Effective results for Clostridium clariflavum DSM 19732 (eggnog40)

Summary

Number of putative secreted proteins: 302
- Predicted by T4SEpre: 0
- Predicted by EffectiveELD: 45 eukaryotic-like domains, contained in 302 proteins (42 high, 260 medium Z-score)
Predicted protein secretion systems (parentheses indicate weak positive predictions lacking more than 50% of core proteins of a secretion system): None

Protein based results

Putative secreted proteins (weak evidence indicated by parentheses)

ProteinEffectiveT3EffectiveCCBDT4SEpreEffectiveELDPredotar
720554.Clocl_0282(PF06452) (PF00331) (PF00395)ER
720554.Clocl_1543(PF06452) (PF00331) (PF00395)ER
720554.Clocl_2441(PF03422) (PF00331) PF00457ER
720554.Clocl_2194(PF06452) (PF00331)ER
720554.Clocl_3028(PF06165) (PF17167)ER
720554.Clocl_3361(PF03422) PF00457ER
720554.Clocl_0417(PF12799) (PF00395)ER
720554.Clocl_0416(PF12799) (PF00395)ER
720554.Clocl_0419(PF12799) (PF00395)ER
720554.Clocl_0418(PF12799) (PF00395)ER
720554.Clocl_2944(PF00092) (PF00395)ER
720554.Clocl_2821(PF08757) (PF13287)(ER)
720554.Clocl_2588(PF00092) (PF03422)ER
720554.Clocl_1001(PF12799) PF16472ER
720554.Clocl_1480(PF03422) PF00457ER
720554.Clocl_1061(PF08757) (PF13287)ER
720554.Clocl_2083(PF00331) PF00457ER; (ER)
720554.Clocl_3103(PF03422) PF00457ER
720554.Clocl_2435(PF06452) (PF00331)ER
720554.Clocl_3917PF00759(mitochondrial); (ER)
720554.Clocl_0923(PF03422)ER
720554.Clocl_2745(PF00395)ER
720554.Clocl_2746(PF03422)ER
720554.Clocl_2294(PF00395)ER
720554.Clocl_0618(PF00395)ER
720554.Clocl_0066(PF13237)mitochondrial
720554.Clocl_0447(PF00092)ER
720554.Clocl_3029PF00759ER
720554.Clocl_3620(PF00665)(mitochondrial)
720554.Clocl_1410(PF00092)ER
720554.Clocl_1703(PF00665)(mitochondrial)
720554.Clocl_3638(PF00665)(mitochondrial)
720554.Clocl_1778(PF00395)ER
720554.Clocl_0048(PF00092)ER
720554.Clocl_0049(PF00092)ER
720554.Clocl_0078(PF00395)ER
720554.Clocl_4124(PF08757)ER
720554.Clocl_2976(PF13237)(ER); ER
720554.Clocl_2556(PF06541)ER
720554.Clocl_2553(PF00395)ER
720554.Clocl_0630(PF00395)ER
720554.Clocl_2836(PF00395)ER
720554.Clocl_0629(PF00395)ER
720554.Clocl_2139(PF00148)(mitochondrial)
720554.Clocl_1975PF00759ER
720554.Clocl_2225PF00759ER
720554.Clocl_1026(PF00395)ER
720554.Clocl_1567PF00759ER
720554.Clocl_0982(PF13237)mitochondrial
720554.Clocl_2108(PF00395)ER
720554.Clocl_3511(PF05598)ER
720554.Clocl_0371(PF00395)ER
720554.Clocl_3247(PF00395)ER
720554.Clocl_2447(PF03422)ER
720554.Clocl_0834PF07808(ER)
720554.Clocl_3253PF00759(mitochondrial)
720554.Clocl_3255PF00759ER
720554.Clocl_3098(PF06541)ER
720554.Clocl_4202(PF00395)ER
