Effective results for Mycobacterium rhodesiae NBB3 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 897
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 57 eukaryotic-like domains, contained in 897 proteins (25 high, 872 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
710685.MycrhN_0947(PF00441) (PF02770) (PF02771)(mitochondrial)
710685.MycrhN_3181(PF00848) (PF00355)(mitochondrial)
710685.MycrhN_6265(PF06974) (PF03007)(ER)
710685.MycrhN_0012(PF02405)(ER)
710685.MycrhN_3962(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_0010(PF02470)ER
710685.MycrhN_2717(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_2240(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_3595(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_2052(PF01083)ER
710685.MycrhN_3174(PF02470)ER
710685.MycrhN_0131(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_0150(PF00106)(mitochondrial)
710685.MycrhN_2266(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_2264(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_3023(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_2999(PF02470)(ER)
710685.MycrhN_0226(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_4390(PF13469)(mitochondrial)
710685.MycrhN_6331(PF00106)mitochondrial; (mitochondrial)
710685.MycrhN_2526(PF02470)ER
710685.MycrhN_0965(PF13810)ER
710685.MycrhN_1430(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_3002(PF02470)mitochondrial
710685.MycrhN_1153(PF02515)(ER)
710685.MycrhN_4865(PF00211)ER
710685.MycrhN_6311(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_3901(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_4261(PF13738)(mitochondrial); (plastid)
710685.MycrhN_3949(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_3578(PF02470)(ER)
710685.MycrhN_3579(PF02470)ER
710685.MycrhN_0089(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_0621(PF01083)mitochondrial
710685.MycrhN_0623(PF01083)ER
710685.MycrhN_0622(PF01083)ER
710685.MycrhN_3967(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_1473PF01113mitochondrial
710685.MycrhN_2601(PF02470)ER; (ER)
710685.MycrhN_2603(PF02470)(mitochondrial)
710685.MycrhN_2602(PF02470)ER
710685.MycrhN_2605(PF02470)ER
710685.MycrhN_2604(PF02470)ER
710685.MycrhN_2606(PF02470)ER
710685.MycrhN_4180(PF02405)(mitochondrial); (ER)
710685.MycrhN_4181(PF02405)(mitochondrial)
710685.MycrhN_4182(PF02470)ER
710685.MycrhN_4183(PF02470)ER
710685.MycrhN_4185(PF02470)mitochondrial; (ER)
710685.MycrhN_4186(PF02470)ER
710685.MycrhN_4187(PF02470)ER
710685.MycrhN_0847(PF07859)(mitochondrial)
710685.MycrhN_4704(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_4399(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_0393(PF00355)(ER)
710685.MycrhN_0640(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_1515(PF07859)(mitochondrial)
710685.MycrhN_1517(PF07859)mitochondrial
710685.MycrhN_1518(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_2092(PF00355)(ER)
710685.MycrhN_2431(PF10397)ER
710685.MycrhN_6189(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_6186(PF00378)mitochondrial
710685.MycrhN_5981(PF01083)ER
710685.MycrhN_2405(PF00106)(mitochondrial)
710685.MycrhN_4171(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_0113(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_4572(PF13738)(ER)
710685.MycrhN_4594(PF00211)ER
710685.MycrhN_3334(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_5149(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_1943(PF01083)(ER); ER
710685.MycrhN_0546(PF00106)mitochondrial
710685.MycrhN_2339(PF02470)ER
710685.MycrhN_2338(PF02470)ER
710685.MycrhN_2332(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_2337(PF02470)ER
710685.MycrhN_3360(PF02470)ER
710685.MycrhN_3170(PF02470)ER
710685.MycrhN_3172(PF02470)ER
710685.MycrhN_3173(PF02470)ER
710685.MycrhN_3362(PF02470)ER
710685.MycrhN_5437(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_2393(PF10397)ER
710685.MycrhN_4310(PF00296)ER
710685.MycrhN_0314(PF05711)mitochondrial
710685.MycrhN_1598(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_4723(PF01083)ER
710685.MycrhN_2599(PF02405)(mitochondrial); (plastid)
710685.MycrhN_5127(PF06742)ER
710685.MycrhN_6043(PF00355)ER
710685.MycrhN_3409(PF01083)ER
