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658086.HMPREF0994_01673(PF14310) (PF00933) (PF01915)
658086.HMPREF0994_02210(PF06541)ER
658086.HMPREF0994_06777(PF01055) (PF16338) (PF17137)
658086.HMPREF0994_01747(PF02743)ER; (ER)
658086.HMPREF0994_03829(PF12833)(mitochondrial)
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658086.HMPREF0994_03531PF13416ER
658086.HMPREF0994_04448(PF00528)(ER)
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658086.HMPREF0994_03791(PF00528)ER
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658086.HMPREF0994_05639(PF00528)(ER); ER
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658086.HMPREF0994_02103(PF00528)ER
658086.HMPREF0994_02104(PF00528)ER
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658086.HMPREF0994_05345(PF00528)ER; (ER)
658086.HMPREF0994_05344(PF00528)ER
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658086.HMPREF0994_06792(PF00072)(mitochondrial)
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658086.HMPREF0994_05554(PF12833) (PF00072)
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658086.HMPREF0994_05301(PF12833) (PF00072)
658086.HMPREF0994_04210(PF12833) PF01229
658086.HMPREF0994_04877(PF12833) (PF00072)
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658086.HMPREF0994_02523(PF01751) (PF01131)
658086.HMPREF0994_05007(PF12833) (PF00072)
658086.HMPREF0994_00964(PF12833)(mitochondrial)
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658086.HMPREF0994_01901(PF12833) (PF00072)
658086.HMPREF0994_04279(PF12833) (PF00072)
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658086.HMPREF0994_05929(PF12833) (PF00072)
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658086.HMPREF0994_02481PF14526 (PF12833)
658086.HMPREF0994_03503(PF12833) (PF00072)
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658086.HMPREF0994_05627PF14526 (PF12833)
658086.HMPREF0994_03484(PF12833) (PF00072)
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658086.HMPREF0994_01197(PF12833) (PF00072)
658086.HMPREF0994_01772(PF12833) (PF00072)
658086.HMPREF0994_01568PF01554(ER)
658086.HMPREF0994_04112(PF01381)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_03464PF14526 (PF12833)
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658086.HMPREF0994_00423(PF12833) (PF00072)
658086.HMPREF0994_00140(PF12833) (PF00072)
658086.HMPREF0994_00835(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_06588(PF12833) (PF00072)
658086.HMPREF0994_06237(PF01055) (PF13802)
658086.HMPREF0994_06232(PF02906) (PF02256)
658086.HMPREF0994_01714(PF00528)(ER)
658086.HMPREF0994_03855(PF00664)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_03854(PF00664)(ER)
658086.HMPREF0994_03144(PF00664)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_01204(PF00664)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_04392PF05592 PF08531
658086.HMPREF0994_02653(PF00528)(mitochondrial)
658086.HMPREF0994_03625(PF02901) (PF01228)not used
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658086.HMPREF0994_00461(PF12724)(mitochondrial)
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658086.HMPREF0994_05396(PF13347)(ER)
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658086.HMPREF0994_00878(PF00528)(mitochondrial)
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658086.HMPREF0994_00674(PF12833) (PF00072)
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658086.HMPREF0994_00897(PF12833) (PF00072)
658086.HMPREF0994_02014PF05592 PF08531
658086.HMPREF0994_04704(PF00528)(mitochondrial)
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658086.HMPREF0994_03192PF01554
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658086.HMPREF0994_05836(PF12833)
658086.HMPREF0994_05831(PF11175)
658086.HMPREF0994_05830(PF00251)
658086.HMPREF0994_05833(PF00528)
658086.HMPREF0994_05832(PF07944)
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658086.HMPREF0994_00510(PF12833)
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658086.HMPREF0994_04016(PF12833)
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658086.HMPREF0994_02644(PF04991)
658086.HMPREF0994_00044(PF12833)
658086.HMPREF0994_01843(PF00528)
658086.HMPREF0994_01844(PF00528)
658086.HMPREF0994_01939(PF00528)
658086.HMPREF0994_00645PF01547
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658086.HMPREF0994_05691(PF00528)
658086.HMPREF0994_06489(PF12773)
658086.HMPREF0994_06488(PF13240)
658086.HMPREF0994_06335PF01554
658086.HMPREF0994_04568(PF00528)
658086.HMPREF0994_03690(PF02687)
658086.HMPREF0994_03697(PF00251)
658086.HMPREF0994_03699(PF00251)
658086.HMPREF0994_03698(PF00251)
658086.HMPREF0994_05355(PF00072)
658086.HMPREF0994_01877(PF16326)
658086.HMPREF0994_02879(PF00072)
658086.HMPREF0994_06806(PF00072)
658086.HMPREF0994_06802(PF00239)
658086.HMPREF0994_00782(PF00528)
658086.HMPREF0994_00783PF01547
658086.HMPREF0994_00785PF05592
658086.HMPREF0994_00786PF05592
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Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================