720554.Clocl_4203(PF00395)ER
720554.Clocl_0822(PF05598)ER
720554.Clocl_0355(PF12799)ER
720554.Clocl_1806PF00759(ER)
720554.Clocl_2912PF16472ER
720554.Clocl_3794(PF00872)mitochondrial
720554.Clocl_3303(PF00395)ER
720554.Clocl_2418(PF00092)(mitochondrial)
720554.Clocl_3334(PF00395)(ER)
720554.Clocl_1864PF00759ER
720554.Clocl_1044(PF00395)ER
720554.Clocl_3939(PF00395)ER
720554.Clocl_2400(PF00395)ER
720554.Clocl_3327(PF03422)ER
720554.Clocl_0303(PF00395)ER
720554.Clocl_0018(PF00395)ER
720554.Clocl_1056PF00759ER
720554.Clocl_2437(PF03422)ER
720554.Clocl_4161(PF03422)ER
720554.Clocl_3001PF00759ER
720554.Clocl_3006(PF00395)ER
720554.Clocl_2632(PF00665) PF13936
720554.Clocl_2742(PF00665) PF13936
720554.Clocl_2367(PF00665)(mitochondrial)
720554.Clocl_0844(PF00665)(mitochondrial)
720554.Clocl_0756(PF10371) (PF17147)
720554.Clocl_3038PF00759(mitochondrial)
720554.Clocl_3034(PF00665) PF13936
720554.Clocl_2816(PF04422) (PF04432)
720554.Clocl_0559(PF00665) PF13936
720554.Clocl_1280(PF00148)(mitochondrial)
720554.Clocl_1597(PF00665)(mitochondrial)
720554.Clocl_1626(PF00665) PF13936
720554.Clocl_0628(PF10371) (PF17147)
720554.Clocl_2824(PF04422) (PF04432)
720554.Clocl_2038(PF17032)(mitochondrial)
720554.Clocl_0509(PF00665) PF13936
720554.Clocl_2586(PF00665) PF13936
720554.Clocl_2735(PF14413) (PF04446)
720554.Clocl_3510(PF00665) PF13936
720554.Clocl_3081(PF00665) PF13936
720554.Clocl_1652(PF00665)(mitochondrial)
720554.Clocl_0353(PF00665)(mitochondrial)
720554.Clocl_0342(PF00665) PF13936
720554.Clocl_1793(PF00665)(mitochondrial)
720554.Clocl_2315(PF00665)(mitochondrial)
720554.Clocl_1478(PF00665) PF13936
720554.Clocl_1817(PF00665) PF13936
720554.Clocl_0802(PF00665) PF13936
720554.Clocl_0023(PF10371) (PF17147)
720554.Clocl_2355(PF00872)(ER)
720554.Clocl_0464(PF06165) (PF17167)
720554.Clocl_0465(PF06165) (PF17167)
720554.Clocl_1507(PF01527)
720554.Clocl_3779(PF00872)
720554.Clocl_1505(PF03050)
720554.Clocl_2689(PF01527)
720554.Clocl_2743(PF00872)
720554.Clocl_2744(PF02371)
720554.Clocl_2363(PF00395)
720554.Clocl_2366(PF01695)
720554.Clocl_0580PF03031
720554.Clocl_3164(PF01527)
720554.Clocl_3163(PF01695)
720554.Clocl_1183(PF00872)
720554.Clocl_3013(PF05598)
720554.Clocl_2622(PF02371)
720554.Clocl_0449(PF00872)
720554.Clocl_0112(PF01991)
720554.Clocl_4100(PF00092)
720554.Clocl_0280(PF04326)
720554.Clocl_3399(PF02371)
720554.Clocl_2996(PF02582)
720554.Clocl_2997(PF02582)
720554.Clocl_3809(PF00665)
720554.Clocl_3808(PF01527)
720554.Clocl_3806(PF02371)
720554.Clocl_2311(PF00872)
720554.Clocl_2317(PF01527)
720554.Clocl_1527(PF01527)