710685.MycrhN_3359(PF02470)ER
710685.MycrhN_4016(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_4014(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_2720(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_4034(PF02470)ER
710685.MycrhN_4035(PF02470)ER
710685.MycrhN_4036(PF02470)ER
710685.MycrhN_4037(PF02470)ER
710685.MycrhN_4033(PF02405)(mitochondrial)
710685.MycrhN_4038(PF02470)mitochondrial; (mitochondrial)
710685.MycrhN_4039(PF02470)ER
710685.MycrhN_6082(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_3890(PF00211)ER
710685.MycrhN_1610(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_3000(PF02470)ER
710685.MycrhN_3001(PF02470)(ER); (plastid)
710685.MycrhN_3004(PF02470)ER
710685.MycrhN_5877(PF07859)mitochondrial; (mitochondrial)
710685.MycrhN_4274(PF01083)ER
710685.MycrhN_3955(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_3581(PF02470)ER
710685.MycrhN_3583(PF02470)ER
710685.MycrhN_3582(PF02470)ER
710685.MycrhN_0238(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_1363(PF00067)(mitochondrial)
710685.MycrhN_0120(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_0124(PF00211)ER
710685.MycrhN_0211(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_0977(PF00106)(mitochondrial)
710685.MycrhN_4090(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_5329(PF06742)(ER)
710685.MycrhN_1147(PF02470)ER
710685.MycrhN_1146(PF02470)ER
710685.MycrhN_1145(PF02470)ER
710685.MycrhN_1144(PF02470)ER
710685.MycrhN_1149(PF02470)ER
710685.MycrhN_1148(PF02470)mitochondrial
710685.MycrhN_3972(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_3568(PF00211)ER
710685.MycrhN_1699(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_5832(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_4360(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_1484(PF01575)(ER)
710685.MycrhN_5162(PF00106)(mitochondrial)
710685.MycrhN_5169(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_1714(PF14832)(mitochondrial); (plastid)
710685.MycrhN_1524(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_1734(PF00106)(mitochondrial)
710685.MycrhN_6174(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_2411(PF00106)mitochondrial; (mitochondrial)
710685.MycrhN_4486(PF06271)mitochondrial
710685.MycrhN_4739(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_2088(PF13810)ER
710685.MycrhN_2475(PF04909)(ER)
710685.MycrhN_3331(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_4251(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_4253(PF00106)(mitochondrial)
710685.MycrhN_6208(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_5214(PF07859)ER
710685.MycrhN_2452(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_3145(PF00106)(mitochondrial)
710685.MycrhN_0369(PF00106)(mitochondrial)
710685.MycrhN_5423(PF14494)ER
710685.MycrhN_0147(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_5153(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_4651(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_5442PF03033(ER)
710685.MycrhN_5657(PF07859)mitochondrial; (mitochondrial)
710685.MycrhN_1933(PF01744)ER
710685.MycrhN_0551(PF07859)(mitochondrial)
710685.MycrhN_6223(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_6220(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_3169(PF02470)ER
710685.MycrhN_3168(PF02405)mitochondrial
710685.MycrhN_0431(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_6079(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_2367(PF01083)ER
710685.MycrhN_2583(PF04909)ER
710685.MycrhN_2588(PF00106)(mitochondrial)
710685.MycrhN_3364(PF02470)(mitochondrial)
710685.MycrhN_3361(PF02470)(mitochondrial)
710685.MycrhN_3363(PF02470)ER
710685.MycrhN_3980(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_1583(PF02470)mitochondrial
710685.MycrhN_1582(PF02470)ER
710685.MycrhN_1581(PF02470)ER
710685.MycrhN_1587(PF02405)(mitochondrial)
710685.MycrhN_1586(PF02470)(ER); ER
710685.MycrhN_1585(PF02470)ER
710685.MycrhN_1584(PF02470)ER
710685.MycrhN_2340(PF02470)ER
710685.MycrhN_2341(PF02470)mitochondrial
710685.MycrhN_2342(PF02470)ER
710685.MycrhN_5820(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_5485(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_2288(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_5019(PF13738)mitochondrial
710685.MycrhN_0495(PF02405)(mitochondrial)
710685.MycrhN_0725(PF01083)ER
710685.MycrhN_6097(PF00355)(mitochondrial)
710685.MycrhN_6090(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_6091(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_0009(PF02470)mitochondrial; (mitochondrial)
710685.MycrhN_0008(PF02470)mitochondrial
710685.MycrhN_0007(PF02470)ER
710685.MycrhN_0006(PF02470)ER
710685.MycrhN_1604(PF00441) (PF02770) (PF02771)
710685.MycrhN_3965(PF00378)(mitochondrial)
710685.MycrhN_0740(PF00441) (PF02770)
710685.MycrhN_4477(PF03007) (PF06974)
710685.MycrhN_0026(PF06974) (PF03007)
710685.MycrhN_0025(PF03007) (PF06974)
710685.MycrhN_1199(PF00106)plastid
710685.MycrhN_3171(PF02470)(ER)
710685.MycrhN_3942(PF06974) (PF03007)
710685.MycrhN_5436(PF00441) (PF02771)
710685.MycrhN_2263(PF00441) (PF02771)
710685.MycrhN_2262(PF00441) (PF02771)
710685.MycrhN_2998(PF02405)(mitochondrial)
710685.MycrhN_0225(PF06974) (PF03007)
710685.MycrhN_0227(PF00441) (PF02770)
710685.MycrhN_6333(PF00848) (PF00355)
710685.MycrhN_2713(PF00848) (PF00355)
710685.MycrhN_4068(PF08354) (PF01575)
710685.MycrhN_0946(PF00441)(ER)
710685.MycrhN_5908(PF03007) (PF06974)
710685.MycrhN_3577(PF02405)(mitochondrial)
710685.MycrhN_0085(PF00848) (PF00355)
710685.MycrhN_1474(PF00441) (PF02770)
710685.MycrhN_4184(PF02470)(ER)
710685.MycrhN_4764(PF00848) (PF00355)
710685.MycrhN_4705(PF00441) (PF02771)
710685.MycrhN_1516(PF03007) (PF06974)
710685.MycrhN_3272PF01113(mitochondrial)
710685.MycrhN_4170(PF00441) (PF02771)
710685.MycrhN_0112(PF00441) (PF02771)
710685.MycrhN_3259(PF00296)(mitochondrial)
710685.MycrhN_1574(PF00106)(mitochondrial)
710685.MycrhN_3434(PF00848) (PF00355)
710685.MycrhN_6211(PF00441) (PF02771)
710685.MycrhN_3159(PF00848) (PF00355)
710685.MycrhN_5275(PF06974) (PF03007)
710685.MycrhN_1885(PF00296)(ER)
710685.MycrhN_0545(PF13452) (PF01575)
710685.MycrhN_2331(PF00441) (PF02771)
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710685.MycrhN_6245(PF00067)
710685.MycrhN_6242(PF00106)
710685.MycrhN_6249(PF00106)
710685.MycrhN_2360(PF00067)
710685.MycrhN_2368(PF00106)
710685.MycrhN_2369(PF00067)
710685.MycrhN_5807(PF00296)
710685.MycrhN_3184(PF02515)
710685.MycrhN_3187(PF13452)
710685.MycrhN_1588(PF02405)
710685.MycrhN_6051(PF02515)
710685.MycrhN_6055(PF00106)
710685.MycrhN_6056(PF04909)
710685.MycrhN_6057(PF00106)
710685.MycrhN_2112(PF06271)
710685.MycrhN_0042(PF13577)
710685.MycrhN_6267(PF00890)
710685.MycrhN_6260(PF00106)
710685.MycrhN_5794(PF02515)
710685.MycrhN_5793(PF13622)
710685.MycrhN_5824(PF00067)
710685.MycrhN_5825(PF00067)
710685.MycrhN_5827(PF00106)
710685.MycrhN_3433(PF00378)
710685.MycrhN_5779(PF02899)
710685.MycrhN_1076(PF13469)
710685.MycrhN_1074(PF06742)
710685.MycrhN_5487(PF13622)
710685.MycrhN_0700(PF00067)
710685.MycrhN_0701(PF00067)
710685.MycrhN_5422(PF00106)
710685.MycrhN_5427(PF10604)
710685.MycrhN_2289(PF13452)
710685.MycrhN_2286(PF00067)
710685.MycrhN_2281(PF00106)
710685.MycrhN_2757(PF00211)
710685.MycrhN_3086(PF02899)
710685.MycrhN_3732(PF00296)
710685.MycrhN_3883(PF10604)
710685.MycrhN_3887(PF04909)
710685.MycrhN_0283(PF00296)
710685.MycrhN_5012(PF00296)
710685.MycrhN_5842PF01113
710685.MycrhN_5840(PF00067)
710685.MycrhN_5841PF01113
710685.MycrhN_3412(PF00106)
710685.MycrhN_5710(PF13469)
710685.MycrhN_4001(PF00067)
710685.MycrhN_4000(PF13459)
710685.MycrhN_4006(PF13459)
710685.MycrhN_1015(PF00106)
710685.MycrhN_1013(PF07859)
710685.MycrhN_0491(PF00890)
710685.MycrhN_0720(PF00106)
710685.MycrhN_6095(PF00067)
710685.MycrhN_6096PF01113
710685.MycrhN_3064(PF02353)
710685.MycrhN_3605(PF00106)
710685.MycrhN_3603(PF00378)
710685.MycrhN_0260(PF00378)
710685.MycrhN_0267(PF00067)
710685.MycrhN_5522(PF10604)
710685.MycrhN_5032(PF10604)
710685.MycrhN_4805(PF00890)
710685.MycrhN_3476(PF00355)
710685.MycrhN_3471PF05241
710685.MycrhN_3296(PF00296)
710685.MycrhN_5738(PF00067)
710685.MycrhN_5739(PF00296)
710685.MycrhN_0921(PF07859)
710685.MycrhN_0926(PF00296)
710685.MycrhN_0927(PF10604)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

==========================================================
EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================