720554.Clocl_2614(PF01527)
720554.Clocl_1413(PF03050)
720554.Clocl_0941(PF00872)
720554.Clocl_1411(PF01527)
720554.Clocl_3364(PF02915)
720554.Clocl_1704(PF01695)
720554.Clocl_0057(PF01695)
720554.Clocl_2386(PF04423)
720554.Clocl_2962(PF00872)
720554.Clocl_2964(PF00872)
720554.Clocl_2967(PF05598)
720554.Clocl_3687(PF01527)
720554.Clocl_1572(PF06968)
720554.Clocl_2819(PF08757)
720554.Clocl_3817(PF05598)
720554.Clocl_2603(PF00872)
720554.Clocl_3637(PF01695)
720554.Clocl_3550(PF02371)
720554.Clocl_0045(PF00331)
720554.Clocl_1605(PF03050)
720554.Clocl_3044(PF00872)
720554.Clocl_1547(PF01527)
720554.Clocl_0896(PF01527)
720554.Clocl_2545(PF06968)
720554.Clocl_0708(PF12638)
720554.Clocl_0705(PF00665)
720554.Clocl_0704(PF01527)
720554.Clocl_1616(PF00872)
720554.Clocl_2235(PF00872)
720554.Clocl_3052(PF00872)
720554.Clocl_2949(PF00665)
720554.Clocl_2495(PF00872)
720554.Clocl_3831PF16760
720554.Clocl_1571(PF02371)
720554.Clocl_1570(PF06968)
720554.Clocl_1620(PF01527)
720554.Clocl_1281(PF00148)
720554.Clocl_3619(PF01695)
720554.Clocl_1598(PF01695)
720554.Clocl_1625(PF00665)
720554.Clocl_1624(PF01527)
720554.Clocl_2138(PF00148)
720554.Clocl_0151(PF12681)
720554.Clocl_0710(PF03422)
720554.Clocl_0714(PF00872)
720554.Clocl_3191(PF00665)
720554.Clocl_3190(PF01527)
720554.Clocl_2957(PF01695)
720554.Clocl_2959(PF02371)
720554.Clocl_2823(PF00872)
720554.Clocl_1566PF00759
720554.Clocl_2720(PF17147)
720554.Clocl_1293(PF00395)
720554.Clocl_1290(PF02371)
720554.Clocl_1587(PF00092)
720554.Clocl_1639(PF01527)
720554.Clocl_2103(PF02371)
720554.Clocl_4083PF03031
720554.Clocl_1961(PF02371)
720554.Clocl_0210(PF00665)
720554.Clocl_2850(PF02371)
720554.Clocl_3852(PF00872)
720554.Clocl_3513(PF02371)
720554.Clocl_3516(PF05598)
720554.Clocl_2117(PF02915)
720554.Clocl_3467(PF00665)
720554.Clocl_3466(PF01695)
720554.Clocl_0378(PF13237)
720554.Clocl_3240(PF06777)
720554.Clocl_0843(PF01695)
720554.Clocl_2931(PF04326)
720554.Clocl_4188(PF02371)
720554.Clocl_1343(PF17147)
720554.Clocl_1923(PF01527)
720554.Clocl_3647(PF01527)
720554.Clocl_3646(PF00665)
720554.Clocl_3505(PF05598)
720554.Clocl_2696(PF01527)
720554.Clocl_2695(PF03050)
720554.Clocl_2699(PF00872)
720554.Clocl_1653(PF01695)
720554.Clocl_0344(PF01527)
720554.Clocl_0343(PF00872)
720554.Clocl_0748(PF05598)
720554.Clocl_0745(PF05598)
720554.Clocl_0529(PF12799)
720554.Clocl_2301(PF00148)
720554.Clocl_0236(PF12681)
720554.Clocl_0232(PF04326)
720554.Clocl_2875PF16760
720554.Clocl_1335(PF02371)
720554.Clocl_1248(PF05598)
720554.Clocl_1241PF16472
720554.Clocl_0825(PF00872)
720554.Clocl_2684(PF01527)
720554.Clocl_2687(PF03050)
720554.Clocl_1794(PF01695)
720554.Clocl_0688(PF02371)
720554.Clocl_0354(PF01695)
720554.Clocl_0758(PF06968)
720554.Clocl_0537(PF01527)
720554.Clocl_0531(PF01527)
720554.Clocl_0538(PF00665)
720554.Clocl_2313(PF03050)
720554.Clocl_2314(PF01695)
720554.Clocl_2919(PF02915)
720554.Clocl_3790(PF05598)
720554.Clocl_3792(PF01695)
720554.Clocl_2302(PF00148)
720554.Clocl_1250(PF02915)
720554.Clocl_0814PF16472
720554.Clocl_2673(PF00665)
720554.Clocl_3412(PF05598)
720554.Clocl_3304(PF00395)
720554.Clocl_2320(PF02371)
720554.Clocl_3237(PF02371)
720554.Clocl_1922(PF00665)
720554.Clocl_2328(PF03050)
720554.Clocl_1070(PF05598)
720554.Clocl_3788(PF00148)
720554.Clocl_3789(PF00148)
720554.Clocl_2415(PF00872)
720554.Clocl_1267(PF00148)
720554.Clocl_1266(PF00148)
720554.Clocl_1265(PF00148)
720554.Clocl_1264(PF00148)
720554.Clocl_2084(PF05598)
720554.Clocl_2331(PF03050)
720554.Clocl_2333(PF01527)
720554.Clocl_2335(PF15588)
720554.Clocl_3204(PF01527)
720554.Clocl_3938(PF02915)
720554.Clocl_1306(PF13237)
720554.Clocl_3935(PF05598)
720554.Clocl_2401PF16760
720554.Clocl_1272(PF00872)
720554.Clocl_1273(PF01695)
720554.Clocl_2531(PF00872)
720554.Clocl_0870(PF05598)
720554.Clocl_3436(PF06541)
720554.Clocl_0903(PF01527)
720554.Clocl_0902(PF00665)
720554.Clocl_0305(PF00395)
720554.Clocl_2349(PF03050)
720554.Clocl_2341(PF01527)
720554.Clocl_0277(PF00665)
720554.Clocl_3921(PF04326)
720554.Clocl_2502(PF01527)
720554.Clocl_2501(PF00665)
720554.Clocl_2500(PF05598)
720554.Clocl_2648(PF02371)
720554.Clocl_0866(PF11468)
720554.Clocl_1513(PF02371)
720554.Clocl_1516(PF01527)
720554.Clocl_0914(PF02915)
720554.Clocl_1423PF16760
720554.Clocl_0310(PF05598)
720554.Clocl_0484(PF00872)
720554.Clocl_2351(PF01527)
720554.Clocl_3175(PF00872)
720554.Clocl_3174(PF01527)
720554.Clocl_3172(PF03050)
720554.Clocl_1191(PF17032)

Detailed merged results for each protein sequence

Individual results for each protein sequence

Genome based results

Summary

  • Gram negative: NO (FDR = 0.5 %)
  • Functional Type III secretion system: N.D.
  • Functional Type IV secretion system: NO (FDR = 7.2 %)
  • Functional Type VI secretion system: N.D.

Individual results for each secretion system

Parameters:

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EFFECTIVE_T3_OLD=selective
EFFECTIVE_T3_NEW=selective
PREDOTAR_ANIMAL_OR_PLANT=a
PROTEINS=INPUT PROTEINS
MODUS=genome
RUN_PREDOTAR=T
RUN_EFFECTIVE_T3=T
RUN_T4SEpre=0.5
RUN_EFFECTIVE_CCBD=T
RUN_EFFECTIVE_ELD=4
CheckM_COMPLETENESS=
RUN_EffectiveS346=T
GENOTYPE=COG Profile
EMAIL=
==========================================================